More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1889 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1889  ABC transporter related  100 
 
 		 257 aa  522  1e-147  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.110075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1591  ABC transporter related  59.6 
 
 		 263 aa  314  8e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.963081  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2185  ABC transporter related  59.76 
 
 		 263 aa  312  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.839848  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6108  ABC transporter related  60 
 
 		 276 aa  311  7.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.665492 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2499  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  60.82 
 
 		 279 aa  311  9e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6520  ABC transporter related  59.59 
 
 		 276 aa  308  4e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.526333  normal  0.510638 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4452  ABC transporter related  61.34 
 
 		 253 aa  308  8e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2358  ABC transporter related  61.7 
 
 		 246 aa  305  5.0000000000000004e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.869822  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4534  ABC transporter related  60.34 
 
 		 263 aa  305  6e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2603  ABC transporter related  57.96 
 
 		 256 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00980266 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1225  ABC transporter related  59.92 
 
 		 274 aa  304  1.0000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.164506  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4240  ABC transporter, ATP-binding protein  59.15 
 
 		 260 aa  302  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1341  ABC transporter-like  58.72 
 
 		 262 aa  299  2e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.359238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2684  ABC transporter related protein  54.55 
 
 		 263 aa  299  3e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1364  ABC transporter related  59.91 
 
 		 289 aa  298  7e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.245091  normal  0.0323343 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3974  ABC transporter  58.3 
 
 		 260 aa  298  7e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.161065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2397  ABC transporter related  53.49 
 
 		 268 aa  296  3e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3976  ABC transporter related  56.92 
 
 		 257 aa  295  7e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0048  ABC transporter related  57.14 
 
 		 259 aa  294  9e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0742  putative ABC transporter, ATP-binding protein  58.72 
 
 		 257 aa  294  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.267111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1124  ABC transporter  60.68 
 
 		 267 aa  293  1e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0610  ABC transporter related  60 
 
 		 268 aa  282  5.000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.376916  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2730  ABC transporter related  56.84 
 
 		 280 aa  266  2e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3490  ABC transporter related  48.82 
 
 		 303 aa  210  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.411512 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1077  ATPase  45.19 
 
 		 251 aa  185  8e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.096527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  47.83 
 
 		 251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  44.6 
 
 		 306 aa  183  3e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2105  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  42.42 
 
 		 289 aa  182  4.0000000000000006e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  42.06 
 
 		 254 aa  181  8.000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  42.53 
 
 		 254 aa  181  8.000000000000001e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  42.06 
 
 		 254 aa  181  1e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3254  ABC transporter related  44.04 
 
 		 258 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0994591 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  41.74 
 
 		 254 aa  181  1e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  43.19 
 
 		 304 aa  180  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6201  ABC transporter related  41.94 
 
 		 245 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.102037 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  43.84 
 
 		 304 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04080  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  44.13 
 
 		 316 aa  178  8e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.716043 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  42.66 
 
 		 308 aa  177  1e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  45.27 
 
 		 303 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  45.27 
 
 		 303 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  45.27 
 
 		 303 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0039  ABC transporter related  43.19 
 
 		 276 aa  176  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147558  normal  0.492978 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  40.52 
 
 		 258 aa  176  4e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0580  ABC transporter related  44.59 
 
 		 265 aa  176  4e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.860273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  44.12 
 
 		 304 aa  175  5e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  44.5 
 
 		 265 aa  174  8e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2599  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  41.31 
 
 		 285 aa  175  8e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3518  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  41.31 
 
 		 285 aa  175  8e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1788  ABC transporter related  41.55 
 
 		 303 aa  174  9.999999999999999e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4675  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  41.78 
 
 		 280 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3117  ABC transporter-related protein  40.08 
 
 		 353 aa  173  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  40.91 
 
 		 353 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0059  ABC transporter related  41.59 
 
 		 257 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0981  ABC transporter related  43.18 
 
 		 353 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  44.86 
 
 		 278 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0239  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  45.37 
 
 		 402 aa  173  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.986406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.36 
 
 		 353 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  42.4 
 
 		 307 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3244  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  44.6 
 
 		 384 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal  0.910388 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1084  ABC transporter related  44.24 
 
 		 319 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  42.73 
 
 		 273 aa  172  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1564  ABC transporter related  44.24 
 
 		 319 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3817  polyamine ABC transporter ATP-binding protein  43.78 
 
 		 382 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.217368  normal  0.691578 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0497  ABC transporter component  43.64 
 
 		 366 aa  172  5e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  39.38 
 
 		 260 aa  172  5.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0832  ABC transporter related  41.74 
 
 		 344 aa  172  5.999999999999999e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0301  putative spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 		 355 aa  171  7.999999999999999e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00163011  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1321  ABC transporter-like protein  44.08 
 
 		 288 aa  171  7.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.251104 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0327  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  42.86 
 
 		 355 aa  171  1e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100504  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1952  ABC transporter related  43.78 
 
 		 382 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.647045 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  39.57 
 
 		 254 aa  171  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  40.45 
 
 		 353 aa  171  1e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22550  ABC transporter ATP-binding protein  46.34 
 
 		 255 aa  171  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4393  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  40.89 
 
 		 280 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0718  ABC transporter, ATP-binding protein  38.87 
 
 		 353 aa  170  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2088  ABC transporter related  43.32 
 
 		 382 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.619396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4456  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  40.89 
 
 		 280 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.458938  normal  0.759518 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0550  ABC transporter related  45.27 
 
 		 276 aa  170  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.589055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  44.04 
 
 		 264 aa  170  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1540  ABC transporter related  43.78 
 
 		 318 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0499832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27180  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  42.92 
 
 		 261 aa  170  2e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.785325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5504  ABC transporter related  41.2 
 
 		 346 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0674  ABC transporter, ATP-binding protein  38.87 
 
 		 353 aa  170  2e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5124  ABC transporter related  41.2 
 
 		 346 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1759  ABC transporter related  38.87 
 
 		 353 aa  170  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.483638  normal  0.015539 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2587  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  41.31 
 
 		 290 aa  170  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193171 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1465  ABC transporter related  43.78 
 
 		 319 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.08781  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  41.23 
 
 		 261 aa  170  2e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  44.23 
 
 		 264 aa  171  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1486  ABC transporter related  43.98 
 
 		 319 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5213  ABC transporter related  41.2 
 
 		 346 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0420  ABC transporter related  46.39 
 
 		 265 aa  169  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.889733 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4706  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  44.24 
 
 		 319 aa  169  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3450  ABC transporter related  43.32 
 
 		 384 aa  169  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.622564  normal  0.365938 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1237  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  45.23 
 
 		 659 aa  170  3e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2560  ABC transporter related  40.38 
 
 		 271 aa  169  3e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1237  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  38.58 
 
 		 271 aa  169  3e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017659 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3906  ABC transporter related  42.86 
 
 		 315 aa  169  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.118447  normal  0.091795 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2474  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.55 
 
 		 353 aa  169  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0356  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  38.58 
 
 		 271 aa  169  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>