57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2576 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2576  membrane-flanked domain-containing protein  100 
 
 		 146 aa  292  8e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.261166  normal  0.15355 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1361  membrane-flanked domain  49.39 
 
 		 172 aa  147  7e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.30148  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1403  hypothetical protein  46.91 
 
 		 165 aa  146  8e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.1602  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0824  hypothetical protein  47.24 
 
 		 167 aa  140  6e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.332875 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0188  hypothetical protein  51.06 
 
 		 157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.167897 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0579  membrane-flanked domain-containing protein  36.91 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0224616  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2094  hypothetical protein  33.54 
 
 		 178 aa  99  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.859623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0078  hypothetical protein  32.47 
 
 		 158 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0745922 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0096  hypothetical membrane associated protein  29.56 
 
 		 180 aa  93.6  8e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.129963  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2068  hypothetical protein  29.56 
 
 		 175 aa  93.6  8e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1471  hypothetical protein  33.78 
 
 		 155 aa  93.6  9e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7601  hypothetical protein  36.42 
 
 		 155 aa  89.4  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.181543 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0473  membrane-flanked domain-containing protein  32.43 
 
 		 155 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.325345  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2654  hypothetical protein  34.35 
 
 		 146 aa  72  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2524  hypothetical protein  34.35 
 
 		 146 aa  72  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1149  membrane-flanked domain protein  30.66 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1171  membrane-flanked domain-containing protein  26.32 
 
 		 289 aa  60.8  0.000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2709  membrane-flanked domain-containing protein  27.27 
 
 		 227 aa  57.4  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00542291  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4224  membrane-flanked domain protein  25.16 
 
 		 479 aa  55.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00512848  normal  0.19877 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1843  membrane-flanked domain protein  25.32 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0163501  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1671  membrane-flanked domain protein  27.4 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9325  hypothetical protein  29.01 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1332  membrane-flanked domain-containing protein  24.68 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0763  membrane-flanked domain protein  24.39 
 
 		 229 aa  53.9  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1296  membrane-flanked domain-containing protein  24.67 
 
 		 172 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.337275  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1313  membrane-flanked domain-containing protein  24.67 
 
 		 172 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  0.136537 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05910  predicted membrane protein  32.22 
 
 		 203 aa  50.4  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.697555 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0446  membrane-flanked domain  32.74 
 
 		 194 aa  50.1  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000176229  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2125  hypothetical protein  25.98 
 
 		 179 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1279  hypothetical protein  27.69 
 
 		 179 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0702  membrane-flanked domain-containing protein  23.88 
 
 		 169 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13307  transmembrane protein  27.45 
 
 		 172 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0600  membrane-flanked domain protein  22.82 
 
 		 232 aa  47.8  0.00005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1284  membrane-flanked domain-containing protein  24 
 
 		 208 aa  46.2  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.935757  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0473  hypothetical protein  27.45 
 
 		 247 aa  45.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00981278  normal  0.0264995 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4749  membrane-flanked domain-containing protein  25.33 
 
 		 181 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0399  membrane-flanked domain-containing protein  25 
 
 		 174 aa  45.4  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0164295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1511  hypothetical protein  28.06 
 
 		 170 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000724877 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3389  membrane-flanked domain protein  30.14 
 
 		 172 aa  44.3  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0554186  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1327  hypothetical protein  24.64 
 
 		 166 aa  43.9  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2926  membrane-flanked domain protein  25.89 
 
 		 231 aa  43.9  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0020  hypothetical protein  36.67 
 
 		 170 aa  43.5  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.715756  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0804  membrane-flanked domain-containing protein  32 
 
 		 189 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000475922 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4935  membrane-flanked domain protein  31.08 
 
 		 174 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06580  hypothetical protein  22.73 
 
 		 186 aa  42.7  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0858  membrane-flanked domain-containing protein  26.12 
 
 		 189 aa  43.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.40567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26060  hypothetical protein  25.53 
 
 		 245 aa  42.4  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2927  membrane-flanked domain protein  26.67 
 
 		 190 aa  42  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1707  membrane-flanked domain-containing protein  31.34 
 
 		 172 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3601  membrane-flanked domain protein  31.58 
 
 		 173 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5912  membrane-flanked domain-containing protein  25 
 
 		 181 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.824829 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4835  membrane-flanked domain protein  36.67 
 
 		 169 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0819  membrane-flanked domain protein  24.34 
 
 		 186 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00223653  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0708  membrane-flanked domain protein  25.68 
 
 		 575 aa  41.2  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.372887  normal  0.341849 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3310  membrane-flanked domain protein  29.41 
 
 		 519 aa  41.2  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0193297 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0717  membrane-flanked domain-containing protein  24 
 
 		 255 aa  41.2  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3541  hypothetical protein  32.14 
 
 		 176 aa  40.4  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.543439 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>