More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0096 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1917  glutamyl-tRNA reductase  82.65 
 
 		 393 aa  662    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.406636 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0096  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 393 aa  775    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2261  glutamyl-tRNA reductase  71.03 
 
 		 403 aa  536  1e-151  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.200572  normal  0.0151163 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2034  glutamyl-tRNA reductase  70.44 
 
 		 391 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000938392 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0928  glutamyl-tRNA reductase  54.34 
 
 		 387 aa  394  1e-108  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.878615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1481  glutamyl-tRNA reductase  54.08 
 
 		 380 aa  352  8.999999999999999e-96  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1730  glutamyl-tRNA reductase  33.08 
 
 		 406 aa  192  8e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0393271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0214  glutamyl-tRNA reductase  32.59 
 
 		 424 aa  177  3e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000943569  normal  0.0144632 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1462  glutamyl-tRNA reductase  34.01 
 
 		 449 aa  151  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1160  glutamyl-tRNA reductase  28.61 
 
 		 426 aa  150  4e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.319065  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0959  glutamyl-tRNA reductase  33.75 
 
 		 430 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  31.29 
 
 		 440 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0049  glutamyl-tRNA reductase  36.1 
 
 		 411 aa  139  7e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1100  glutamyl-tRNA reductase  27.76 
 
 		 379 aa  137  2e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3451  glutamyl-tRNA reductase  28.12 
 
 		 409 aa  137  5e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.341697  normal  0.0956626 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1087  glutamyl-tRNA reductase  29.55 
 
 		 382 aa  136  8e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  30.1 
 
 		 441 aa  135  8e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1229  glutamyl-tRNA reductase  30.03 
 
 		 422 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000302896  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0296  glutamyl-tRNA reductase  30.37 
 
 		 442 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0052  glutamyl-tRNA reductase  28.18 
 
 		 383 aa  130  3e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0279425  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2025  glutamyl-tRNA reductase  31.5 
 
 		 450 aa  130  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1588  glutamyl-tRNA reductase  28.18 
 
 		 382 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.082883  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0859  glutamyl-tRNA reductase  27.68 
 
 		 382 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.146184  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  28.8 
 
 		 443 aa  127  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0706  glutamyl-tRNA reductase  27.83 
 
 		 368 aa  127  3e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0685  glutamyl-tRNA reductase  31.06 
 
 		 398 aa  127  4.0000000000000003e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.310076  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2825  glutamyl-tRNA reductase  32.67 
 
 		 438 aa  126  8.000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.546073  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  28.39 
 
 		 458 aa  126  9e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  30.06 
 
 		 454 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1362  glutamyl-tRNA reductase  30.83 
 
 		 446 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0091  glutamyl-tRNA reductase  29.41 
 
 		 340 aa  124  2e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1728  glutamyl-tRNA reductase  28.03 
 
 		 425 aa  124  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1750  glutamyl-tRNA reductase  31.19 
 
 		 442 aa  124  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0980  glutamyl-tRNA reductase  29.45 
 
 		 423 aa  124  3e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.614941  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1459  glutamyl-tRNA reductase  30.56 
 
 		 446 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2493  glutamyl-tRNA reductase  30.28 
 
 		 446 aa  123  7e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3252  glutamyl-tRNA reductase  31.49 
 
 		 425 aa  122  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000725008  normal  0.10707 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0286  glutamyl-tRNA reductase  32.07 
 
 		 419 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  27.99 
 
 		 464 aa  120  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3246  glutamyl-tRNA reductase  31.25 
 
 		 444 aa  120  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1059  glutamyl-tRNA reductase  29.95 
 
 		 426 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  28.16 
 
 		 464 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1219  glutamyl-tRNA reductase  29.39 
 
 		 457 aa  120  4.9999999999999996e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1465  glutamyl-tRNA reductase  30.58 
 
 		 443 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.68367  normal  0.0496513 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1374  glutamyl-tRNA reductase  31.93 
 
 		 440 aa  120  6e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2361  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  32.86 
 
 		 429 aa  119  9e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0758  glutamyl-tRNA reductase  30.3 
 
 		 431 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.510038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1840  glutamyl-tRNA reductase  29.41 
 
 		 451 aa  117  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.20758  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4311  glutamyl-tRNA reductase  30.16 
 
 		 443 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3544  glutamyl-tRNA reductase  30.57 
 
 		 414 aa  116  6.9999999999999995e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.037813  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2761  glutamyl-tRNA reductase  30.8 
 
 		 443 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2381  glutamyl-tRNA reductase  30.8 
 
 		 443 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.370864 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3182  glutamyl-tRNA reductase  28.81 
 
 		 444 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2283  glutamyl-tRNA reductase  28.77 
 
 		 424 aa  115  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6799  glutamyl-tRNA reductase  29.91 
 
 		 458 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1250  glutamyl-tRNA reductase  31.5 
 
 		 441 aa  115  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.305769 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0993  glutamyl-tRNA reductase  30.46 
 
 		 449 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0722  glutamyl-tRNA reductase  34.22 
 
 		 427 aa  114  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.419682 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4602  glutamyl-tRNA reductase  29.18 
 
 		 444 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0279  glutamyl-tRNA reductase  30.08 
 
 		 446 aa  114  4.0000000000000004e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41480  glutamyl-tRNA reductase  29.9 
 
 		 408 aa  113  5e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.340284  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0390  glutamyl-tRNA reductase  29.05 
 
 		 434 aa  113  5e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0690188  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0510  glutamyl-tRNA reductase  29.41 
 
 		 420 aa  113  6e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4557  glutamyl-tRNA reductase  29.18 
 
 		 444 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4363  glutamyl-tRNA reductase  29.18 
 
 		 444 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4199  glutamyl-tRNA reductase  29.18 
 
 		 444 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4698  glutamyl-tRNA reductase  29.18 
 
 		 444 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4553  glutamyl-tRNA reductase  29.18 
 
 		 444 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4210  glutamyl-tRNA reductase  29.18 
 
 		 444 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5878  glutamyl-tRNA reductase  29.67 
 
 		 446 aa  112  8.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.179812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2088  glutamyl-tRNA reductase  28.47 
 
 		 343 aa  112  9e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.225095 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  26.5 
 
 		 421 aa  112  9e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2256  glutamyl-tRNA reductase  28.42 
 
 		 424 aa  112  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  30.45 
 
 		 436 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  27.41 
 
 		 443 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04547  glutamyl-tRNA reductase  29.52 
 
 		 432 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0317  glutamyl-tRNA reductase  28.08 
 
 		 395 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61710  glutamyl-tRNA reductase  28.64 
 
 		 422 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624585  normal  0.0109768 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0650  glutamyl-tRNA reductase  29.18 
 
 		 444 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4205  glutamyl-tRNA reductase  29.97 
 
 		 423 aa  110  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1238  glutamyl-tRNA reductase  27.69 
 
 		 424 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4584  glutamyl-tRNA reductase  29.18 
 
 		 444 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1528  glutamyl-tRNA reductase  31.86 
 
 		 424 aa  110  5e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  31.6 
 
 		 436 aa  110  6e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0859  glutamyl-tRNA reductase  25.52 
 
 		 432 aa  110  6e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0924191  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0949  glutamyl-tRNA reductase  29.31 
 
 		 431 aa  109  8.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5315  glutamyl-tRNA reductase  28.5 
 
 		 422 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2929  glutamyl-tRNA reductase  29.97 
 
 		 432 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1942  glutamyl-tRNA reductase  29.97 
 
 		 434 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16841  glutamyl-tRNA reductase  29.33 
 
 		 436 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3598  glutamyl-tRNA reductase  30.1 
 
 		 432 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2593  glutamyl-tRNA reductase  30.1 
 
 		 432 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3589  glutamyl-tRNA reductase  29.97 
 
 		 434 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.472177  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  30.46 
 
 		 446 aa  109  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1989  glutamyl-tRNA reductase  28.83 
 
 		 420 aa  108  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00499789  decreased coverage  0.00167683 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0971  glutamyl-tRNA reductase  29.97 
 
 		 434 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0563906  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3613  glutamyl-tRNA reductase  29.97 
 
 		 434 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.268717  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0675  glutamyl-tRNA reductase  29.97 
 
 		 434 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3600  glutamyl-tRNA reductase  29.97 
 
 		 432 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2128  glutamyl-tRNA reductase  29.97 
 
 		 365 aa  108  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>