30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1302 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1302  TraR/DksA family transcriptional regulator  100 
 
 		 117 aa  232  1.0000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.893373  normal  0.0630763 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2005  dksA-type zinc finger protein  62.18 
 
 		 119 aa  140  7e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2453  TraR/DksA family transcriptional regulator  62.18 
 
 		 119 aa  140  8e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.571464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2334  TraR/DksA family transcriptional regulator  61.34 
 
 		 119 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00585088  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2262  TraR/DksA family transcriptional regulator  61.34 
 
 		 119 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.40465  normal  0.373919 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1761  transcriptional regulator, TraR/DksA family  60.5 
 
 		 119 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.002786  hitchhiker  0.0085611 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2623  TraR/DksA family transcriptional regulator  59.66 
 
 		 119 aa  134  5e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0172808  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2698  TraR/DksA family transcriptional regulator  58.82 
 
 		 119 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0227937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2582  TraR/DksA family transcriptional regulator  59.66 
 
 		 119 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.453869  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2310  TraR/DksA family transcriptional regulator  57.98 
 
 		 119 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2860  TraR/DksA family transcriptional regulator  53.39 
 
 		 118 aa  124  5e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.689813  hitchhiker  0.0000000253321 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1785  TraR/DksA family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 118 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000697437 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1500  TraR/DksA family transcriptional regulator  49.17 
 
 		 118 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2243  TraR/DksA family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 118 aa  110  5e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.176071  hitchhiker  0.000769405 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2415  transcriptional regulators, TraR/DksA family protein  45.76 
 
 		 123 aa  106  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2389  hypothetical protein  59.26 
 
 		 141 aa  95.1  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000590846  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1980  dnaK suppressor  35.59 
 
 		 129 aa  53.5  0.0000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1557  hypothetical protein  28.18 
 
 		 132 aa  47  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.406104  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4218  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 130 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.419171  normal  0.270154 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4148  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 130 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0078373  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3299  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 130 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.322172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1052  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 122 aa  43.9  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.129097 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0973  transcriptional regulator, TraR/DksA family  37.5 
 
 		 121 aa  43.9  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000492217  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0025  TraR/DksA family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 131 aa  42.7  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.795475  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1007  TraR/DksA family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 130 aa  43.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1727  dnaK suppressor, putative  38.71 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0447582  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2035  serine phosphatase  42.5 
 
 		 341 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1799  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.392784 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1346  transcriptional regulator, TraR/DksA family  38.46 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8326  transcriptional regulator, TraR/DksA family  45.45 
 
 		 110 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>