More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0378 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0378  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 686 aa  1392    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1024  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.87 
 
 		 682 aa  333  7.000000000000001e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000464711  normal  0.0237782 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0377  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.18 
 
 		 673 aa  256  7e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.882794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1098  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.75 
 
 		 633 aa  246  9.999999999999999e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0013981  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1539  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.24 
 
 		 1273 aa  174  5.999999999999999e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0942  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.54 
 
 		 1009 aa  155  2.9999999999999998e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.808539  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4607  histidine kinase  26.28 
 
 		 696 aa  150  7e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.998833  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2395  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.07 
 
 		 686 aa  114  8.000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000161382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5379  histidine kinase  25.15 
 
 		 698 aa  110  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5380  histidine kinase  24.55 
 
 		 689 aa  109  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.392025 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1562  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.28 
 
 		 680 aa  107  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.327156  normal  0.581936 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4983  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 		 535 aa  101  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0185741 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1256  histidine kinase  28.66 
 
 		 652 aa  101  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2527  histidine kinase  31.95 
 
 		 535 aa  99.8  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0731082 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1134  two-component sensor  22.76 
 
 		 795 aa  97.4  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0980947  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3783  Cache sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 708 aa  95.5  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5322  histidine kinase sensor  31.33 
 
 		 529 aa  94  8e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.968492 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1674  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.71 
 
 		 535 aa  94  9e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0433443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2942  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.71 
 
 		 535 aa  94  9e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1696  histidine kinase  28.35 
 
 		 506 aa  93.6  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0769699 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4741  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.24 
 
 		 474 aa  93.6  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.130107  normal  0.303178 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3766  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  22.75 
 
 		 802 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0676736 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1477  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.53 
 
 		 511 aa  91.7  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.635572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1372  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.53 
 
 		 510 aa  90.9  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.94557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3784  histidine kinase  29.27 
 
 		 496 aa  90.5  8e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.540279  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4714  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.68 
 
 		 528 aa  90.5  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22040  signal transduction histidine kinase  29.37 
 
 		 428 aa  90.1  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3215  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.11 
 
 		 477 aa  90.1  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1604  two component transcriptional regulator, AraC family  27.06 
 
 		 904 aa  89.7  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3925  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.35 
 
 		 532 aa  90.1  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.665584  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3940  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.35 
 
 		 532 aa  90.1  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115086 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0647  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  28.19 
 
 		 1741 aa  89.4  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.294056 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4783  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.71 
 
 		 404 aa  89.4  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.714313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4118  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.6 
 
 		 474 aa  89.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137791  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4248  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.6 
 
 		 474 aa  89.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.31722  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3999  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.35 
 
 		 517 aa  89.4  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2734  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.64 
 
 		 461 aa  88.6  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0124674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3696  ATPase domain-containing protein  30.61 
 
 		 469 aa  88.6  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0557  histidine kinase  30.51 
 
 		 480 aa  88.6  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2666  histidine kinase  28.99 
 
 		 586 aa  88.2  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0592074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.86 
 
 		 455 aa  88.6  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4142  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 		 463 aa  88.2  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.129438  normal  0.113394 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3269  histidine kinase  29.74 
 
 		 474 aa  88.2  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.86332  normal  0.63748 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2337  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.21 
 
 		 564 aa  87.8  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139979  normal  0.523633 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2677  sensor histidine kinase  28.1 
 
 		 459 aa  87.8  6e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2700  sensor histidine kinase  28.1 
 
 		 459 aa  87.8  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 469 aa  87.8  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3670  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 		 463 aa  87.8  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3275  sensor histidine kinase  28.1 
 
 		 459 aa  87.8  6e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1852  sensor histidine kinase  28.1 
 
 		 459 aa  87.8  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1550  ATP-binding region, ATPase-like protein  27.87 
 
 		 531 aa  87.4  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.221639  normal  0.141787 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.45 
 
 		 524 aa  87.4  8e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0254  sensor kinase protein  28.1 
 
 		 459 aa  87.4  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.94 
 
 		 463 aa  87.4  9e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0041  sensor histidine kinase  28.1 
 
 		 459 aa  87.4  9e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0041  sensor histidine kinase  28.1 
 
 		 459 aa  87.4  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0849  histidine kinase  32.02 
 
 		 422 aa  87  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2102  sensor histidine kinase  29.48 
 
 		 472 aa  86.7  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.801487  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.76 
 
 		 515 aa  87  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2343  histidine kinase  26.8 
 
 		 469 aa  86.3  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0839  histidine kinase  26.25 
 
 		 467 aa  85.9  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal  0.20827 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07900  signal transduction histidine kinase  26.91 
 
 		 529 aa  86.3  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1131  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.63 
 
 		 373 aa  85.9  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2675  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.05 
 
 		 708 aa  85.9  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877  normal  0.897929 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0220  two component transcriptional regulator, AraC family  25.89 
 
 		 934 aa  85.5  0.000000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.497584  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0050  histidine kinase  27.71 
 
 		 455 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2688  ATP-binding region, ATPase-like protein  27.14 
 
 		 432 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000622001  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5994  histidine kinase  28.38 
 
 		 526 aa  84.7  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0285375  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4229  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.05 
 
 		 383 aa  84.7  0.000000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.599633  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5380  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.86 
 
 		 625 aa  84.7  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00714338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0023  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.5 
 
 		 455 aa  84.7  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5544  histidine kinase  26.88 
 
 		 1306 aa  84.7  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0039  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.31 
 
 		 455 aa  84.3  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0031  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.31 
 
 		 455 aa  84.3  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0756  sensory box sensor histidine kinase/DNA-binding response regulator  29.58 
 
 		 993 aa  83.6  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2246  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.13 
 
 		 1084 aa  83.2  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.692403 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2537  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.29 
 
 		 602 aa  84  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5761  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.38 
 
 		 526 aa  83.6  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187142  normal  0.770795 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0806  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 		 587 aa  82.4  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2879  histidine kinase  32.14 
 
 		 553 aa  82.8  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1904  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.47 
 
 		 932 aa  82.8  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.636099  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4342  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 476 aa  82.4  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 		 1361 aa  82.4  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4835  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.89 
 
 		 662 aa  82  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.203793  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3806  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.46 
 
 		 533 aa  81.3  0.00000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.576691  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0583  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.2 
 
 		 816 aa  81.3  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.412959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5332  histidine kinase sensor  28.35 
 
 		 471 aa  81.6  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0668535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1893  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.69 
 
 		 644 aa  81.3  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02190  histidine kinase  25.51 
 
 		 340 aa  81.3  0.00000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0723  histidine kinase  30.26 
 
 		 406 aa  81.3  0.00000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2109  diguanylate cyclase  24.43 
 
 		 630 aa  81.3  0.00000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.843932  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3015  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.81 
 
 		 500 aa  80.9  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.71 
 
 		 504 aa  80.9  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1763  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.32 
 
 		 477 aa  80.9  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00600595 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2562  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.36 
 
 		 479 aa  80.9  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0122916 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0802  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 		 587 aa  80.9  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.773486  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0030  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.03 
 
 		 460 aa  80.9  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.292632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2094  histidine kinase  27.44 
 
 		 477 aa  80.9  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.854924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1580  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.28 
 
 		 478 aa  80.9  0.00000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0033  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.21 
 
 		 455 aa  80.9  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>