More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_2012 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_2012  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 122 aa  251  3e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.631712 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1786  response regulator receiver protein  68.33 
 
 		 120 aa  176  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2765  response regulator receiver protein  72.57 
 
 		 119 aa  175  2e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.557597  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0776  response regulator receiver protein  43.64 
 
 		 127 aa  98.6  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000835167  normal  0.370558 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1291  response regulator  47.79 
 
 		 123 aa  95.1  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0418  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 123 aa  91.3  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.22885  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3210  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 124 aa  91.3  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1214  response regulator receiver protein  40.71 
 
 		 125 aa  85.9  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.678516  hitchhiker  0.000513941 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4110  response regulator receiver protein  41.07 
 
 		 126 aa  85.1  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2047  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 157 aa  81.3  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0637102 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2817  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 157 aa  81.3  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2841  response regulator receiver protein  38.94 
 
 		 145 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3346  response regulator/GGDEF domain-containing protein  38.05 
 
 		 417 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1018  response regulator receiver domain-containing protein  37.72 
 
 		 131 aa  77.4  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.100773  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1827  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 130 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.32093  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3514  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.21 
 
 		 427 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0320  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.62 
 
 		 838 aa  72.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0081  response regulator/GGDEF domain-containing protein  34.48 
 
 		 419 aa  70.9  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1969  sigma-54 dependent transcriptional regulator/response regulator  38.66 
 
 		 473 aa  70.1  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.440374  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2780  CheA signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 		 1736 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2852  response regulator receiver protein  40 
 
 		 268 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0204  two component transcriptional regulator  34.96 
 
 		 242 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00392261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3779  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  33.63 
 
 		 1180 aa  68.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274137 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2234  response regulator receiver domain-containing protein  35.71 
 
 		 130 aa  69.3  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3940  putative two-component response regulatory protein, response regulator receiver  35.34 
 
 		 155 aa  68.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.238381  normal  0.445341 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0142  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.9 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0714  CheA signal transduction histidine kinases  35.04 
 
 		 1020 aa  69.3  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1815  two component transcriptional regulator  31.09 
 
 		 232 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.101184  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2564  DNA-binding response regulator  32.77 
 
 		 231 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0589521  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2385  DNA-binding response regulator  32.77 
 
 		 231 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.534853  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2341  DNA-binding response regulator  32.77 
 
 		 231 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000166477  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2302  DNA-binding response regulator  32.77 
 
 		 231 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2561  DNA-binding response regulator  32.77 
 
 		 231 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.630654  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3131  response regulator receiver domain-containing protein  34.48 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.164774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2574  DNA-binding response regulator  32.77 
 
 		 231 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000040017 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3413  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35.29 
 
 		 453 aa  68.2  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0891  response regulator receiver domain-containing protein  33.91 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2617  DNA-binding response regulator  31.93 
 
 		 231 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.993672  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1017  two component transcriptional regulator  35.34 
 
 		 229 aa  67.8  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.957911  normal  0.735899 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0085  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.71 
 
 		 453 aa  67.8  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0271  winged helix family two component transcriptional regulator  32.77 
 
 		 239 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195642 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4546  two component transcriptional regulator  36.97 
 
 		 229 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.926448 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3475  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.9 
 
 		 453 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0804749 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0411  two component transcriptional regulator  38.26 
 
 		 230 aa  67  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4268  histidine kinase  36.04 
 
 		 575 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.396925 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0931  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 125 aa  67  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.229858 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0440  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.26 
 
 		 230 aa  66.6  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1035  two component transcriptional regulator  28.57 
 
 		 246 aa  67  0.00000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.324618 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2897  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35.59 
 
 		 473 aa  67  0.00000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.189439  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1386  DNA-binding response regulator ResD  33.62 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1359  response regulator  33.62 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0319788  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1487  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.05 
 
 		 232 aa  66.6  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.487145  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1358  response regulator  33.62 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1497  DNA-binding response regulator ResD  33.62 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.862661  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0092  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1193  diguanylate cyclase  33.06 
 
 		 415 aa  66.2  0.0000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1637  DNA-binding response regulator ResD  33.62 
 
 		 250 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0246031  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1601  DNA-binding response regulator ResD  33.62 
 
 		 250 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.953648  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2526  DNA-binding response regulator  31.93 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0287  two component transcriptional regulator  31.93 
 
 		 239 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1777  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 465 aa  65.9  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2332  response regulator receiver domain-containing protein  38.75 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1198  putative chemotaxis protein CheY-like protein  32.76 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3814  DNA-binding response regulator ResD  33.62 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.95849e-16 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0439  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.39 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1531  DNA-binding response regulator ResD  33.62 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0302  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.17 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1569  DNA-binding response regulator ResD  33.62 
 
 		 250 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45334e-32 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2796  DNA-binding response regulator  31.93 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.512352  hitchhiker  0.00000533196 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24530  Response regulator KdpE  36.59 
 
 		 232 aa  65.9  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0689152  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.25 
 
 		 714 aa  65.1  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.756709  normal  0.201817 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3940  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.04 
 
 		 467 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000637809  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4024  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.04 
 
 		 467 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.42797e-16 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5728  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 727 aa  65.5  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4159  two component transcriptional regulator  34.78 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.667277  normal  0.0359145 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5511  two component transcriptional regulator  32.48 
 
 		 236 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.567595 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1131  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.21 
 
 		 500 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.65 
 
 		 230 aa  64.7  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4753  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.25 
 
 		 630 aa  64.7  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1672  response regulator receiver domain-containing protein  33.62 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.494239  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1399  two component transcriptional regulator  32.76 
 
 		 238 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.129694  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1438  putative PAS/PAC sensor protein  32.48 
 
 		 393 aa  64.7  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.92182 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0467  response regulator receiver protein  34.15 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  33.04 
 
 		 232 aa  64.3  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2693  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.05 
 
 		 873 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0885  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 205 aa  64.7  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03265  hypothetical protein  33.33 
 
 		 403 aa  64.7  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2171  response regulator receiver protein  31.25 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0612  response regulator  33.93 
 
 		 120 aa  64.3  0.0000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.124392  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0436  response regulator receiver protein  35.45 
 
 		 370 aa  63.9  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3579  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.82 
 
 		 1432 aa  63.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.133683  normal  0.981214 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3577  response regulator receiver protein  33.63 
 
 		 393 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00266085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2732  osmolarity response regulator  31.58 
 
 		 243 aa  63.5  0.0000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.744063  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4419  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.45 
 
 		 654 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.386835 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2775  CheA signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 1125 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.74774  normal  0.345164 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3342  CheA signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 1137 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6615  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.76 
 
 		 660 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0224174  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1706  response regulator receiver modulated serine phosphatase  33.63 
 
 		 393 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000168842 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0452  response regulator receiver protein  29.75 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.17051  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1259  chemotaxis protein CheY  31.9 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.529849  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>