292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2118 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_2118  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  100 
 
 
158 aa  316  7.999999999999999e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.296225  normal  0.477442 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0787  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  51.77 
 
 
148 aa  139  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.267485  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2632  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  47.18 
 
 
147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3175  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  50.74 
 
 
154 aa  125  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1924  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  47.74 
 
 
191 aa  124  7e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3500  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  45.83 
 
 
151 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.076356 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1293  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  48.99 
 
 
154 aa  122  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3616  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  44.9 
 
 
149 aa  121  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.47995  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4799  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  47.02 
 
 
148 aa  121  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.974363  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3205  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  44.44 
 
 
151 aa  120  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.473316  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4165  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  46.53 
 
 
153 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.161353  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2421  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  47.33 
 
 
145 aa  119  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1106  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  51.15 
 
 
135 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.157487 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4268  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  47.22 
 
 
163 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3072  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  50.35 
 
 
169 aa  118  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.495384 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0558  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  48.85 
 
 
129 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870765  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0729  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  49.62 
 
 
132 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39084  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4765  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  46.04 
 
 
153 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5232  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  46.76 
 
 
143 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.200026  normal  0.202993 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2326  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  48.09 
 
 
132 aa  114  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.19273 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0673  putative thioesterase  48.09 
 
 
132 aa  114  5e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0436073  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2384  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  45.52 
 
 
204 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.29549  normal  0.378744 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5307  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  44.68 
 
 
143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145182  normal  0.895228 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0148  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  45.39 
 
 
146 aa  111  3e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1090  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  46.27 
 
 
149 aa  111  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0277  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  46.67 
 
 
144 aa  110  7.000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2723  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  44.74 
 
 
153 aa  110  9e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0969  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  43.06 
 
 
136 aa  110  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.475786  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1214  thioesterase superfamily protein  41.96 
 
 
156 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.859401  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2903  thioesterase superfamily protein  42.31 
 
 
166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0130041  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0749  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  46.62 
 
 
150 aa  107  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1107  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  44.85 
 
 
136 aa  107  7.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0129163  normal  0.667766 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1644  hypothetical protein  41.96 
 
 
149 aa  107  8.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.996621  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3520  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  42.76 
 
 
153 aa  106  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22411  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6904  thioesterase superfamily protein  43.75 
 
 
149 aa  104  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0171127  normal  0.306193 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2369  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  41.67 
 
 
128 aa  104  5e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.154271  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2233  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  42.75 
 
 
149 aa  103  7e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0924  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  46.04 
 
 
144 aa  103  8e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0795864 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0682  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  44.8 
 
 
134 aa  99.4  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.382877  normal  0.103995 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3638  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  43.51 
 
 
131 aa  98.6  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2210  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  39.85 
 
 
133 aa  96.7  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00606387 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0472  thioesterase superfamily protein  46.46 
 
 
131 aa  95.5  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.563842  normal  0.634378 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0723  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  37.12 
 
 
150 aa  94.7  4e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2953  putative thioesterase protein  36.09 
 
 
141 aa  94  7e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0150824  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1275  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  39.1 
 
 
134 aa  93.6  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000950764  hitchhiker  0.000140311 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0332  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  43.97 
 
 
159 aa  93.2  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117109  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1152  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  37.59 
 
 
134 aa  92  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0064  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  40.14 
 
 
140 aa  91.7  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.246744  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3893  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  41.41 
 
 
161 aa  91.7  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1013  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  37.5 
 
 
154 aa  91.7  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.505536  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0063  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  40.14 
 
 
140 aa  91.7  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.57846  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2906  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  39.1 
 
 
134 aa  91.7  4e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.15122  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003917  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  39.23 
 
 
139 aa  90.9  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0190272  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0258  thioesterase  40.77 
 
 
141 aa  90.9  7e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.024858  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2090  hypothetical protein  38.46 
 
 
133 aa  90.9  7e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000228869  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1533  hypothetical protein  37.98 
 
 
131 aa  89.7  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1450  hypothetical protein  37.98 
 
 
131 aa  89.7  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0698  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  42.19 
 
 
161 aa  90.1  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2583  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  41.73 
 
 
141 aa  89.7  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412087  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36680  acyl-coenzyme A thioester hydrolase  41.09 
 
 
148 aa  89.4  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.853983  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0681  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  42.19 
 
 
161 aa  89.4  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2872  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  36.84 
 
 
133 aa  88.6  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000275881  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2960  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  36.84 
 
 
133 aa  88.6  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0218826  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3648  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  33.58 
 
 
133 aa  88.2  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.233147  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1377  hypothetical protein  37.98 
 
 
160 aa  88.2  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.200042  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3755  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  33.58 
 
 
133 aa  88.2  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2444  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  40.8 
 
 
133 aa  87.8  5e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000193862  normal  0.240329 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2535  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  40.8 
 
 
133 aa  87.8  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000842763  normal  0.159999 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1224  thioesterase family protein  41.41 
 
 
143 aa  87.4  7e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0347226  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3091  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  36.84 
 
 
134 aa  87  8e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.248524  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0786  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  39.69 
 
 
150 aa  86.7  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0411186  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2752  hypothetical protein  40.98 
 
 
133 aa  86.7  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3199  thioesterase family protein  43.48 
 
 
164 aa  87  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2077  hypothetical protein  43.48 
 
 
161 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3252  putative thioesterase  43.48 
 
 
161 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1945  thioesterase family protein  43.48 
 
 
164 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0831  thioesterase family protein  43.48 
 
 
161 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3237  thioesterase family protein  43.48 
 
 
164 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2343  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  40.46 
 
 
136 aa  86.7  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.49687  normal  0.168898 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2665  thioesterase family protein  43.48 
 
 
161 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0321  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  40 
 
 
161 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2372  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  40 
 
 
133 aa  86.3  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000888459  normal  0.224754 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0804  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  40 
 
 
161 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.913321  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3461  thioesterase family protein  37.88 
 
 
130 aa  85.5  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1853  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  37.01 
 
 
132 aa  85.5  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107665  normal  0.755502 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2568  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  40.98 
 
 
157 aa  85.9  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000331427  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1894  acyl-CoA thioester hydrolase  38.1 
 
 
134 aa  85.5  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2542  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  39.2 
 
 
133 aa  85.5  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000475401  hitchhiker  0.00000263931 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0532  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  36.51 
 
 
136 aa  84.7  4e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.629499  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1738  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  39.2 
 
 
133 aa  85.1  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000578703  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1781  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  39.2 
 
 
133 aa  85.1  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000346998  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2451  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  45.65 
 
 
159 aa  84.7  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1742  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  39.2 
 
 
133 aa  85.1  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000282054  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1245  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  36.09 
 
 
134 aa  84.7  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0111113  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3916  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  45.26 
 
 
159 aa  84.7  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.164673  normal  0.152655 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1529  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  34.59 
 
 
146 aa  84.7  5e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.624218  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3123  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  36.64 
 
 
143 aa  84.7  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0773  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  40 
 
 
161 aa  84.3  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.289929  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0791  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  43.96 
 
 
134 aa  84  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1247  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  38.28 
 
 
150 aa  84.3  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.305337  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>