More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2532 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2532  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  100 
 
 
370 aa  767    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2219  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  98.11 
 
 
370 aa  751    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3234  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  79.73 
 
 
370 aa  626  1e-178  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0826  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  52.07 
 
 
371 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1716  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  49.05 
 
 
375 aa  379  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2438  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  47.47 
 
 
370 aa  349  4e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.502974  normal  0.215432 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3489  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  47.62 
 
 
368 aa  347  2e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2859  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  46.35 
 
 
370 aa  338  8e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4606  N-acylamino acid racemase; O-succinylbenzoate synthase  48.27 
 
 
368 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.820644  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4992  N-acylamino acid racemase  46.76 
 
 
368 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4746  N-acylamino acid racemase  48.27 
 
 
368 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5107  N-acylamino acid racemase  48.27 
 
 
368 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4981  N-acylamino acid racemase  47.04 
 
 
368 aa  335  1e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4964  N-acylamino acid racemase  47.69 
 
 
368 aa  333  4e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4584  enolase superfamily protein; N-acylamino acid racemase, mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme, or o-succinylbenzoate synthase  47.69 
 
 
368 aa  331  1e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5011  N-acylamino acid racemase  46.48 
 
 
368 aa  330  2e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2645  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  44.54 
 
 
369 aa  330  2e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0256  N-acylamino acid racemase  46.76 
 
 
368 aa  330  2e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0874695  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4693  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  47.98 
 
 
368 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2187  O-succinylbenzoate synthase  42.51 
 
 
369 aa  320  3e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3834  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  42.42 
 
 
370 aa  309  5e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.28158  normal  0.496485 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0393  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  43.79 
 
 
369 aa  307  2.0000000000000002e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0183441  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1741  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  44.54 
 
 
370 aa  306  3e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1827  o-succinylbenzoic acid (OSB) synthetase  43.6 
 
 
372 aa  304  1.0000000000000001e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.243461  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4256  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  41.78 
 
 
368 aa  304  2.0000000000000002e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.165898 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2001  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  43.32 
 
 
368 aa  297  2e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.974655 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5705  O-succinylbenzoate synthase  42.82 
 
 
366 aa  285  7e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0212408  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5041  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  41 
 
 
369 aa  283  3.0000000000000004e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6822  O-succinylbenzoic acid synthetase  42.23 
 
 
366 aa  280  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4363  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  40.92 
 
 
377 aa  277  2e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6166  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  39.78 
 
 
371 aa  271  1e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1156  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  41.06 
 
 
370 aa  271  2e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0263  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  39.13 
 
 
370 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.161308  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0823  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.29 
 
 
372 aa  267  2e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0936  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  41.8 
 
 
380 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3832  o-succinylbenzoate synthase  40.79 
 
 
370 aa  256  4e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0404  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.8 
 
 
377 aa  242  7e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.125828  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5272  O-succinylbenzoate synthase  41.11 
 
 
369 aa  241  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.132905  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1544  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.16 
 
 
391 aa  202  5e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000155525 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0960  O-succinylbenzoate synthase  28.57 
 
 
376 aa  189  5e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0769  O-succinylbenzoate synthase  29 
 
 
370 aa  177  3e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0474  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.01 
 
 
378 aa  169  8e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00120292  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2971  AMP-dependent synthetase and ligase  30.29 
 
 
955 aa  158  1e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0754  O-succinylbenzoate synthase  28.61 
 
 
366 aa  154  2.9999999999999998e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0655  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.77 
 
 
377 aa  147  3e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0621  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.67 
 
 
385 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2633  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.44 
 
 
351 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000000601605  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1925  hypothetical protein  29.01 
 
 
367 aa  127  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14010  o-succinylbenzoic acid synthetase  24.77 
 
 
1027 aa  123  5e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2396  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  28.45 
 
 
386 aa  122  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.42613  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1938  hypothetical protein  28.45 
 
 
367 aa  121  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2170  O-succinylbenzoate-CoA synthase  28.9 
 
 
331 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0963  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.45 
 
 
355 aa  120  3.9999999999999996e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2140  mandelate racemase/muconate lactonizing family protein  27.7 
 
 
368 aa  119  7e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.218798  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6462  O-succinylbenzoate-CoA synthase  31.33 
 
 
334 aa  116  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.65002  normal  0.0142854 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0339  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.3 
 
 
364 aa  115  8.999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3171  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.5 
 
 
356 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2610  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  29.48 
 
 
350 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.562988  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4975  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.23 
 
 
370 aa  113  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0890752 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1129  chloromuconate cycloisomerase  24.73 
 
 
370 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2578  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  29.19 
 
 
350 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.15317  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2431  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  28.41 
 
 
353 aa  110  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.784789 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2856  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  28.9 
 
 
350 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193797 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0897  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  26.97 
 
 
387 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.129101  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1837  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.18 
 
 
356 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.106418  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2898  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  28.9 
 
 
350 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2879  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.62 
 
 
350 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00129652  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2863  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  28.12 
 
 
353 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1442  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.85 
 
 
365 aa  107  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0207  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.45 
 
 
346 aa  106  7e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1357  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.47 
 
 
367 aa  106  7e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.823461  normal  0.108147 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2652  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.87 
 
 
350 aa  105  9e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.59335  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1409  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  23.98 
 
 
367 aa  105  9e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435097  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0313  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.2 
 
 
371 aa  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0239  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  32.27 
 
 
372 aa  104  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0232  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  32.27 
 
 
372 aa  103  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1375  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  23.71 
 
 
367 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.992091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1393  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  23.71 
 
 
367 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0343363  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2659  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  28.32 
 
 
350 aa  103  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478585  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2850  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  28.32 
 
 
350 aa  103  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3758  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.24 
 
 
367 aa  103  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.379119  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0319  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.35 
 
 
369 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5793  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.97 
 
 
390 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3550  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  27.33 
 
 
376 aa  102  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0951632  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3658  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.38 
 
 
360 aa  100  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1855  L-alanine-DL-glutamate epimerase/enolase superfamily-like protein  29.47 
 
 
376 aa  100  3e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000301003 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1717  putative racemase  30.93 
 
 
359 aa  100  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.640537  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04247  chloromuconate cycloisomerase  28.05 
 
 
356 aa  100  5e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1870  muconate and chloromuconate cycloisomerase  25.47 
 
 
395 aa  100  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4932  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  23.16 
 
 
369 aa  100  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.318001  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03930  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  27.99 
 
 
380 aa  100  6e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0386  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  23.16 
 
 
369 aa  99.4  8e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542281  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0199  muconate and chloromuconate cycloisomerase  25 
 
 
409 aa  99.4  9e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0158  muconate and chloromuconate cycloisomerase  24.73 
 
 
400 aa  99  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5455  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.94 
 
 
369 aa  99  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.262852  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4454  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  26.1 
 
 
385 aa  98.6  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6193  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.76 
 
 
425 aa  97.8  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.281448  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  23.16 
 
 
369 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6060  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.27 
 
 
386 aa  98.6  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3395  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  28.14 
 
 
369 aa  98.6  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.446671 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>