164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2205 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2205  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  275  1e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2057  hypothetical protein  34.96 
 
 		 167 aa  73.2  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0787  hypothetical protein  31.62 
 
 		 650 aa  64.3  0.0000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.86498  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0023  protein of unknown function DUF255  28.57 
 
 		 643 aa  63.9  0.0000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2274  protein of unknown function DUF255  28.57 
 
 		 552 aa  63.5  0.0000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1204  hypothetical protein  31.07 
 
 		 661 aa  62.4  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.139299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0979  protein of unknown function DUF255  26.13 
 
 		 536 aa  60.8  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.571094  normal  0.95271 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1636  Thiol:disulfide interchange protein-like protein  25.86 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0805  Thioredoxin domain protein  22.06 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0588  hypothetical protein  29.73 
 
 		 692 aa  59.3  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.155052  normal  0.0633893 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2038  Thioredoxin domain protein  26.09 
 
 		 357 aa  58.5  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.571694  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0427  hypothetical protein  28.42 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00405131  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0491  protein of unknown function DUF255  29.55 
 
 		 549 aa  56.6  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2821  hypothetical protein  23.47 
 
 		 569 aa  54.7  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.642839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_7011  Thioredoxin domain protein  31.87 
 
 		 326 aa  54.7  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.817681  normal  0.78664 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2029  hypothetical protein  27.78 
 
 		 178 aa  53.9  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.213181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1581  protein of unknown function DUF255  30.97 
 
 		 544 aa  53.1  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.397722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1353  thioredoxin C-2  32 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.114748  normal  0.184208 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0806  protein of unknown function DUF255  23.97 
 
 		 274 aa  53.5  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.862822  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4066  Thioredoxin domain protein  27.55 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1444  hypothetical protein  23.01 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00624852  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3335  protein of unknown function DUF255  33.87 
 
 		 699 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000801567  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2384  hypothetical protein  27.27 
 
 		 705 aa  52.4  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.249366  normal  0.331232 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1072  protein of unknown function DUF255  36.21 
 
 		 712 aa  50.8  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0898725 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0217  protein of unknown function DUF255  23.01 
 
 		 517 aa  50.1  0.000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1653  hypothetical protein  26.96 
 
 		 449 aa  49.7  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1448  hypothetical protein  32.26 
 
 		 672 aa  50.1  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.411428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0131  thioredoxin domain-containing protein  21.82 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000222115  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7116  thioredoxin domain protein  28.12 
 
 		 161 aa  49.7  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1765  hypothetical protein  31.75 
 
 		 711 aa  48.9  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17317  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2382  Protein-disulfide reductase  29.89 
 
 		 581 aa  49.3  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  7.870920000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0215  protein of unknown function DUF255  31.67 
 
 		 673 aa  48.9  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1097  putative thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  27.84 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04029  disulphide-isomerase  33.01 
 
 		 529 aa  49.3  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1395  protein of unknown function DUF255  35 
 
 		 720 aa  48.5  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0132403  normal  0.87283 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0059  protein of unknown function DUF255  33.33 
 
 		 634 aa  48.9  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0512308  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1422  hypothetical protein  23.58 
 
 		 155 aa  48.1  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.501791  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1189  disulphide isomerase  28.57 
 
 		 154 aa  48.5  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.59478  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0277  protein of unknown function DUF255  26.04 
 
 		 531 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.137816  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2247  protein of unknown function DUF255  33.33 
 
 		 700 aa  47.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0808  conserved hypothetical lipoprotein  27.37 
 
 		 199 aa  47.8  0.00006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.799463  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1443  protein of unknown function DUF255  35 
 
 		 670 aa  47.4  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0545  thiol:disulfide interchange protein DsbD  26.42 
 
 		 616 aa  47  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.221768  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0701  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.42 
 
 		 616 aa  47  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0529075  hitchhiker  0.000000140832 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1697  hypothetical protein  31.67 
 
 		 669 aa  47  0.00008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0787  protein of unknown function DUF255  31.67 
 
 		 686 aa  47  0.00008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0291  hypothetical protein  24.07 
 
 		 680 aa  47  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0980  thiol:disulfide interchange protein DsbD (protein-disulfide reductase) (disulfide reductase)  32.26 
 
 		 574 aa  47  0.00008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1723  protein of unknown function DUF255  33.87 
 
 		 665 aa  47  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0822  Highly conserved protein containing a thioredoxin domain  23.14 
 
 		 590 aa  47  0.00009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0928635  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1646  hypothetical protein  26.09 
 
 		 449 aa  47  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11330  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  30 
 
 		 691 aa  46.6  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.234255  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  24.04 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0486  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  27.47 
 
 		 176 aa  46.6  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0998  hypothetical protein  30 
 
 		 705 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1460  hypothetical protein  33.87 
 
 		 720 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6051  thioredoxin domain protein  24.21 
 
 		 148 aa  47  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0119737  normal  0.502924 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0959  protein of unknown function DUF255  25.93 
 
 		 686 aa  46.6  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0863  hypothetical protein  30 
 
 		 693 aa  45.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.477469  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1398  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.17 
 
 		 396 aa  45.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.422628  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1140  protein of unknown function DUF255  33.33 
 
 		 737 aa  45.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2364  Thioredoxin domain protein  29.41 
 
 		 465 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2784  thioredoxin  30.53 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0698118 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0426  hypothetical protein  21.65 
 
 		 174 aa  45.4  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0272126  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0485  protein of unknown function DUF255  30 
 
 		 680 aa  45.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0471944  normal  0.48167 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2509  putative thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  32.91 
 
 		 165 aa  45.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114878 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0543  hypothetical protein  31.67 
 
 		 703 aa  44.7  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2613  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  27.03 
 
 		 421 aa  44.7  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4015  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.73 
 
 		 611 aa  44.3  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000287322 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0898  protein-disulfide reductase  27.37 
 
 		 589 aa  44.3  0.0006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2990  hypothetical protein  25.78 
 
 		 696 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.901065  hitchhiker  0.00330931 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0147  Thioredoxin domain  22.22 
 
 		 321 aa  44.3  0.0006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2595  hypothetical protein  31.58 
 
 		 681 aa  43.9  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2780  thioredoxin-related protein-like protein  23.08 
 
 		 391 aa  43.9  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0175859  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1630  hypothetical protein  30.65 
 
 		 751 aa  43.9  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2056  putative lipoprotein  30.69 
 
 		 522 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.740123  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1452  disulphide-isomerase  30.69 
 
 		 522 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0293  protein of unknown function DUF255  30.65 
 
 		 839 aa  43.5  0.0008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1082  putative lipoprotein  30.69 
 
 		 522 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.27834  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1364  putative lipoprotein  30.69 
 
 		 522 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.419734  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3231  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  30.69 
 
 		 522 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.804297  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2347  putative lipoprotein  30.69 
 
 		 522 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.74497  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0451  hypothetical protein  31.67 
 
 		 665 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0261  hypothetical protein  30 
 
 		 711 aa  43.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0545  hypothetical protein  27.42 
 
 		 711 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.322459 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4360  thiol:disulfide interchange protein  27.78 
 
 		 603 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0322676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2991  protein of unknown function DUF255  32.81 
 
 		 722 aa  43.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.784863  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2281  Thioredoxin domain  26.42 
 
 		 504 aa  43.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00640337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2540  hypothetical protein  31.67 
 
 		 685 aa  43.5  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.352542  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3559  thioredoxin  32.1 
 
 		 229 aa  42.7  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0150  thioredoxin domain-containing protein  30.3 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5099  thioredoxin domain-containing protein  30.95 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0027  protein of unknown function DUF255  31.67 
 
 		 671 aa  43.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000809407  normal  0.496902 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0823  protein of unknown function DUF255  28.69 
 
 		 635 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.302169  normal  0.0427489 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2855  protein of unknown function DUF255  28.44 
 
 		 562 aa  43.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.864769  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7155  thioredoxin  28.26 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3273  thioredoxin domain-containing protein  28.57 
 
 		 576 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0349373 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1171  hypothetical protein  28.33 
 
 		 660 aa  42.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0114  thioredoxin  28.89 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0631  thiol:disulfide interchange protein DsbD  28.18 
 
 		 567 aa  42.4  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>