More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_4229 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_4229  peptidase M20  100 
 
 		 397 aa  826    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.543782  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5407  acetylornithine deacetylase  32.19 
 
 		 387 aa  162  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532883  normal  0.0112485 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2958  acetylornithine deacetylase  31.23 
 
 		 386 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0155668  normal  0.435017 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7082  acetylornithine deacetylase  32.23 
 
 		 387 aa  159  7e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0793838 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2350  acetylornithine deacetylase  31.6 
 
 		 386 aa  159  9e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6045  acetylornithine deacetylase  30.98 
 
 		 389 aa  158  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000725367  hitchhiker  0.0000370273 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2203  acetylornithine deacetylase  31.86 
 
 		 386 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2365  acetylornithine deacetylase  31.68 
 
 		 387 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.491069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3463  acetylornithine deacetylase  31.16 
 
 		 388 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0445  acetylornithine deacetylase  29.56 
 
 		 390 aa  155  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6994  acetylornithine deacetylase  32.17 
 
 		 387 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.277721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6421  acetylornithine deacetylase  31.6 
 
 		 390 aa  153  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.501182  normal  0.657059 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3571  acetylornithine deacetylase  31.14 
 
 		 391 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0995  acetylornithine deacetylase  30.02 
 
 		 419 aa  152  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.717305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5672  acetylornithine deacetylase  31.36 
 
 		 387 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16138  normal  0.344042 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0190  acetylornithine deacetylase  32.92 
 
 		 383 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00904916  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1877  acetylornithine deacetylase  29.98 
 
 		 404 aa  148  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1312  acetylornithine deacetylase  29.72 
 
 		 398 aa  147  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00749769  normal  0.95577 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  29.58 
 
 		 416 aa  146  5e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0407  acetylornithine deacetylase (ArgE)  30.45 
 
 		 392 aa  146  5e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1166  acetylornithine deacetylase  28.39 
 
 		 384 aa  144  3e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3269  acetylornithine deacetylase  29.11 
 
 		 382 aa  144  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376318 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2405  acetylornithine deacetylase  29.58 
 
 		 405 aa  143  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1262  acetylornithine deacetylase  29.58 
 
 		 389 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0937611  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1493  acetylornithine deacetylase  29.58 
 
 		 405 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0891925  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2514  acetylornithine deacetylase  29.58 
 
 		 405 aa  143  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.378081  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3317  acetylornithine deacetylase  29.58 
 
 		 389 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0116246  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2363  acetylornithine deacetylase  29.58 
 
 		 405 aa  143  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  30.05 
 
 		 412 aa  143  6e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2314  acetylornithine deacetylase  29.43 
 
 		 416 aa  142  8e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.306432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2086  acetylornithine deacetylase  29.83 
 
 		 405 aa  142  9e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.742076  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0439  acetylornithine deacetylase (ArgE)  32.08 
 
 		 391 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0401  acetylornithine deacetylase (ArgE)  32.84 
 
 		 391 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0369  acetylornithine deacetylase (ArgE)  32.84 
 
 		 391 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7452  acetylornithine deacetylase (ArgE)  31.41 
 
 		 397 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248803  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1990  acetylornithine deacetylase  30.47 
 
 		 586 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0817562  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1873  acetylornithine deacetylase  29.18 
 
 		 404 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal  0.014477 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71180  acetylornithine deacetylase  29.95 
 
 		 384 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6175  acetylornithine deacetylase  30.47 
 
 		 384 aa  141  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0150  acetylornithine deacetylase  29.61 
 
 		 385 aa  139  6e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5675  acetylornithine deacetylase  28.8 
 
 		 376 aa  139  6e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1172  acetylornithine deacetylase  28.64 
 
 		 384 aa  139  7e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2527  acetylornithine deacetylase  29.43 
 
 		 403 aa  139  7e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  hitchhiker  0.00344998 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0611  acetylornithine deacetylase (ArgE)  29.28 
 
 		 389 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.261056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1326  acetylornithine deacetylase  28.43 
 
 		 406 aa  138  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000659455  hitchhiker  0.00151978 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1359  acetylornithine deacetylase  28.15 
 
 		 404 aa  138  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1104  acetylornithine deacetylase  29.21 
 
 		 391 aa  138  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.681147 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6541  acetylornithine deacetylase (ArgE)  31.02 
 
 		 389 aa  137  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.660078 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1147  acetylornithine deacetylase  29.35 
 
 		 386 aa  137  5e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299531  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0268  acetylornithine deacetylase (ArgE)  29.85 
 
 		 398 aa  136  6.0000000000000005e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.305714  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1641  acetylornithine deacetylase  31.13 
 
 		 397 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0256  acetylornithine deacetylase  29.13 
 
 		 385 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5256  acetylornithine deacetylase  27.92 
 
 		 406 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000221107  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1956  acetylornithine deacetylase  28.19 
 
 		 411 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000205463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5605  acetylornithine deacetylase  30.63 
 
 		 374 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227908  normal  0.344951 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1969  acetylornithine deacetylase  27.75 
 
 		 406 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.850845  normal  0.0303442 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4508  acetylornithine deacetylase  29.56 
 
 		 374 aa  134  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3411  acetylornithine deacetylase  29.66 
 
 		 406 aa  133  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6134  acetylornithine deacetylase  27.5 
 
 		 406 aa  133  5e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1945  acetylornithine deacetylase  27.5 
 
 		 406 aa  133  5e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3458  acetylornithine deacetylase  30.35 
 
 		 385 aa  133  5e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1548  acetylornithine deacetylase  30.56 
 
 		 410 aa  133  6e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00376814 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1040  acetylornithine deacetylase (ArgE)  30.71 
 
 		 392 aa  133  6.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1860  acetylornithine deacetylase  28.21 
 
 		 406 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000219748  hitchhiker  0.0000660568 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2601  acetylornithine deacetylase  28.99 
 
 		 389 aa  132  6.999999999999999e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.265053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1544  acetylornithine deacetylase  29.74 
 
 		 374 aa  132  7.999999999999999e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.88458  normal  0.449301 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0769  acetylornithine deacetylase  29.9 
 
 		 386 aa  132  7.999999999999999e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.811427 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3291  acetylornithine deacetylase  28.43 
 
 		 383 aa  132  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.442946 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1933  acetylornithine deacetylase  27.85 
 
 		 406 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0058469  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1905  acetylornithine deacetylase  29.14 
 
 		 397 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119437  normal  0.233853 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1576  acetylornithine deacetylase  29.14 
 
 		 397 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.398543  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3650  acetylornithine deacetylase  29.22 
 
 		 380 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0499881  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0255  acetylornithine deacetylase  29.66 
 
 		 383 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1014  acetylornithine deacetylase (ArgE)  29.03 
 
 		 393 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00488739 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2044  acetylornithine deacetylase  27.9 
 
 		 392 aa  129  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.234319  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0717  acetylornithine deacetylase  28.07 
 
 		 388 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.150361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0239  acetylornithine deacetylase  28.97 
 
 		 428 aa  128  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4939  acetylornithine deacetylase  29.24 
 
 		 424 aa  127  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.965215 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1579  acetylornithine deacetylase  30.03 
 
 		 387 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.669783 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4976  acetylornithine deacetylase  28.99 
 
 		 376 aa  125  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0778383 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4782  acetylornithine deacetylase  28.47 
 
 		 381 aa  124  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142352 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1880  acetylornithine deacetylase  31.73 
 
 		 387 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0237  acetylornithine deacetylase  31.73 
 
 		 387 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2386  acetylornithine deacetylase (ArgE)  27.52 
 
 		 402 aa  123  5e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0201  acetylornithine deacetylase  27.46 
 
 		 386 aa  123  7e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000604653  normal  0.090573 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4090  acetylornithine deacetylase  28.71 
 
 		 387 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4425  acetylornithine deacetylase  29.37 
 
 		 375 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.779793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0126  acetylornithine deacetylase  28.71 
 
 		 389 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3899  acetylornithine deacetylase  28.71 
 
 		 387 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0226  acetylornithine deacetylase  29.47 
 
 		 383 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.417629  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0603  acetylornithine deacetylase (ArgE)  28.28 
 
 		 371 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0983  acetylornithine deacetylase  28.4 
 
 		 381 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0363  acetylornithine deacetylase  28.07 
 
 		 387 aa  121  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.65739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0595  acetylornithine deacetylase (ArgE)  27.85 
 
 		 371 aa  121  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4404  acetylornithine deacetylase  28.47 
 
 		 383 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.268381 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4061  acetylornithine deacetylase  28.68 
 
 		 383 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4317  acetylornithine deacetylase (ArgE)  28.09 
 
 		 388 aa  120  6e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.663035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2045  acetylornithine deacetylase  29.51 
 
 		 389 aa  119  7e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0364  acetylornithine deacetylase  29.3 
 
 		 388 aa  119  9e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  0.359815 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4277  acetylornithine deacetylase  28.97 
 
 		 383 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00886468  normal  0.333205 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>