63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1980 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1980  dnaK suppressor  100 
 
 		 129 aa  256  6e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2310  TraR/DksA family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 119 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2582  TraR/DksA family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.453869  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1761  transcriptional regulator, TraR/DksA family  37.18 
 
 		 119 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.002786  hitchhiker  0.0085611 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2389  hypothetical protein  34.62 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000590846  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2623  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 119 aa  60.5  0.000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0172808  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2453  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 119 aa  60.5  0.000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.571464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2698  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 119 aa  60.5  0.000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0227937  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2005  dksA-type zinc finger protein  36.59 
 
 		 119 aa  59.3  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2334  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00585088  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2262  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.40465  normal  0.373919 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2243  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.176071  hitchhiker  0.000769405 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1500  TraR/DksA family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2415  transcriptional regulators, TraR/DksA family protein  40.74 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1557  hypothetical protein  26.27 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.406104  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1302  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 117 aa  53.5  0.0000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.893373  normal  0.0630763 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1785  TraR/DksA family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 118 aa  53.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000697437 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0025  TraR/DksA family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.795475  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2675  transcriptional regulator, TraR/DksA family  26.27 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.242775  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4453  TraR/DksA family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 123 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.540844  normal  0.142377 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1052  TraR/DksA family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.129097 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2311  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  23.44 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1158  hypothetical protein  25.41 
 
 		 124 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2860  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 118 aa  48.9  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.689813  hitchhiker  0.0000000253321 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0615  TraR/DksA family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1032  transcriptional regulator, TraR/DksA family  28.95 
 
 		 151 aa  47.4  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.955703  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0535  DnaK suppressor protein  28.93 
 
 		 117 aa  47.4  0.00007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2024  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  23.44 
 
 		 131 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.812974  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1419  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  23.44 
 
 		 131 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.597542  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1334  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  23.44 
 
 		 131 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3205  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  23.44 
 
 		 131 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3077  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  23.44 
 
 		 131 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3641  TraR/DksA family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4116  TraR/DksA family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1047  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  28.38 
 
 		 117 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2314  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  28.38 
 
 		 105 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0188  hypothetical protein  35.09 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.171677 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0852  transcriptional regulator, TraR/DksA family  26.32 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2068  DnaK suppressor protein  41.86 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000191774  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0604  TraR/DksA family transcriptional regulator  40 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1309  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 120 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0691  TraR/DksA family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 139 aa  42  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0872386  normal  0.218793 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2384  TraR/DksA family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 119 aa  42  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68054 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0114  RNA polymerase-binding protein DksA  41.86 
 
 		 147 aa  42  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000001721  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3660  TraR/DksA family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 149 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1007  TraR/DksA family transcriptional regulator  22.05 
 
 		 130 aa  41.6  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0293  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.54 
 
 		 120 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00672458  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0693  transcriptional regulator, TraR/DksA family  21.92 
 
 		 130 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2734  transcriptional regulator, TraR/DksA family  24.19 
 
 		 405 aa  41.6  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.152492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0603  transcriptional regulator, TraR/DksA family  25.96 
 
 		 118 aa  41.2  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6416  transcriptional regulator, TraR/DksA family  32.56 
 
 		 120 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0580522  hitchhiker  0.0061347 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2803  transcriptional regulator, TraR/DksA family  29.75 
 
 		 253 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0568  transcriptional regulator, TraR/DksA family  29.46 
 
 		 118 aa  41.2  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1346  transcriptional regulator, TraR/DksA family  25.42 
 
 		 126 aa  41.2  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2037  regulator RpoS  25.66 
 
 		 146 aa  40.8  0.006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.555499  normal  0.116452 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2340  TraR/DksA family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 146 aa  40.8  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.965473 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2010  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  25.81 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1993  TraR/DksA family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 102 aa  40.4  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0421  TraR/DksA family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 119 aa  40.8  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.581103  normal  0.0182397 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00359  DnaK supressor  26.47 
 
 		 162 aa  40.4  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.131287  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1395  transcriptional regulator, TraR/DksA family  42.31 
 
 		 120 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.268655  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1294  transcriptional regulator, TraR/DksA family  42.31 
 
 		 120 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.25924  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2554  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 120 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.365789  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>