58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3685 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3685  von Willebrand factor type A  100 
 
 
212 aa  436  1e-121  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.523422  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0568  von Willebrand factor type A  88.21 
 
 
233 aa  375  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0506  putative tellurium resistance protein  88.21 
 
 
212 aa  374  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1088  putative tellurium resistance protein  87.74 
 
 
222 aa  373  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4667  von Willebrand factor, type A  64.93 
 
 
213 aa  296  1e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.40968  normal  0.0500765 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0629  hypothetical protein  50.71 
 
 
225 aa  233  1.0000000000000001e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1170  von Willebrand factor type A  52.83 
 
 
211 aa  222  3e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.906773 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1166  von Willebrand factor type A  50 
 
 
212 aa  201  6e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4669  von Willebrand factor, type A  51.32 
 
 
212 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.264174  normal  0.0341202 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3687  von Willebrand factor type A  48.15 
 
 
212 aa  193  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.189845  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0628  hypothetical protein  47.22 
 
 
212 aa  190  1e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1086  putative tellurium resistance protein  47.62 
 
 
212 aa  187  9e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0570  von Willebrand factor type A  47.62 
 
 
212 aa  187  9e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0508  putative tellurium resistance protein  47.62 
 
 
212 aa  187  9e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2991  von Willebrand factor type A  42.25 
 
 
219 aa  167  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00948375  normal  0.342829 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1089  putative tellurium resistance protein  35.75 
 
 
346 aa  135  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0567  von Willebrand factor type A  35.75 
 
 
346 aa  135  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0505  putative tellurium resistance protein  35.75 
 
 
346 aa  135  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3684  von Willebrand factor type A  37.37 
 
 
346 aa  135  5e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.497723  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4666  von Willebrand factor, type A  36.41 
 
 
350 aa  132  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.404551  normal  0.0464435 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1172  von Willebrand factor type A  37.43 
 
 
352 aa  124  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0630  hypothetical protein  36.04 
 
 
343 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1917  von Willebrand factor, type A  30.95 
 
 
1204 aa  85.1  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.137165 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0637  von Willebrand factor, type A  31.66 
 
 
224 aa  78.2  0.00000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2368  von Willebrand factor, type A  30.52 
 
 
220 aa  72.8  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4203  von Willebrand factor type A  32.28 
 
 
244 aa  72.8  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.258867  normal  0.0187609 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1103  von Willebrand factor, type A  31.65 
 
 
224 aa  72  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0810  von Willebrand factor, type A  29.59 
 
 
233 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0134  von Willebrand factor, type A  31.58 
 
 
218 aa  71.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.864003  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3137  von Willebrand factor type A  28.77 
 
 
224 aa  70.5  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3006  hypothetical protein  31.92 
 
 
222 aa  69.7  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1498  von Willebrand factor type A  30.58 
 
 
228 aa  68.6  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01967  hypothetical protein  34.72 
 
 
219 aa  67.4  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01978  hypothetical protein  34.72 
 
 
219 aa  67.4  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3010  von Willebrand factor type A domain protein  34.72 
 
 
219 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.136954 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0987  von Willebrand factor type A domain-containing protein  34.72 
 
 
219 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.233145 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2365  von Willebrand factor type A domain-containing protein  34.72 
 
 
219 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2107  von Willebrand factor type A  36.15 
 
 
254 aa  66.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1584  von Willebrand factor type A  34.15 
 
 
219 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.154972  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2215  von Willebrand factor type A domain-containing protein  34.15 
 
 
219 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1568  von Willebrand factor type A  34.15 
 
 
219 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.921097  normal  0.435058 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1643  von Willebrand factor type A  30.25 
 
 
223 aa  65.9  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4762  von Willebrand factor type A domain protein  26.52 
 
 
224 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0560  von Willebrand factor type A  29.8 
 
 
230 aa  65.1  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2499  von Willebrand factor type A  27.69 
 
 
225 aa  64.7  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.950174  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2880  von Willebrand factor type A domain protein  27.69 
 
 
225 aa  64.7  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.158441  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1160  von Willebrand factor type A domain protein  34.03 
 
 
219 aa  63.9  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2727  von Willebrand factor, type A  26.7 
 
 
233 aa  61.2  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7176  von Willebrand factor type A  31.45 
 
 
238 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.135257  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5987  von Willebrand factor, type A  30.33 
 
 
248 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.919016  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4255  von Willebrand factor, type A  27.64 
 
 
240 aa  60.5  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0408  von Willebrand factor type A  27 
 
 
236 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04030  hypothetical protein  29.71 
 
 
268 aa  50.1  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.827686 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0482  von Willebrand factor type A  22.46 
 
 
222 aa  50.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04060  hypothetical protein  28.71 
 
 
272 aa  49.7  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.151575 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3582  hypothetical protein  26.85 
 
 
202 aa  45.4  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857055  normal  0.123891 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2191  von Willebrand factor type A  33.33 
 
 
546 aa  42.4  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2129  von Willebrand factor type A  25.91 
 
 
833 aa  42  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>