More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4496 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4496  ferric uptake regulator family protein  100 
 
 		 161 aa  326  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0276  zinc uptake regulation protein, putative  82.91 
 
 		 160 aa  275  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5267  zinc uptake regulation protein, putative  82.91 
 
 		 160 aa  274  3e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0136  ferric uptake regulator family protein  79.5 
 
 		 161 aa  272  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0134  ferric uptake regulator family protein  80.12 
 
 		 161 aa  271  3e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.74995  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5109  ferric uptake regulator family protein  80.12 
 
 		 161 aa  270  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.143994 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72560  transcriptional regulator np20  81.53 
 
 		 167 aa  268  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.640017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6300  transcriptional regulator np20  81.53 
 
 		 167 aa  266  7e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0060  zinc uptake regulation protein, putative  79.87 
 
 		 160 aa  265  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00840  zinc uptake transcriptional regulator, Fur family  77.22 
 
 		 161 aa  254  3e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0119  FUR family transcriptional regulator  81.48 
 
 		 135 aa  236  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.723813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3775  ferric uptake regulator family protein  58.13 
 
 		 163 aa  187  5.999999999999999e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2424  ferric-uptake regulator  54.84 
 
 		 163 aa  176  1e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.688654  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0059  zinc uptake regulation protein, putative  52.98 
 
 		 162 aa  173  7e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0292  ferric uptake regulator family protein  52.05 
 
 		 174 aa  169  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0252498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3054  ferric uptake regulator, Fur family  51.33 
 
 		 157 aa  159  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1729  ferric uptake regulator family protein  49.36 
 
 		 164 aa  154  4e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1195  ferric uptake regulator family protein  51.02 
 
 		 162 aa  153  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.534314  normal  0.113542 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0766  ferric uptake regulator family protein  48.3 
 
 		 160 aa  149  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.885762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0313  ferric uptake regulator family protein  47.8 
 
 		 172 aa  147  4e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1959  putative ferric uptake regulator, Fur family  51.01 
 
 		 161 aa  142  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3152  ABC-type uncharacterized transport systems ATPase components-like protein  45.81 
 
 		 163 aa  140  8e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.459101 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7635  ferric uptake regulator family protein  48.03 
 
 		 163 aa  138  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.585134 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3615  ferric uptake regulator family protein  43.92 
 
 		 156 aa  138  3.9999999999999997e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0123339 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0489  ferric uptake regulator family protein  45.62 
 
 		 167 aa  136  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.574052  normal  0.122535 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0618  ferric uptake regulator family protein  44.74 
 
 		 163 aa  135  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0554  ferric uptake regulator, Fur family  45.33 
 
 		 153 aa  134  4e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.028923  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1911  ferric uptake regulator family protein  46.71 
 
 		 177 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0493  ferric-uptake regulator  41.57 
 
 		 177 aa  134  7.000000000000001e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.592412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0319  zinc uptake regulator ZUR  45.64 
 
 		 162 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1882  ferric uptake regulator family protein  49.64 
 
 		 149 aa  133  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.161499  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1210  ferric uptake regulator, Fur family  48.03 
 
 		 163 aa  133  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.427545  decreased coverage  0.00910774 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2432  ferric uptake regulator, Fur family  44.38 
 
 		 156 aa  132  3e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00932127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5586  ferric uptake regulator, Fur family  51.06 
 
 		 176 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0827067  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1703  putative zinc uptake regulation protein  50.96 
 
 		 165 aa  131  3.9999999999999996e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0261954  normal  0.0208783 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4139  ferric uptake regulator family protein  46.62 
 
 		 164 aa  131  3.9999999999999996e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0983423 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2322  transctiptional regulator, putative  44.22 
 
 		 340 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.559268  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1172  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein-like protein  48.32 
 
 		 197 aa  128  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.842565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0524  ferric uptake regulator family protein  44.67 
 
 		 162 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.912553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04819  transcriptional regulator, Fur family  46.67 
 
 		 168 aa  128  4.0000000000000003e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0975  putative ferric uptake regulator, Fur family  50.36 
 
 		 184 aa  127  6e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1045  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein-like protein  47.65 
 
 		 197 aa  127  9.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.806261  normal  0.0331742 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5385  ferric uptake regulator family protein  50.72 
 
 		 173 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0488  ferric uptake regulator family protein  44.22 
 
 		 163 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00616714  hitchhiker  0.00143129 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0518  ferric uptake regulator, Fur family  42.67 
 
 		 165 aa  124  6e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3569  Zinc-uptake regulator, Zur  46.71 
 
 		 167 aa  124  7e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2647  ferric uptake regulator family protein  47.14 
 
 		 153 aa  124  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2029  FUR family transcriptional regulator  40.12 
 
 		 169 aa  123  9e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.653891  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1951  ferric uptake regulator family protein  40.12 
 
 		 169 aa  123  9e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2515  ferric uptake regulator family protein  47.14 
 
 		 218 aa  123  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.432858 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3252  ferric uptake regulator family protein  46.71 
 
 		 163 aa  123  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0890854 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1888  ferric uptake regulator family protein  44.3 
 
 		 175 aa  121  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0469325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0867  FUR family transcriptional regulator  45 
 
 		 154 aa  120  6e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0593  ferric uptake regulator family protein  47.22 
 
 		 145 aa  120  7e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.687838  hitchhiker  0.00515693 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0329  transcriptional regulator, putative  44.29 
 
 		 174 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0816853  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1030  transcriptional regulator np20  44.29 
 
 		 266 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.468809  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2461  FUR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 251 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2623  ferric uptake regulator family protein  44.22 
 
 		 153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.195295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0812  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein-like protein  43.8 
 
 		 167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.139641 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0075  FUR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0184  ferric uptake regulator family protein  39.19 
 
 		 192 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0654518  hitchhiker  0.00635481 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5930  ferric uptake regulator family protein  44.22 
 
 		 153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1989  ferric uptake regulator family protein  44.22 
 
 		 153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0871  FUR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2599  ferric uptake regulator family protein  44.22 
 
 		 153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0627  FUR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0698  ferric uptake regulator family protein  45 
 
 		 186 aa  118  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.470229 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0691  transcriptional regulator, putative  44.29 
 
 		 216 aa  118  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002343  zinc uptake regulation protein ZUR  40.14 
 
 		 154 aa  116  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0247  ferric uptake regulator family protein  43.38 
 
 		 143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0255  ferric uptake regulator family protein  48 
 
 		 161 aa  114  6e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.127404 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3179  ferric uptake regulator, Fur family protein  41.3 
 
 		 149 aa  114  6.9999999999999995e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00010  zinc uptake regulation protein  40.14 
 
 		 161 aa  112  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0302  hypothetical protein  42.45 
 
 		 148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0285  hypothetical protein  42.45 
 
 		 148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0387  zinc uptake regulation protein  39.71 
 
 		 149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.183946  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0718  ferric uptake regulator  45.99 
 
 		 159 aa  111  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00407056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3182  ferric uptake regulator family protein  41.45 
 
 		 164 aa  112  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.346814  normal  0.115132 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1776  ferric uptake regulator family protein  41.38 
 
 		 188 aa  110  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000166629 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3128  ferric uptake regulator family protein  46.76 
 
 		 161 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4894  ferric uptake regulator, Fur family  41.67 
 
 		 190 aa  110  9e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.164543 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2336  ferric uptake regulator family protein  36.18 
 
 		 173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3248  transcriptional regulator, TrmB  46.83 
 
 		 164 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0836778  normal  0.597442 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2033  FUR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 171 aa  109  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.728485  normal  0.0108698 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2788  putative zinc uptake regulation protein  40.29 
 
 		 155 aa  108  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3523  zinc uptake transcriptional repressor  39.57 
 
 		 169 aa  108  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0734  zinc uptake transcriptional repressor  41.01 
 
 		 171 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.660786  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0516  zinc uptake transcriptional repressor  41.01 
 
 		 171 aa  107  8.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4457  zinc uptake transcriptional repressor  42.03 
 
 		 170 aa  106  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3769  zinc uptake transcriptional repressor  42.03 
 
 		 170 aa  105  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.352583  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3397  zinc uptake transcriptional repressor  38.69 
 
 		 169 aa  105  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1301  zinc uptake transcriptional repressor  42.03 
 
 		 172 aa  105  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3859  zinc uptake transcriptional repressor  42.03 
 
 		 170 aa  105  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4551  zinc uptake transcriptional repressor  42.75 
 
 		 171 aa  105  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03918  DNA-binding transcriptional repressor, Zn(II)-binding  42.75 
 
 		 171 aa  105  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3947  ferric uptake regulator, Fur family  42.75 
 
 		 171 aa  105  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03878  hypothetical protein  42.75 
 
 		 171 aa  105  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4286  zinc uptake transcriptional repressor  42.75 
 
 		 171 aa  105  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4508  zinc uptake transcriptional repressor  42.75 
 
 		 171 aa  105  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3982  zinc uptake transcriptional repressor  42.75 
 
 		 171 aa  105  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.224982 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>