107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2938 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2938  transglutaminase domain-containing protein  100 
 
 		 373 aa  771    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.135746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2907  hypothetical protein  73.47 
 
 		 301 aa  444  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.850064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3586  transglutaminase domain-containing protein  50.14 
 
 		 363 aa  343  2e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0642  transglutaminase domain protein  52.94 
 
 		 383 aa  339  4e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0665  transglutaminase domain-containing protein  50.54 
 
 		 371 aa  338  9.999999999999999e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.713396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2861  transglutaminase domain-containing protein  47.44 
 
 		 366 aa  333  3e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.816183  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1343  transglutaminase domain-containing protein  45.57 
 
 		 369 aa  314  9.999999999999999e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2413  transglutaminase-like  41.42 
 
 		 369 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.329453  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0119  hypothetical protein  35.47 
 
 		 361 aa  236  5.0000000000000005e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2064  DNA-binding response regulator  36.63 
 
 		 359 aa  233  4.0000000000000004e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0699486  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2128  transglutaminase domain protein  36.7 
 
 		 362 aa  219  7e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2790  twin-arginine translocation pathway signal  35.04 
 
 		 379 aa  209  7e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2873  twin-arginine translocation pathway signal  35.04 
 
 		 379 aa  207  3e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2969  transglutaminase domain-containing protein  34.78 
 
 		 379 aa  205  9e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1221  transglutaminase-like  33.94 
 
 		 432 aa  204  1e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.416266 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1405  transglutaminase family protein  34.27 
 
 		 379 aa  204  3e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3074  transglutaminase domain-containing protein  33.76 
 
 		 380 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.926673  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3217  transglutaminase domain-containing protein  33.68 
 
 		 380 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.177861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1303  transglutaminase domain protein  33.76 
 
 		 380 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.403098  normal  0.79746 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3060  transglutaminase domain-containing protein  33.84 
 
 		 380 aa  193  3e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1086  transglutaminase-like  34.95 
 
 		 338 aa  162  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000506332  hitchhiker  0.0000050405 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2537  transglutaminase domain-containing protein  32.82 
 
 		 337 aa  154  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.243337  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2177  transglutaminase domain protein  33.93 
 
 		 336 aa  153  4e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2041  transglutaminase domain protein  30.82 
 
 		 336 aa  147  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04340  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  30.57 
 
 		 392 aa  141  1.9999999999999998e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550212 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0138  transglutaminase domain protein  24.31 
 
 		 320 aa  95.1  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.792413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11690  hypothetical protein  26.4 
 
 		 310 aa  79.7  0.00000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.556512  normal  0.379907 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2396  transglutaminase-like  23.35 
 
 		 328 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1137  transglutaminase domain-containing protein  27.54 
 
 		 507 aa  62.4  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0260  transglutaminase domain-containing protein  25.09 
 
 		 350 aa  60.5  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.20446  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0089  transglutaminase-like domain-containing protein  24.6 
 
 		 559 aa  60.1  0.00000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.890892  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1902  transglutaminase domain protein  24.64 
 
 		 631 aa  53.9  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.37601  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0562  transglutaminase domain protein  31.36 
 
 		 398 aa  53.5  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.567565  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1063  transglutaminase domain-containing protein  34.75 
 
 		 332 aa  52.8  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.155229 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0009  transglutaminase domain-containing protein  23.64 
 
 		 467 aa  52.8  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.906543  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1640  transglutaminase domain-containing protein  22.73 
 
 		 449 aa  52.8  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0165  transglutaminase domain protein  25.4 
 
 		 436 aa  52  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.665704  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2266  transglutaminase-like  42.03 
 
 		 300 aa  51.6  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1555  transglutaminase-like  29.2 
 
 		 500 aa  51.6  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.047572  normal  0.368889 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  30.63 
 
 		 1305 aa  50.8  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4110  transglutaminase domain-containing protein  38.82 
 
 		 1148 aa  50.4  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2917  hypothetical protein  32.53 
 
 		 527 aa  49.3  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000178577 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0930  transglutaminase domain-containing protein  22.95 
 
 		 730 aa  48.9  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0938  transglutaminase domain-containing protein  31.19 
 
 		 438 aa  48.9  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.522596  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0731  transglutaminase-like  30 
 
 		 281 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.149665  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0916  transglutaminase domain-containing protein  31.19 
 
 		 438 aa  48.1  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5097  hypothetical protein  38.82 
 
 		 297 aa  48.1  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1919  transglutaminase domain-containing protein  38.82 
 
 		 1145 aa  47.8  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4255  transglutaminase-like  37.65 
 
 		 1137 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.253349  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4111  transglutaminase domain-containing protein  37.65 
 
 		 1137 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.70474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3412  transglutaminase domain-containing protein  37.65 
 
 		 1137 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.298435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2519  transglutaminase-like  30.51 
 
 		 645 aa  47.4  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1933  transglutaminase-like  37.65 
 
 		 1142 aa  47.4  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.643054 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2855  transglutaminase domain protein  32.08 
 
 		 276 aa  47.4  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0224006  normal  0.37841 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4075  transglutaminase domain-containing protein  38.67 
 
 		 287 aa  47.4  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.399957 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1325  transglutaminase domain protein  28.77 
 
 		 680 aa  47.4  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00529222  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1778  transglutaminase domain-containing protein  41.43 
 
 		 1140 aa  47  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.527948  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2055  transglutaminase-like superfamily protein  41.43 
 
 		 1140 aa  47.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0770  transglutaminase domain-containing protein  41.43 
 
 		 1140 aa  47  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1063  transglutaminase domain-containing protein  41.43 
 
 		 1140 aa  47.4  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0769  transglutaminase domain-containing protein  41.43 
 
 		 1140 aa  47.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.106544  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0678  transglutaminase domain-containing protein  41.43 
 
 		 1140 aa  47.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2038  transglutaminase domain-containing protein  41.43 
 
 		 1140 aa  47.4  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.654776  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2638  transglutaminase-like  39.13 
 
 		 299 aa  46.6  0.0006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.947389  normal  0.655724 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00820  Transglutaminase-like Super Family Protein  38.1 
 
 		 313 aa  47  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15691  transglutaminase-like superfamily protein  28 
 
 		 281 aa  46.6  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.798972  normal  0.306347 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3879  transglutaminase domain protein  40 
 
 		 1158 aa  46.6  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3591  transglutaminase domain protein  39.71 
 
 		 291 aa  46.2  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1016  transglutaminase domain protein  30.83 
 
 		 293 aa  46.2  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3522  transglutaminase domain-containing protein  36.47 
 
 		 1149 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.585862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0171  transglutaminase domain-containing protein  32.47 
 
 		 340 aa  46.2  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1168  transglutaminase domain-containing protein  33.82 
 
 		 634 aa  45.8  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4005  transglutaminase domain-containing protein  36.47 
 
 		 1144 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.962784  normal  0.211891 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2315  Protein of unknown function DUF2126  44.29 
 
 		 1155 aa  45.8  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0702822  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1078  transglutaminase domain protein  27.87 
 
 		 862 aa  45.8  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1847  transglutaminase-like  39.51 
 
 		 300 aa  45.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.753598  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1056  transglutaminase-like protein  36.49 
 
 		 890 aa  45.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1574  transglutaminase domain-containing protein  21.17 
 
 		 453 aa  45.4  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000322367  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1621  transglutaminase domain-containing protein  39.29 
 
 		 1091 aa  45.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0187167 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2603  transglutaminase domain-containing protein  32.35 
 
 		 417 aa  45.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.767969 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4766  transglutaminase domain protein  39.13 
 
 		 290 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5370  transglutaminase domain protein  35.71 
 
 		 1081 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9053  hypothetical protein  35.71 
 
 		 273 aa  45.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2196  transglutaminase domain-containing protein  26.67 
 
 		 326 aa  44.3  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327421  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3343  transglutaminase domain protein  38.57 
 
 		 1108 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.171972 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3645  transglutaminase domain protein  38.57 
 
 		 1108 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.701627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2417  hypothetical protein  26.74 
 
 		 269 aa  43.9  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2558  transglutaminase-like  40 
 
 		 1090 aa  43.9  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.884999  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3281  transglutaminase-like domain-containing protein  35.71 
 
 		 302 aa  44.3  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.1823  normal  0.406519 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11441  transglutaminase-like superfamily protein  33.33 
 
 		 285 aa  43.9  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11451  transglutaminase-like superfamily protein  33.33 
 
 		 285 aa  43.9  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1051  transglutaminase-like  33.33 
 
 		 285 aa  43.9  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.647734  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2008  transglutaminase domain protein  35.29 
 
 		 290 aa  43.9  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.200502 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1034  transglutaminase-like  30 
 
 		 287 aa  43.5  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1555  transglutaminase domain-containing protein  32.86 
 
 		 290 aa  43.5  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1814  transglutaminase domain protein  35.29 
 
 		 290 aa  43.5  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.070269  hitchhiker  0.00579618 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0013  transglutaminase domain protein  24.68 
 
 		 376 aa  43.5  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.854186  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  36.62 
 
 		 316 aa  43.1  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0765  transglutaminase family protein  29.93 
 
 		 266 aa  43.5  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2254  transglutaminase domain protein  30 
 
 		 308 aa  43.1  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000580193 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>