More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0496 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0496  preprotein translocase, SecY subunit  100 
 
 		 456 aa  911    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.437531  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1931  preprotein translocase subunit SecY  46.09 
 
 		 445 aa  361  2e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.776856  normal  0.537809 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1953  preprotein translocase subunit SecY  44.99 
 
 		 447 aa  359  5e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2038  preprotein translocase subunit SecY  44.99 
 
 		 447 aa  358  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1926  preprotein translocase subunit SecY  44.99 
 
 		 447 aa  355  1e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228643  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0207  preprotein translocase, SecY subunit  42.89 
 
 		 500 aa  355  1e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1366  preprotein translocase subunit SecY  42.07 
 
 		 437 aa  351  1e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000833152  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1831  preprotein translocase subunit SecY  45.11 
 
 		 443 aa  350  2e-95  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.321149  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1575  preprotein translocase subunit SecY  43.42 
 
 		 435 aa  351  2e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  42.95 
 
 		 429 aa  347  3e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2276  preprotein translocase subunit SecY  45.33 
 
 		 441 aa  347  3e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000725785  hitchhiker  0.00410487 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0721  preprotein translocase subunit SecY  42.6 
 
 		 435 aa  346  6e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3985  preprotein translocase, SecY subunit  44.77 
 
 		 448 aa  345  1e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0309  preprotein translocase subunit SecY  43.72 
 
 		 443 aa  344  2e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0197098  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0953  preprotein translocase subunit SecY  41.96 
 
 		 435 aa  341  1e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0415377  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1086  preprotein translocase subunit SecY  42.48 
 
 		 435 aa  341  2e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.135642  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0646  preprotein translocase subunit SecY  41.76 
 
 		 435 aa  341  2e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00379524  hitchhiker  0.000000811889 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2044  preprotein translocase subunit SecY  44.89 
 
 		 441 aa  340  2.9999999999999998e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00113194  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3308  preprotein translocase subunit SecY  41.76 
 
 		 435 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000602472 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  41.72 
 
 		 435 aa  335  9e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3397  preprotein translocase, SecY subunit  41.7 
 
 		 439 aa  335  9e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0862  preprotein translocase, SecY subunit  44.07 
 
 		 438 aa  335  1e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.148817  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2440  preprotein translocase subunit SecY  42.57 
 
 		 420 aa  333  5e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0700  preprotein translocase subunit SecY  41.41 
 
 		 435 aa  333  5e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.418561  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1565  preprotein translocase subunit SecY  45.29 
 
 		 443 aa  332  8e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.112443  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0867  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  41.83 
 
 		 442 aa  332  8e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000152006  hitchhiker  0.00837403 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2209  preprotein translocase subunit SecY  43.15 
 
 		 443 aa  330  2e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000211329  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2403  preprotein translocase subunit SecY  43.5 
 
 		 443 aa  331  2e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0193161  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0235  preprotein translocase subunit SecY  45.32 
 
 		 419 aa  329  6e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00849669  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0886  preprotein translocase subunit SecY  43.81 
 
 		 418 aa  328  9e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.609907  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1384  preprotein translocase subunit SecY  44.27 
 
 		 443 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0201  preprotein translocase subunit SecY  43.27 
 
 		 443 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.124191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1246  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  42.04 
 
 		 463 aa  328  2.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.031052  hitchhiker  0.00314824 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1726  preprotein translocase, SecY subunit  41.94 
 
 		 435 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000716119  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2756  preprotein translocase, SecY subunit  42.73 
 
 		 443 aa  327  3e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.373135  normal  0.477854 
 
 
-
 
NC_004310  BR1213  preprotein translocase subunit SecY  43.33 
 
 		 446 aa  323  5e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1976  preprotein translocase subunit SecY  43.11 
 
 		 446 aa  323  5e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.923807  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0333  preprotein translocase, SecY subunit  42.95 
 
 		 445 aa  322  8e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0245  preprotein translocase subunit SecY  42.16 
 
 		 424 aa  321  1.9999999999999998e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.101058  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1176  preprotein translocase subunit SecY  43.11 
 
 		 446 aa  321  1.9999999999999998e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0379017  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5050  preprotein translocase subunit SecY  42.7 
 
 		 444 aa  320  3e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.478224  normal  0.981585 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  42.38 
 
 		 437 aa  319  5e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1856  preprotein translocase, SecY subunit  42.64 
 
 		 446 aa  318  7.999999999999999e-86  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0112849  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0442  preprotein translocase subunit SecY  42.98 
 
 		 429 aa  319  7.999999999999999e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  42.67 
 
 		 437 aa  318  1e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0425  preprotein translocase subunit SecY  42.19 
 
 		 437 aa  316  5e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.65116  normal  0.157207 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2668  preprotein translocase subunit SecY  42.86 
 
 		 447 aa  316  5e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0718  preprotein translocase subunit SecY  42.13 
 
 		 448 aa  316  5e-85  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.214912  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3428  preprotein translocase subunit SecY  42.83 
 
 		 443 aa  316  6e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452831  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3647  preprotein translocase subunit SecY  42.83 
 
 		 443 aa  315  9e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3686  preprotein translocase, SecY subunit  40.35 
 
 		 441 aa  315  9.999999999999999e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.000792509  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1918  preprotein translocase subunit SecY  41.83 
 
 		 446 aa  314  1.9999999999999998e-84  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0347  preprotein translocase, SecY subunit  42.76 
 
 		 443 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.742267  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1634  preprotein translocase subunit SecY  40.09 
 
 		 452 aa  314  1.9999999999999998e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0116955  normal  0.0410443 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1928  preprotein translocase, SecY subunit  42.95 
 
 		 445 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0517  preprotein translocase, SecY subunit  42.76 
 
 		 443 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  unclonable  0.0000000000266535 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2315  preprotein translocase subunit SecY  42.83 
 
 		 443 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.775008  normal  0.296135 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10746  preprotein translocase subunit SecY  40.44 
 
 		 441 aa  313  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.329828 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1926  preprotein translocase, SecY subunit  41.69 
 
 		 449 aa  312  6.999999999999999e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.796685  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1106  protein translocase subunit SecY/sec61 alpha  40.31 
 
 		 438 aa  312  7.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.105713 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2459  preprotein translocase, SecY subunit  43.05 
 
 		 447 aa  312  9e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4487  preprotein translocase, SecY subunit  41.06 
 
 		 436 aa  312  9e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2181  preprotein translocase, SecY subunit  43.05 
 
 		 447 aa  312  9e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.318083 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1074  preprotein translocase subunit SecY  40.31 
 
 		 441 aa  311  1e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3123  preprotein translocase, SecY subunit  41.98 
 
 		 436 aa  311  1e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1504  preprotein translocase subunit SecY  43.01 
 
 		 419 aa  311  1e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2626  preprotein translocase subunit SecY  42.26 
 
 		 442 aa  311  1e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.512513  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3164  preprotein translocase subunit SecY  42.83 
 
 		 443 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0194839  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0622  preprotein translocase, SecY subunit  38.72 
 
 		 444 aa  311  1e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.925436 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1046  preprotein translocase subunit SecY  40.31 
 
 		 441 aa  311  1e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303562  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3142  preprotein translocase subunit SecY  40.58 
 
 		 440 aa  311  1e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0487569  normal  0.382691 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3903  preprotein translocase subunit SecY  40.56 
 
 		 441 aa  311  1e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.340332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1062  preprotein translocase subunit SecY  40.31 
 
 		 441 aa  311  1e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160681  normal  0.323313 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0680  preprotein translocase subunit SecY  39.95 
 
 		 437 aa  311  2e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1635  preprotein translocase subunit SecY  42.7 
 
 		 447 aa  311  2e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2313  preprotein translocase subunit SecY  42.42 
 
 		 421 aa  311  2e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0367996  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0560  preprotein translocase, SecY subunit  41.12 
 
 		 442 aa  310  5e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29540  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  39.78 
 
 		 429 aa  310  5e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.498773  normal  0.844433 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1374  preprotein translocase, SecY subunit  41.35 
 
 		 444 aa  310  5e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285774  normal  0.105212 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0315  preprotein translocase subunit SecY  41.33 
 
 		 437 aa  309  5.9999999999999995e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0598799  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2135  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  39.29 
 
 		 428 aa  309  5.9999999999999995e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.233384  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4295  preprotein translocase subunit SecY  40.13 
 
 		 441 aa  309  6.999999999999999e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00554636 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1006  preprotein translocase subunit SecY  41.48 
 
 		 446 aa  309  8e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38875  hitchhiker  0.00669682 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2887  preprotein translocase, SecY subunit  41.31 
 
 		 441 aa  309  9e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0626195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5022  preprotein translocase subunit SecY  39.35 
 
 		 445 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0602  preprotein translocase subunit SecY  39.91 
 
 		 430 aa  308  1.0000000000000001e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.637505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0306  preprotein translocase subunit SecY  42.42 
 
 		 421 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0894763  normal  0.194972 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2144  preprotein translocase, SecY subunit  42.79 
 
 		 447 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3318  preprotein translocase subunit SecY  42.15 
 
 		 441 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150394  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4778  preprotein translocase subunit SecY  42.73 
 
 		 444 aa  307  2.0000000000000002e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000420552 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0305  preprotein translocase subunit SecY  41.09 
 
 		 453 aa  307  3e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.398461 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1863  preprotein translocase subunit SecY  42.28 
 
 		 446 aa  307  3e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4301  preprotein translocase, SecY subunit  38.5 
 
 		 432 aa  307  3e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2198  preprotein translocase, SecY subunit  41.46 
 
 		 448 aa  307  3e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0470035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0607  preprotein translocase, SecY subunit  40.41 
 
 		 429 aa  306  4.0000000000000004e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0598508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1374  preprotein translocase subunit SecY  36.87 
 
 		 431 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0289241  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1164  preprotein translocase, SecY subunit  41.96 
 
 		 431 aa  306  6e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0798437  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1352  preprotein translocase subunit SecY  42.76 
 
 		 446 aa  305  8.000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0023208  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00750  preprotein translocase subunit SecY  39.78 
 
 		 444 aa  305  2.0000000000000002e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2599  preprotein translocase subunit SecY  42.09 
 
 		 440 aa  304  2.0000000000000002e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0785292  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>