181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3158 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3158  phycobiliprotein, putative  100 
 
 
320 aa  608  1e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5008  HEAT repeat-containing PBS lyase  67.73 
 
 
321 aa  359  4e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34930  putative phycobiliprotein  64.4 
 
 
321 aa  325  5e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000771282  normal  0.964295 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0210  phycobiliprotein, putative  69.97 
 
 
321 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.203679 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1962  HEAT repeat-containing PBS lyase  56.09 
 
 
331 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.626659  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1889  HEAT repeat-containing PBS lyase  55.59 
 
 
331 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.826607  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5289  HEAT repeat-containing PBS lyase  56.13 
 
 
331 aa  265  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.460967  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2001  HEAT repeat-containing PBS lyase  57.43 
 
 
334 aa  258  7e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6100  HEAT repeat-containing PBS lyase  56.76 
 
 
331 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1977  heat domain-containing protein  56.76 
 
 
331 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237799  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4203  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  55.56 
 
 
319 aa  253  3e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4091  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  55.56 
 
 
319 aa  253  3e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0472779  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1293  HEAT repeat-containing PBS lyase  56.57 
 
 
333 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.737747  normal  0.270405 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0676  HEAT repeat-containing PBS lyase  42.49 
 
 
320 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.401005 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6151  HEAT repeat-containing PBS lyase  43.89 
 
 
321 aa  194  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3349  heat domain-containing protein  44.08 
 
 
319 aa  191  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364347  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4189  HEAT domain containing protein  43.42 
 
 
319 aa  186  4e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4198  HEAT domain containing protein  42.36 
 
 
321 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1480  HEAT repeat-containing protein  43.05 
 
 
325 aa  183  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3674  HEAT domain containing protein  42.86 
 
 
323 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.631029  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2803  HEAT repeat-containing PBS lyase  43.62 
 
 
320 aa  172  6.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.873153 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4882  hypothetical protein  44.16 
 
 
316 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.453587  normal  0.143497 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  32.04 
 
 
1094 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  32.36 
 
 
1148 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  29.28 
 
 
546 aa  99.4  7e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.71 
 
 
1343 aa  97.1  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  28.84 
 
 
958 aa  95.9  8e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1415  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  34 
 
 
220 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1381  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  34 
 
 
220 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.38 
 
 
490 aa  94.4  3e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.51 
 
 
510 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  34.35 
 
 
1224 aa  90.5  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.68 
 
 
313 aa  89.4  8e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  33 
 
 
395 aa  89.4  8e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4073  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.92 
 
 
325 aa  87.8  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.578065 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  26.98 
 
 
493 aa  84.3  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1323  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.5 
 
 
212 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.490996  normal  0.334378 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4762  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.66 
 
 
223 aa  82.4  0.000000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.122338  normal  0.117024 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0572  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.26 
 
 
223 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  31.6 
 
 
501 aa  80.9  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.26 
 
 
1181 aa  78.2  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4548  HEAT repeat-containing PBS lyase  29 
 
 
226 aa  77.8  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1721  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.5 
 
 
234 aa  77.4  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  40.44 
 
 
1438 aa  74.3  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0987  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.31 
 
 
285 aa  73.6  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.322977  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  28.96 
 
 
959 aa  72.8  0.000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  29.77 
 
 
644 aa  70.9  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0753  HEAT domain containing protein  30.23 
 
 
838 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.75 
 
 
399 aa  68.9  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.66 
 
 
524 aa  67  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1572  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.47 
 
 
377 aa  65.9  0.0000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0581284  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2016  SH3 type 3 domain-containing protein  34.29 
 
 
773 aa  64.7  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000554023  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2596  Scaffold protein Nfu/NifU  33.12 
 
 
381 aa  64.7  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1752  hypothetical protein  33.17 
 
 
250 aa  63.5  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.253022 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2017  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.87 
 
 
375 aa  62.8  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537402  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1988  HEAT-like repeat-containing protein  31.87 
 
 
375 aa  62.8  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00393125  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1970  HEAT-like repeat-containing protein  31.87 
 
 
375 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000496262  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2171  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.87 
 
 
375 aa  62.8  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0184822  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2732  HEAT domain containing protein  34.52 
 
 
1133 aa  62.4  0.000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1862  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.85 
 
 
157 aa  62.8  0.000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.715493 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0458  serine/threonine protein kinase  28.22 
 
 
593 aa  62  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3139  PBS lyase HEAT-like repeat domain protein  32.72 
 
 
375 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000640173  normal  0.0140567 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2194  PBS lyase HEAT-like repeat domain protein  32.47 
 
 
375 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0153783 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0940  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.06 
 
 
408 aa  62.4  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2177  PBS lyase HEAT-like repeat domain protein  32.72 
 
 
375 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000513448  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2314  PBS lyase HEAT-like repeat domain protein  32.72 
 
 
375 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000816736  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0675  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.24 
 
 
323 aa  61.2  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0697  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  34.12 
 
 
208 aa  61.6  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0575876  normal  0.921461 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0469  HEAT domain containing protein  40.29 
 
 
374 aa  60.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.421538 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1616  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.8 
 
 
375 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000382095  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2231  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.32 
 
 
335 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000135622  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0754  hypothetical protein  30.39 
 
 
199 aa  59.7  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000250438  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5071  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  36.96 
 
 
831 aa  59.3  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.886653  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2006  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.97 
 
 
375 aa  59.3  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000482717  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3137  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.43 
 
 
370 aa  59.3  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000055982  hitchhiker  0.00466606 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.08 
 
 
192 aa  59.3  0.00000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1151  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.41 
 
 
642 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4511  HEAT domain containing protein  26.27 
 
 
286 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.715352  normal  0.801323 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.78 
 
 
1139 aa  57.8  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2192  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.46 
 
 
176 aa  57.4  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3676  HEAT domain containing protein  31.97 
 
 
886 aa  57.4  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000145397 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3615  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.28 
 
 
221 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23751  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5719  HEAT domain containing protein  28.03 
 
 
299 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2690  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.55 
 
 
232 aa  55.8  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0127412  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0251  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.96 
 
 
408 aa  55.8  0.0000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.169018  normal  0.0104715 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2826  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.62 
 
 
157 aa  55.8  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0826  heat domain-containing protein  32.75 
 
 
1328 aa  55.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851003  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2149  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.26 
 
 
390 aa  55.1  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0382  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.33 
 
 
221 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.651057 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1888  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.74 
 
 
220 aa  54.3  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.628238 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1251  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.33 
 
 
162 aa  53.5  0.000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0973  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  34.06 
 
 
857 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0022485  normal  0.0798851 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1572  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.05 
 
 
642 aa  53.5  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143951  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0946  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  34.06 
 
 
857 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1378  HEAT domain containing protein  28.78 
 
 
643 aa  53.5  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.905373  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3050  NTPase (NACHT family)-like protein  34.8 
 
 
2216 aa  53.9  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.512729 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0925  hypothetical protein  30.18 
 
 
517 aa  53.5  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0512  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  35.8 
 
 
251 aa  53.5  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18791  hypothetical protein  29.09 
 
 
269 aa  53.5  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.16399  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3571  signal transduction protein  26.52 
 
 
2194 aa  53.1  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>