More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2857 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_2857  methyltransferase type 11  100 
 
 
279 aa  582  1.0000000000000001e-165  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.295819 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6747  Methyltransferase type 11  56.74 
 
 
286 aa  338  5.9999999999999996e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1677  methyltransferase type 11  52.9 
 
 
278 aa  308  8e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.138744  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27050  glycine/sarcosine N-methyltransferase  52.4 
 
 
559 aa  293  2e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.59391  normal  0.396997 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1180  methyltransferase type 11  51.45 
 
 
279 aa  288  5.0000000000000004e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2966  Methyltransferase type 11  51.85 
 
 
572 aa  275  6e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0650777 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2447  methyltransferase type 11  44.12 
 
 
277 aa  264  2e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17021  putative sarcosine-dimethylglycine methyltransferase  48.48 
 
 
282 aa  245  4.9999999999999997e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.650309 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0180  Methyltransferase type 11  46.98 
 
 
282 aa  242  3.9999999999999997e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0676  Methyltransferase type 11  35.02 
 
 
280 aa  177  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10531  methyltransferase  60.18 
 
 
116 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12280  predicted protein  31.79 
 
 
285 aa  124  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0372336  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16375  predicted protein  34.07 
 
 
279 aa  121  9.999999999999999e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00657234  normal  0.224356 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  33.49 
 
 
271 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  36.25 
 
 
282 aa  96.3  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48704  predicted protein  25.81 
 
 
315 aa  90.9  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  34.78 
 
 
278 aa  89  9e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2451  Methyltransferase type 11  30.49 
 
 
267 aa  87.8  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.361549  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5778  Methyltransferase type 11  30.94 
 
 
276 aa  87.8  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  29.81 
 
 
284 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0604  methyltransferase type 11  28.1 
 
 
276 aa  85.1  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  28.83 
 
 
382 aa  84  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30710  predicted protein  37.25 
 
 
365 aa  83.6  0.000000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.499516 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5201  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.02 
 
 
283 aa  83.6  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0809  Methyltransferase type 11  28.98 
 
 
264 aa  83.2  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266836  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  34.75 
 
 
279 aa  83.2  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1456  Methyltransferase type 11  27.59 
 
 
284 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.131831  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1597  SAM-binding motif-containing protein  34.71 
 
 
311 aa  81.6  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  29.13 
 
 
261 aa  80.9  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40586  predicted protein  29.41 
 
 
342 aa  80.5  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2797  Methyltransferase type 11  38 
 
 
286 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.614979 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16961  SAM-binding motif-containing protein  32.95 
 
 
310 aa  80.1  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.65 
 
 
280 aa  79.7  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2147  methyltransferase type 11  25 
 
 
283 aa  79.7  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17081  SAM-binding motif-containing protein  35.47 
 
 
311 aa  79.7  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07146  sterol 24-c-methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03630)  34.75 
 
 
377 aa  78.2  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690937  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  33.11 
 
 
274 aa  78.2  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  32.14 
 
 
287 aa  78.2  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3884  methyltransferase type 11  29.71 
 
 
293 aa  78.2  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658922  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_003296  RS04686  methyltransferase protein  35.45 
 
 
274 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10824  predicted protein  33.13 
 
 
304 aa  77.4  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0540311  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  29.35 
 
 
283 aa  76.6  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2808  methyltransferase type 11  26.56 
 
 
275 aa  76.6  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80971  predicted protein  31.94 
 
 
377 aa  76.3  0.0000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  29.89 
 
 
283 aa  76.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16851  SAM-binding motif-containing protein  33.17 
 
 
311 aa  75.9  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03100  sterol 24-C-methyltransferase, putative  32.9 
 
 
343 aa  75.1  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0399554  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1071  UbiE/COQ5 family methyltransferase  34.24 
 
 
310 aa  74.7  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.29583  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3261  SAM-dependent methyltransferase  28.33 
 
 
287 aa  75.1  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234445  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33530  predicted protein  31.87 
 
 
392 aa  75.1  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0317  sterol-C-methyltransferase  32.4 
 
 
304 aa  74.3  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.136369  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4594  Methyltransferase type 11  27.23 
 
 
271 aa  73.2  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0172  methyltransferase type 11  36.13 
 
 
275 aa  72  0.000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0083  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27.75 
 
 
305 aa  72  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19461  SAM-binding motif-containing protein  33.15 
 
 
310 aa  71.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4893  methyltransferase type 11  30.77 
 
 
274 aa  71.2  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.242267 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3898  predicted protein  29.59 
 
 
306 aa  71.2  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42420  predicted protein  31.51 
 
 
317 aa  70.1  0.00000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.679564 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3824  Methyltransferase type 11  33.73 
 
 
328 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  27.11 
 
 
286 aa  68.9  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2025  sterol-C-methyltransferase  34.09 
 
 
310 aa  68.9  0.00000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2958  hypothetical protein  28.47 
 
 
278 aa  68.9  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3422  arsenite S-adenosylmethyltransferase  39.37 
 
 
271 aa  68.9  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.352558  normal  0.929536 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1078  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28 
 
 
330 aa  68.2  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20470  tocopherol o-methyltransferase  26.58 
 
 
318 aa  67.4  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4080  arsenite S-adenosylmethyltransferase  33.14 
 
 
283 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214239  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0596  delta(24)-sterol C-methyltransferase  33.33 
 
 
310 aa  67.4  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000138458  normal  0.70463 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12966  methyltransferase  39.42 
 
 
270 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0391  Methyltransferase type 11  31.29 
 
 
207 aa  67  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0437563  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0668  Methyltransferase type 11  34.58 
 
 
288 aa  67  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2596  methyltransferase type 11  33.94 
 
 
271 aa  67  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340316  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2173  methyltransferase type 11  30.05 
 
 
328 aa  66.2  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0889  methyltransferase type 11  31.25 
 
 
249 aa  66.2  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0190942  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0521  Methyltransferase type 11  34.95 
 
 
1012 aa  65.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.200159  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30580  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  35.92 
 
 
272 aa  65.5  0.0000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16281  SAM-binding motif-containing protein  33.9 
 
 
309 aa  65.1  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2794  methyltransferase type 11  34.35 
 
 
271 aa  64.7  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148231  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4388  methyltransferase type 11  26.6 
 
 
267 aa  65.5  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0989044  normal  0.24508 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4452  methyltransferase type 11  31.58 
 
 
277 aa  65.1  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3463  type 11 methyltransferase  25.93 
 
 
280 aa  65.1  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1954  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.37 
 
 
419 aa  65.1  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0822929 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  37.27 
 
 
268 aa  64.3  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2992  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  37.37 
 
 
421 aa  64.7  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1968  arsenite S-adenosylmethyltransferase  37.01 
 
 
276 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0464  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  35 
 
 
421 aa  63.9  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1353  Methyltransferase type 11  29.93 
 
 
280 aa  63.2  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0337053  hitchhiker  0.000000492717 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  37.29 
 
 
262 aa  63.2  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.92 
 
 
251 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61862  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  29.5 
 
 
258 aa  62.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01614  S-adenosyl-methionine-sterol-C-methyltransferas (AFU_orthologue; AFUA_4G09190)  31.53 
 
 
387 aa  62.8  0.000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.787149  normal  0.132042 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23681  SAM-binding motif-containing protein  30.56 
 
 
304 aa  62.4  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0592385 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0994  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.29 
 
 
282 aa  62  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000209916  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11556  methyltransferase  31.69 
 
 
347 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13761  transferase  34.23 
 
 
776 aa  62  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.881516  normal  0.437263 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0552  Methyltransferase type 11  30.3 
 
 
247 aa  62  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.286054  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  28.26 
 
 
240 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0460  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  37.25 
 
 
421 aa  61.2  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0266  methyltransferase type 11  31.17 
 
 
279 aa  60.8  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.608985  normal  0.806838 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1057  Methyltransferase type 11  32.5 
 
 
292 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.783467  hitchhiker  0.00010073 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1411  Methyltransferase type 11  31.93 
 
 
292 aa  60.8  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.456001  normal  0.135358 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>