More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2049 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2049  triosephosphate isomerase  100 
 
 		 257 aa  517  1e-146  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0151  Triose-phosphate isomerase  50 
 
 		 252 aa  247  1e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  51.2 
 
 		 249 aa  247  1e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  52.21 
 
 		 250 aa  246  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1885  triosephosphate isomerase  53.54 
 
 		 255 aa  244  8e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000744734  normal  0.534473 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0815  triosephosphate isomerase  50.4 
 
 		 253 aa  241  6e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000244559  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1333  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 		 252 aa  241  7.999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000254673  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  49.8 
 
 		 256 aa  241  7.999999999999999e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  52.19 
 
 		 253 aa  241  1e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2338  triosephosphate isomerase  50.99 
 
 		 251 aa  238  9e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000215074  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1948  triosephosphate isomerase  48.41 
 
 		 251 aa  237  1e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000540949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  48.61 
 
 		 254 aa  236  2e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  49 
 
 		 250 aa  237  2e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1628  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  51.42 
 
 		 654 aa  235  6e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00657054  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0875  triosephosphate isomerase  47.01 
 
 		 253 aa  235  6e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476682  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1966  triosephosphate isomerase  47.62 
 
 		 256 aa  234  7e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000820066  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2059  triosephosphate isomerase  47.39 
 
 		 251 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000160979  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  48.06 
 
 		 251 aa  233  3e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0908  triosephosphate isomerase  46.22 
 
 		 250 aa  233  3e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.842553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  47.79 
 
 		 250 aa  232  6e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  47.79 
 
 		 254 aa  231  7.000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1670  triosephosphate isomerase  49.21 
 
 		 251 aa  231  8.000000000000001e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.895843  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4715  triosephosphate isomerase  49.21 
 
 		 251 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.151784  hitchhiker  0.00871946 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1882  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 		 251 aa  229  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4581  triosephosphate isomerase  49.21 
 
 		 251 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.299699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1532  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 253 aa  229  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.743336  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  50.2 
 
 		 257 aa  229  4e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1464  triosephosphate isomerase  48.62 
 
 		 250 aa  229  4e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.11594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1618  triosephosphate isomerase  48.59 
 
 		 251 aa  228  5e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000123397  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1779  triosephosphate isomerase  47.64 
 
 		 251 aa  229  5e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.906694  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  47.39 
 
 		 250 aa  228  5e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4494  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 251 aa  228  6e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.321001  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4716  triosephosphate isomerase  48.81 
 
 		 251 aa  228  8e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3504  triosephosphate isomerase  47.6 
 
 		 250 aa  228  9e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.449389  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3935  triosephosphate isomerase  48 
 
 		 251 aa  228  1e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00010757  normal  0.914781 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1236  triosephosphate isomerase  48.58 
 
 		 250 aa  228  1e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000124491  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1777  triosephosphate isomerase  45.67 
 
 		 257 aa  228  1e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.464846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2544  triosephosphate isomerase  48.81 
 
 		 250 aa  227  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1852  triosephosphate isomerase  48.21 
 
 		 249 aa  227  1e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3135  triosephosphate isomerase  44.8 
 
 		 253 aa  226  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  47.54 
 
 		 255 aa  225  4e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  49.01 
 
 		 253 aa  226  4e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2566  triosephosphate isomerase  47.41 
 
 		 250 aa  225  5.0000000000000005e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.566971  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  45.63 
 
 		 655 aa  225  5.0000000000000005e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1562  triosephosphate isomerase  45.82 
 
 		 252 aa  225  5.0000000000000005e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000611161  hitchhiker  0.000778836 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62830  triosephosphate isomerase  49.21 
 
 		 251 aa  225  6e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0056  triosephosphate isomerase  46 
 
 		 253 aa  224  8e-58  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4184  triosephosphate isomerase  49.21 
 
 		 251 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0103  triosephosphate isomerase  49.21 
 
 		 256 aa  223  2e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0497  triosephosphate isomerase  46.83 
 
 		 252 aa  224  2e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13483  triosephosphate isomerase  43.2 
 
 		 250 aa  223  2e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.943567  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0169  triosephosphate isomerase  48.41 
 
 		 255 aa  223  3e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.543601  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0775  triosephosphate isomerase  48.81 
 
 		 251 aa  223  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000354266  normal  0.0202698 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0562  Triose-phosphate isomerase  45.82 
 
 		 254 aa  222  4e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.525761 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0239  Triose-phosphate isomerase  47.19 
 
 		 243 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1695  triosephosphate isomerase  47.04 
 
 		 251 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00252562  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0154  triosephosphate isomerase  48.41 
 
 		 255 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2335  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 		 253 aa  221  8e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.549293  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2423  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 		 253 aa  221  8e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00789739  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0717  triosephosphate isomerase  46.83 
 
 		 251 aa  221  9e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.119458 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0241  Triose-phosphate isomerase  47.62 
 
 		 243 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0499  Triose-phosphate isomerase  47.39 
 
 		 251 aa  219  3e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49960  triosephosphate isomerase  50.63 
 
 		 251 aa  219  3e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49910  triosephosphate isomerase  48.21 
 
 		 246 aa  219  3e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.258147  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45770  triosephosphate isomerase  50.63 
 
 		 251 aa  219  3e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01285  triosephosphate isomerase  47.95 
 
 		 251 aa  219  3e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0672  triosephosphate isomerase  44.75 
 
 		 253 aa  218  7e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.649878  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0100  triosephosphate isomerase  44.8 
 
 		 249 aa  218  1e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4297  triosephosphate isomerase  47.81 
 
 		 255 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5468  triosephosphate isomerase  48.02 
 
 		 251 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.50496  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4480  triosephosphate isomerase  47.81 
 
 		 255 aa  216  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4412  triosephosphate isomerase  47.81 
 
 		 255 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0292909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4327  triosephosphate isomerase  47.81 
 
 		 255 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4410  triosephosphate isomerase  47.81 
 
 		 255 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.909919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0767  triosephosphate isomerase  43.78 
 
 		 250 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0303972  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3277  triosephosphate isomerase  43.82 
 
 		 251 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0738  Triose-phosphate isomerase  50.73 
 
 		 243 aa  215  4e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000147069  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0096  triosephosphate isomerase  48.39 
 
 		 255 aa  215  4e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1089  triosephosphate isomerase  46.61 
 
 		 253 aa  216  4e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4118  triosephosphate isomerase  48.39 
 
 		 255 aa  215  4e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0095  triosephosphate isomerase  48.39 
 
 		 255 aa  215  4e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2960  triosephosphate isomerase  43.87 
 
 		 253 aa  215  5.9999999999999996e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_7124  predicted protein  45.31 
 
 		 245 aa  215  7e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000000122567  normal  0.0110543 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0959  triosephosphate isomerase  47.37 
 
 		 245 aa  215  7e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138148  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4717  Triose-phosphate isomerase  49.22 
 
 		 255 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000120949  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2064  triosephosphate isomerase  46.61 
 
 		 250 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1767  triosephosphate isomerase  46.83 
 
 		 249 aa  214  9.999999999999999e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.91306  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3808  triosephosphate isomerase  47.58 
 
 		 255 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.102844  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1591  triosephosphate isomerase  46.56 
 
 		 255 aa  213  1.9999999999999998e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_649  triose-phosphate isomerase  45.88 
 
 		 251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0706  triosephosphate isomerase  49.59 
 
 		 255 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.423457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1003  triosephosphate isomerase  45.42 
 
 		 260 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0343606  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1509  triosephosphate isomerase  45.6 
 
 		 248 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1299  triosephosphate isomerase  45.6 
 
 		 248 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.734425  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15810  Triose-phosphate isomerase  43.02 
 
 		 250 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.187277  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  46 
 
 		 249 aa  212  3.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15220  triosephosphate isomerase  47.39 
 
 		 258 aa  213  3.9999999999999995e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.005965  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1022  triosephosphate isomerase  45.02 
 
 		 260 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000178614  hitchhiker  0.000431545 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1410  Triose-phosphate isomerase  47.66 
 
 		 251 aa  212  4.9999999999999996e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1621  triosephosphate isomerase  47.39 
 
 		 255 aa  212  4.9999999999999996e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0703383  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>