More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2823 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2823  ROK family protein  100 
 
 
283 aa  570  1.0000000000000001e-162  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2075  ROK family protein  30.08 
 
 
328 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214155  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  33.33 
 
 
312 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  34.12 
 
 
342 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  33.07 
 
 
315 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  33.07 
 
 
315 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  33.57 
 
 
396 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  35 
 
 
313 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0195  glucokinase, ROK family  32.28 
 
 
317 aa  139  7e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  31.45 
 
 
311 aa  138  8.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  32.53 
 
 
303 aa  138  8.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  33.73 
 
 
312 aa  137  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2550  ROK family protein  31.3 
 
 
297 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  30.1 
 
 
316 aa  137  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3703  ROK family protein  34.68 
 
 
297 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428812  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3649  ROK family protein  34.68 
 
 
297 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  32.88 
 
 
322 aa  136  4e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  30.9 
 
 
317 aa  135  6.0000000000000005e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2111  xylose repressor  32.84 
 
 
302 aa  134  9.999999999999999e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.044241  normal  0.767119 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  33.11 
 
 
352 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  30.8 
 
 
409 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3573  ROK family protein  32.51 
 
 
299 aa  132  7.999999999999999e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.406671  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  31.23 
 
 
391 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  31.33 
 
 
323 aa  131  1.0000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2378  glucokinase, ROK family  33.1 
 
 
318 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0088  ROK family protein  32.8 
 
 
313 aa  131  1.0000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4343  glucokinase  34.58 
 
 
327 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4165  glucokinase  34.58 
 
 
327 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4004  glucokinase  34.58 
 
 
327 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4014  glucokinase  34.58 
 
 
327 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0552724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4487  glucokinase  34.58 
 
 
327 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.693624  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4396  glucokinase  34.58 
 
 
327 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4283  glucokinase  34.58 
 
 
327 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1141  ROK family protein  34.41 
 
 
308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0282  glucokinase  30.74 
 
 
335 aa  129  4.0000000000000003e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  32.12 
 
 
321 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3072  glucokinase, ROK family  36.61 
 
 
314 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  31.35 
 
 
383 aa  129  6e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  30.2 
 
 
401 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  32.19 
 
 
315 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4116  ROK family glucokinase  34.58 
 
 
327 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4377  glucokinase  33.9 
 
 
327 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0857  glucokinase  33.9 
 
 
327 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  31.5 
 
 
321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2991  ROK family glucokinase  33.56 
 
 
327 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.922063  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0855  ROK family protein  29.84 
 
 
385 aa  126  4.0000000000000003e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  33.47 
 
 
298 aa  125  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1566  ROK family protein  30.24 
 
 
322 aa  125  7e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2069  glucokinase, ROK family  33.18 
 
 
315 aa  125  8.000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222452  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5264  ROK family protein  33.69 
 
 
325 aa  125  8.000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.482994 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  31.4 
 
 
392 aa  125  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0920  glucokinase  33.67 
 
 
323 aa  124  1e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.635044  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3108  glucokinase  32.49 
 
 
335 aa  124  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  32 
 
 
422 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  32.8 
 
 
395 aa  124  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  30.59 
 
 
402 aa  124  2e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  32.55 
 
 
314 aa  123  3e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1690  ROK family protein  29.29 
 
 
332 aa  123  3e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4056  ROK family protein  30.58 
 
 
302 aa  123  4e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0676  glucokinase  34.26 
 
 
321 aa  121  9.999999999999999e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1323  ROK family protein  33.74 
 
 
314 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000170604  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1363  ROK family protein  33.74 
 
 
314 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0520337  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  33.61 
 
 
315 aa  120  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  30.36 
 
 
347 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5335  ROK family protein  30.98 
 
 
401 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123634  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  28.57 
 
 
306 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0552  glucokinase, ROK family  37.96 
 
 
316 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0770  glucose kinase  34.65 
 
 
322 aa  119  4.9999999999999996e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000145403  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1809  ROK family protein  32.53 
 
 
396 aa  119  6e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  30.39 
 
 
300 aa  119  7e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  31.05 
 
 
405 aa  118  9e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3230  ROK family protein  28.94 
 
 
314 aa  118  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  hitchhiker  0.000117185 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  30.99 
 
 
395 aa  118  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0378  ROK family protein  29.81 
 
 
292 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2298  ROK family protein  30.45 
 
 
389 aa  118  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000166992  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  30.12 
 
 
397 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0512  ROK family protein  31.56 
 
 
292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4286  ROK family protein  29.96 
 
 
402 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  28.87 
 
 
321 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4861  ROK family protein  30.22 
 
 
292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2714  ROK family protein  32.89 
 
 
318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  30.77 
 
 
404 aa  117  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0471  glucokinase  34 
 
 
322 aa  117  3e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  27.3 
 
 
400 aa  116  3e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004130  N-acetylglucosamine-6P-responsive transcriptional repressor NagC ROK family  29.23 
 
 
404 aa  116  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1821  ROK family protein  32.55 
 
 
318 aa  116  3e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1263  ROK family protein  32.73 
 
 
303 aa  116  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000116273  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  30.15 
 
 
396 aa  117  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  30.2 
 
 
503 aa  117  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0040  ROK family protein  29.17 
 
 
293 aa  116  3.9999999999999997e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  30.74 
 
 
410 aa  116  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2459  ROK family protein  31.96 
 
 
313 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0122294  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2512  ROK family protein  32.83 
 
 
340 aa  116  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.615457  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0512  ROK family protein  31.45 
 
 
292 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.111021  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1643  glucokinase  35.42 
 
 
313 aa  116  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09540  transcriptional regulator/sugar kinase  27.8 
 
 
427 aa  115  6e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.208854 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1308  ROK family glucokinase  33.86 
 
 
313 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  28.47 
 
 
389 aa  115  6.9999999999999995e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3188  ROK family protein  28.52 
 
 
318 aa  115  6.9999999999999995e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00496766  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1206  glucokinase  35.55 
 
 
323 aa  115  6.9999999999999995e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000192168  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>