More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4079 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0368  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53.34 
 
 		 601 aa  653    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.335716  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0370  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  80.91 
 
 		 592 aa  1001    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3554  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  65.77 
 
 		 589 aa  792    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.244117  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0473  putative acyl-CoA dehydrogenase oxidoreductase protein  55.37 
 
 		 595 aa  666    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.390432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2410  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  54.36 
 
 		 595 aa  658    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1177  acyl-CoA dehydrogenase family protein  51.34 
 
 		 598 aa  635    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.158836  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4476  acyl-CoA dehydrogenase family protein  60.1 
 
 		 602 aa  749    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2808  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  74.83 
 
 		 592 aa  930    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.566358  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0500  acyl-CoA dehydrogenase family protein  52.84 
 
 		 601 aa  641    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.837085  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0506  acyl-CoA dehydrogenase family protein  79.56 
 
 		 592 aa  1008    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06600  putative acyl-CoA dehydrogenase  53.56 
 
 		 601 aa  636    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0197  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  54.36 
 
 		 595 aa  658    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.908056  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4677  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  80.07 
 
 		 592 aa  1017    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0983724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4681  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  53.01 
 
 		 601 aa  642    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0964  putative acyl-CoA dehydrogenase  57.65 
 
 		 594 aa  668    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0695  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  54.19 
 
 		 595 aa  657    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.832914  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4081  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53.18 
 
 		 601 aa  659    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0446  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  55.37 
 
 		 595 aa  659    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0661  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  54.87 
 
 		 595 aa  655    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1741  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  55.95 
 
 		 594 aa  671    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0857  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  54.19 
 
 		 595 aa  657    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06620  putative acyl-CoA dehydrogenase  57.53 
 
 		 598 aa  673    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5166  Acyl-CoA dehydrogenase-like  85.81 
 
 		 592 aa  1059    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164353 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5167  Acyl-CoA dehydrogenase-like  56.02 
 
 		 598 aa  677    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783661 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5170  Acyl-CoA dehydrogenase-like  54.18 
 
 		 601 aa  652    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.131109  normal  0.317042 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0396  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  80.74 
 
 		 592 aa  999    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.352257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6048  Acyl-CoA dehydrogenase-like  55.03 
 
 		 599 aa  662    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06640  putative acyl-CoA dehydrogenase  89.53 
 
 		 592 aa  1111    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25210  acyl-CoA dehydrogenase  66.61 
 
 		 591 aa  818    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.885326  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1308  Acyl-CoA dehydrogenase  53.83 
 
 		 596 aa  647    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.135322  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0564  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  54.03 
 
 		 595 aa  657    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0680  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  54.19 
 
 		 595 aa  657    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4832  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  80.07 
 
 		 592 aa  996    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.946881 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2639  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  54.87 
 
 		 595 aa  659    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0601004  normal  0.257028 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0607  putative acyl-CoA dehydrogenase  57.19 
 
 		 598 aa  673    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2748  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  54.36 
 
 		 595 aa  658    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0363  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  55.54 
 
 		 595 aa  666    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.84094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2748  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  55.54 
 
 		 595 aa  672    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.139086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0385  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  54.87 
 
 		 595 aa  654    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.840786  normal  0.461604 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3132  acyl-CoA dehydrogenase family protein  60.45 
 
 		 589 aa  725    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0398  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53.01 
 
 		 601 aa  650    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.257074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2665  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  73.99 
 
 		 592 aa  927    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.755851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0348  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  55.37 
 
 		 595 aa  666    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3819  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  70.32 
 
 		 590 aa  863    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4038  putative acyl-CoA dehydrogenase oxidoreductase  55.2 
 
 		 595 aa  659    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.922091  normal  0.0585748 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4079  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  100 
 
 		 592 aa  1219    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1761  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  55.41 
 
 		 583 aa  635    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.170818  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0578  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  55.03 
 
 		 595 aa  659    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2749  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  68.37 
 
 		 596 aa  838    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.59666  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0394  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53.34 
 
 		 601 aa  653    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01173  acyl-CoA dehydrogenase  53.59 
 
 		 597 aa  635    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.520854  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1453  acyl-CoA dehydrogenase-like  57.84 
 
 		 594 aa  667    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0385  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  54.53 
 
 		 595 aa  656    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.13259 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2220  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  65.94 
 
 		 594 aa  790    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2721  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  55.54 
 
 		 595 aa  672    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.440911  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0400  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  81.59 
 
 		 592 aa  1012    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.672876 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09630  putative acyl-CoA dehydrogenase  73.02 
 
 		 593 aa  902    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.806665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2109  acyl-CoA dehydrogenase-like  55.54 
 
 		 595 aa  672    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2330  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  54.36 
 
 		 595 aa  658    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1754  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  54.61 
 
 		 594 aa  666    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0420795 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2368  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  65.94 
 
 		 589 aa  795    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0911  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  57.34 
 
 		 594 aa  670    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0609  putative acyl-CoA dehydrogenase  88.85 
 
 		 592 aa  1105    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.666513  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0899  putative acyl-CoA dehydrogenase  72.85 
 
 		 593 aa  872    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.183433  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4834  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  52.84 
 
 		 601 aa  645    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.649579 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3797  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  52.34 
 
 		 596 aa  632  1e-180  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.163707 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0007  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.17 
 
 		 596 aa  632  1e-180  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.419421  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0571  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  53.43 
 
 		 598 aa  631  1e-180  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0606  putative acyl-CoA dehydrogenase  53.39 
 
 		 601 aa  634  1e-180  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.941769  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0810  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  53.43 
 
 		 598 aa  629  1e-179  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0592  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53.1 
 
 		 598 aa  630  1e-179  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.559108 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1337  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53.17 
 
 		 601 aa  629  1e-179  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0962  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  52.68 
 
 		 595 aa  625  1e-178  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4445  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  52.68 
 
 		 626 aa  627  1e-178  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.744679  normal  0.0140421 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2777  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  53.59 
 
 		 596 aa  622  1e-177  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.932954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4032  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  52.76 
 
 		 596 aa  624  1e-177  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000200788 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0912  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.85 
 
 		 597 aa  618  1e-176  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1571  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.51 
 
 		 601 aa  621  1e-176  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000982993 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1984  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  55 
 
 		 585 aa  620  1e-176  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000742093  hitchhiker  0.00000000303591 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4089  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  52.17 
 
 		 601 aa  618  1e-176  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45920  acyl-CoA dehydrogenase  51.51 
 
 		 601 aa  618  1e-176  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1931  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  55 
 
 		 585 aa  620  1e-176  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00101819  hitchhiker  0.00000000203538 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2047  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  55 
 
 		 585 aa  620  1e-176  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000359523  hitchhiker  0.00243914 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2395  acyl-CoA dehydrogenase family protein  54.33 
 
 		 585 aa  617  1e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3957  acyl-CoA dehydrogenase-like  51.93 
 
 		 598 aa  617  1e-175  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.574903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2431  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  52.01 
 
 		 603 aa  616  1e-175  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0419  putative acyl-CoA dehydrogenase oxidoreductase protein  52.26 
 
 		 596 aa  617  1e-175  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.232992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2039  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.83 
 
 		 598 aa  615  1e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2115  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53.42 
 
 		 585 aa  615  1e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000107546  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1224  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  52.43 
 
 		 598 aa  613  9.999999999999999e-175  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2750  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.19 
 
 		 599 aa  615  9.999999999999999e-175  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000084613  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1961  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  54.41 
 
 		 583 aa  610  1e-173  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000164987  hitchhiker  0.00189084 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0965  putative acyl-CoA dehydrogenase  50.92 
 
 		 597 aa  611  1e-173  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.314138 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2081  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  52.76 
 
 		 586 aa  610  1e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3477  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.42 
 
 		 598 aa  608  1e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68510  putative acyl-CoA dehydrogenase  52.75 
 
 		 596 aa  610  1e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0032913  normal  0.251007 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0105  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  51.99 
 
 		 612 aa  610  1e-173  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2272  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53.57 
 
 		 585 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000131801  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0795  acyl-CoA dehydrogenase family protein  50.08 
 
 		 597 aa  605  9.999999999999999e-173  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2077  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53.57 
 
 		 585 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000861325  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>