More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0095 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_3483  aspartate aminotransferase  72.69 
 
 		 534 aa  800    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.284147  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0095  aspartate aminotransferase  100 
 
 		 530 aa  1092    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0859207  normal  0.737001 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2709  aspartate aminotransferase  61.61 
 
 		 541 aa  681    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.625011  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3891  aspartate aminotransferase  61.63 
 
 		 554 aa  673    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0790  aspartate aminotransferase  62.36 
 
 		 554 aa  664    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.545983 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1984  aspartate aminotransferase  61.98 
 
 		 538 aa  675    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0142877 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3914  aspartate aminotransferase  70.88 
 
 		 531 aa  795    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.550794  normal  0.103832 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0621  aminotransferase class I and II  55.92 
 
 		 530 aa  609  1e-173  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3840  aminotransferase class I and II  50.28 
 
 		 548 aa  519  1e-146  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.157118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1557  aspartate aminotransferase  47.66 
 
 		 552 aa  489  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.122519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1258  aspartate aminotransferase  46.15 
 
 		 540 aa  474  1e-132  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000391079  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1946  aspartate aminotransferase  45.09 
 
 		 589 aa  458  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.346248  normal  0.0292973 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0325  aspartate aminotransferase  42.03 
 
 		 528 aa  420  1e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0327  aspartate aminotransferase  41.59 
 
 		 528 aa  412  1e-113  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1070  hypothetical protein  46.1 
 
 		 159 aa  136  8e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000222922  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  32.89 
 
 		 404 aa  74.7  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2798  aminotransferase class I and II  27.92 
 
 		 396 aa  73.6  0.000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3192  aminotransferase, class I and II  29.25 
 
 		 399 aa  70.1  0.00000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.593441  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0519  aminotransferase class I and II  30.81 
 
 		 398 aa  67.8  0.0000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1319  aminotransferase  29.66 
 
 		 398 aa  67.8  0.0000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.399658  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1360  aminotransferase, class I and II  26.42 
 
 		 397 aa  67.4  0.0000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0073  hypothetical protein  30 
 
 		 392 aa  66.6  0.0000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1087  aminotransferase  29.17 
 
 		 392 aa  67  0.0000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1755  aminotransferase, class I and II  28.19 
 
 		 394 aa  66.6  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_89248  predicted protein  31.43 
 
 		 452 aa  66.6  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.113989 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0085  hypothetical protein  30 
 
 		 392 aa  65.9  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  32.17 
 
 		 390 aa  65.9  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1304  aminotransferase class I and II  30.56 
 
 		 410 aa  65.5  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  28.67 
 
 		 396 aa  64.7  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  30.77 
 
 		 388 aa  64.3  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1684  aspartate aminotransferase  30.07 
 
 		 396 aa  63.9  0.000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.121725  normal  0.0684909 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2116  aminotransferase class I and II  27.84 
 
 		 400 aa  63.9  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1731  L-aspartate aminotransferase  28.35 
 
 		 400 aa  63.5  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2206  aminotransferase class I and II  28.35 
 
 		 400 aa  63.5  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2554  aminotransferase  27.08 
 
 		 438 aa  63.5  0.000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0255336  normal  0.0169818 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0907  aspartate aminotransferase  27.27 
 
 		 415 aa  63.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.149386 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3007  hypothetical protein  28.57 
 
 		 390 aa  63.2  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1034  aminotransferase  22.9 
 
 		 440 aa  63.2  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2793  aminotransferase  23.5 
 
 		 386 aa  63.2  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2066  aminotransferase class I and II  23.51 
 
 		 400 aa  63.2  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0959735  normal  0.858432 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  25.68 
 
 		 396 aa  62  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0617  aminotransferase  29.17 
 
 		 394 aa  62.4  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07871  aminotransferase class-I  24.12 
 
 		 393 aa  62.4  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.404062  hitchhiker  0.00724094 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4527  aminotransferase class I and II  25.35 
 
 		 415 aa  62  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0102  aminotransferase, class I and II  28.25 
 
 		 401 aa  61.6  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.848816  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1066  aminotransferase, class I and II  24.1 
 
 		 401 aa  61.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.824593 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0897  aspartate aminotransferase  24.92 
 
 		 389 aa  61.6  0.00000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0789129  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2709  aspartate aminotransferase  25.08 
 
 		 405 aa  61.2  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0229127 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1629  aminotransferase, class I and II  27.27 
 
 		 389 aa  61.2  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0178  aminotransferase class I and II  24.12 
 
 		 396 aa  60.8  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0111  putative aspartate transaminase  26.52 
 
 		 401 aa  60.8  0.00000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  22.73 
 
 		 387 aa  60.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0201  hypothetical protein  27.97 
 
 		 396 aa  60.5  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.39659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0707  aspartate aminotransferase  27.75 
 
 		 392 aa  60.5  0.00000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.498645  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2501  aminotransferase, class I and II  27.46 
 
 		 397 aa  60.5  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000255264  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2860  aminotransferase, class I and II  23.41 
 
 		 406 aa  60.1  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1425  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  26.7 
 
 		 444 aa  60.1  0.00000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0549  aminotransferase class I and II  26.29 
 
 		 401 aa  60.1  0.00000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4358  aminotransferase class I and II  25.27 
 
 		 406 aa  60.1  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2202  aspartate aminotransferase  25.69 
 
 		 393 aa  59.7  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5040  hypothetical protein  27.97 
 
 		 396 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2022  aspartate aminotransferase  28.28 
 
 		 393 aa  60.1  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5045  hypothetical protein  27.97 
 
 		 396 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2980  aminotransferase  26.46 
 
 		 383 aa  60.1  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.289509  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1134  aspartate aminotransferase  23.13 
 
 		 387 aa  59.7  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338962  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2238  aminotransferase class I and II  27.93 
 
 		 396 aa  60.1  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.105743  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4119  aminotransferase  25.83 
 
 		 400 aa  60.1  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1687  aminotransferase class I and II  28.28 
 
 		 393 aa  60.1  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0048  aminotransferase class I and II  27.21 
 
 		 401 aa  59.7  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00536151  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0081  aminotransferase, class I and II  28.57 
 
 		 398 aa  59.7  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0701  aspartate aminotransferase  26.7 
 
 		 392 aa  59.7  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2569  aminotransferase class I and II  25.26 
 
 		 397 aa  60.1  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121169  normal  0.359659 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24020  aspartate aminotransferase  27.44 
 
 		 414 aa  59.7  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.871071  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1696  aminotransferase, class I and II  25.35 
 
 		 397 aa  59.7  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0798597  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5012  hypothetical protein  27.97 
 
 		 396 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1241  aminotransferase class I and II  26.06 
 
 		 400 aa  59.3  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4771  hypothetical protein  27.97 
 
 		 396 aa  59.3  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4611  hypothetical protein  27.97 
 
 		 396 aa  59.3  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4633  hypothetical protein  27.97 
 
 		 396 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2182  aminotransferase, class I and II  26.43 
 
 		 405 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100524  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  27.11 
 
 		 393 aa  58.9  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1138  aminotransferase, class I and II  26.9 
 
 		 395 aa  58.9  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.025669  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5133  hypothetical protein  27.97 
 
 		 396 aa  59.3  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4723  hypothetical protein  27.97 
 
 		 396 aa  58.9  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5177  class I/II aminotransferase  25.52 
 
 		 388 aa  58.9  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530188  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2839  aminotransferase class I and II  25.71 
 
 		 395 aa  58.9  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326737 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0312  aminotransferase class I and II  25.59 
 
 		 413 aa  59.3  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1626  aminotransferase, class I and II  25.56 
 
 		 383 aa  59.3  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5033  hypothetical protein  27.97 
 
 		 396 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145667  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1427  hypothetical protein  24.38 
 
 		 402 aa  59.3  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0489615 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0525  aspartate aminotransferase  24.43 
 
 		 397 aa  58.5  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  23.28 
 
 		 390 aa  58.5  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2204  aminotransferase class I and II  25.57 
 
 		 390 aa  58.5  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0630  aspartate aminotransferase  25 
 
 		 394 aa  58.2  0.0000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0363  aminotransferase  27.21 
 
 		 390 aa  58.2  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1545  aspartate aminotransferase  25 
 
 		 423 aa  58.2  0.0000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5107  aminotransferase class I and II  26.5 
 
 		 405 aa  57.8  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.294065  normal  0.505049 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0798  aspartate aminotransferase  34 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3596  L-aspartate aminotransferase  25 
 
 		 390 aa  57.8  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7660  aspartate aminotransferase  28.02 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.394739  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>