53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2708 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2708  hypothetical protein  100 
 
 		 629 aa  1302    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0314889  normal  0.739389 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1420  hypothetical protein  31.89 
 
 		 649 aa  300  4e-80  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.828826  normal  0.205294 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3217  alpha-glucosidase, putative  29.75 
 
 		 682 aa  265  2e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751285  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3590  hypothetical protein  30.88 
 
 		 630 aa  263  6.999999999999999e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5410  alpha-glucosidase, putative  28.94 
 
 		 648 aa  239  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0179561  normal  0.0688693 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3876  Glycoside hydrolase 97  27.89 
 
 		 571 aa  227  5.0000000000000005e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0907495  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1628  putative alpha-glucosidase  26.91 
 
 		 678 aa  221  3.9999999999999997e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0539219  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0169  putative alpha-glucosidase  27.4 
 
 		 656 aa  221  3.9999999999999997e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2298  putative alpha-glucosidase  27.11 
 
 		 647 aa  219  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2499  putative alpha-glucosidase  28.7 
 
 		 674 aa  218  2.9999999999999998e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2159  alpha-glucosidase, putative, adg97A  28.2 
 
 		 658 aa  212  1e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0591315  hitchhiker  0.000480532 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4959  hypothetical protein  28.8 
 
 		 659 aa  213  1e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1153  putative alpha-glucosidase  28.49 
 
 		 574 aa  211  3e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1312  putative alpha-glucosidase  26.6 
 
 		 655 aa  211  4e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2360  putative alpha-glucosidase  28.38 
 
 		 679 aa  208  3e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.103256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5726  Glycoside hydrolase 97  24.3 
 
 		 656 aa  199  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.035847 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23190  alpha-glucosidase  27.57 
 
 		 701 aa  198  2.0000000000000003e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.243429  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2469  Glycoside hydrolase 97  25.84 
 
 		 641 aa  198  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.395097 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0476  alpha-glucosidase, putative, adg97A  29.09 
 
 		 643 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.620164  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0790  alpha-glucosidase  26.65 
 
 		 661 aa  192  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0155602  normal  0.344193 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1777  alpha-glucosidase  25.71 
 
 		 697 aa  179  1e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.441918  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51780  alpha-glucosidase  25.75 
 
 		 673 aa  175  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.816262  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1876  alpha-glucosidase  25.95 
 
 		 707 aa  173  9e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.507439 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1019  alpha-glucosidase  26.7 
 
 		 683 aa  169  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3873  hypothetical protein  26.17 
 
 		 647 aa  166  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437353  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4326  hypothetical protein  25.9 
 
 		 672 aa  165  3e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0367  putative alpha-glucosidase  25.07 
 
 		 677 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0590  alpha-glucosidase  25.25 
 
 		 684 aa  162  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.225417  normal  0.0221919 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1400  hypothetical protein  24.52 
 
 		 704 aa  159  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0185  alpha-glucosidase  25.94 
 
 		 680 aa  158  3e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0058  Glycoside hydrolase 97  25 
 
 		 693 aa  156  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.52966 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2002  alpha-glucosidase  24.72 
 
 		 727 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1394  hypothetical protein  24.45 
 
 		 700 aa  152  2e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.872498  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2740  alpha-glucosidase  24.49 
 
 		 703 aa  152  2e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0777  hypothetical protein  27.7 
 
 		 606 aa  151  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1931  alpha-glucosidase  24.58 
 
 		 703 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4429  hypothetical protein  24.81 
 
 		 707 aa  148  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.857441  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1876  alpha-glucosidase  24.19 
 
 		 703 aa  147  5e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2102  alpha-glucosidase  24.47 
 
 		 703 aa  145  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.869354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3805  hypothetical protein  24.15 
 
 		 615 aa  144  5e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1892  alpha-glucosidase  25.57 
 
 		 682 aa  143  9e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1209  hypothetical protein  24.1 
 
 		 726 aa  140  4.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2450  alpha-glucosidase  24.09 
 
 		 699 aa  139  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2445  alpha-glucosidase  23.84 
 
 		 710 aa  139  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.607095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1108  alpha-glucosidase  24.82 
 
 		 676 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2017  alpha-glucosidase  23.7 
 
 		 702 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.248833  hitchhiker  0.00490164 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2329  alpha-glucosidase  23.7 
 
 		 710 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.20719  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5767  putative alpha-glucosidase  23.63 
 
 		 711 aa  134  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2329  alpha-glucosidase  23.03 
 
 		 710 aa  134  6e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0626  alpha-glucosidase  21.78 
 
 		 727 aa  130  8.000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1419  Glycoside hydrolase 97  26.33 
 
 		 648 aa  127  9e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.067122  normal  0.614514 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0928  hypothetical protein  21.89 
 
 		 728 aa  121  3.9999999999999996e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.453447  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1460  Protein of unknown function DUF2223  22.78 
 
 		 1255 aa  105  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>