More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4055 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_4055  gamma-glutamyl kinase  100 
 
 		 370 aa  728    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.762556 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3803  gamma-glutamyl kinase  73.42 
 
 		 374 aa  531  1e-150  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.199789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3823  gamma-glutamyl kinase  73.7 
 
 		 370 aa  530  1e-149  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3515  gamma-glutamyl kinase  73.7 
 
 		 374 aa  530  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1467  gamma-glutamyl kinase  71.51 
 
 		 368 aa  496  1e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.148048  normal  0.0401015 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1204  gamma-glutamyl kinase  68.22 
 
 		 368 aa  493  9.999999999999999e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.986677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2284  gamma-glutamyl kinase  67.13 
 
 		 368 aa  452  1.0000000000000001e-126  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.561668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3186  gamma-glutamyl kinase  59.68 
 
 		 382 aa  427  1e-118  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4199  gamma-glutamyl kinase  60 
 
 		 389 aa  425  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.229237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4281  gamma-glutamyl kinase  58.33 
 
 		 392 aa  422  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3875  gamma-glutamyl kinase  58.9 
 
 		 389 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0186948 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1479  glutamate 5-kinase  60.66 
 
 		 385 aa  420  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4727  gamma-glutamyl kinase  59.19 
 
 		 373 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177686  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0234  gamma-glutamyl kinase  60.32 
 
 		 383 aa  410  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4216  gamma-glutamyl kinase  58.65 
 
 		 373 aa  411  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.643117  normal  0.0334749 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3010  gamma-glutamyl kinase  56.99 
 
 		 393 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0104  gamma-glutamyl kinase  57.3 
 
 		 371 aa  404  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.727699 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0318  gamma-glutamyl kinase  53.23 
 
 		 379 aa  393  1e-108  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1844  gamma-glutamyl kinase  58.2 
 
 		 378 aa  386  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3457  gamma-glutamyl kinase  58.08 
 
 		 390 aa  387  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1055  gamma-glutamyl kinase  57.65 
 
 		 378 aa  385  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.28093  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1777  gamma-glutamyl kinase  58.2 
 
 		 378 aa  386  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0414  gamma-glutamyl kinase  55.16 
 
 		 377 aa  385  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.51376  normal  0.239397 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0422  gamma-glutamyl kinase  55.01 
 
 		 378 aa  387  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3279  gamma-glutamyl kinase  54.69 
 
 		 387 aa  382  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0202139 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1239  gamma-glutamyl kinase  56.82 
 
 		 375 aa  382  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133764  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0158  gamma-glutamyl kinase  54.47 
 
 		 376 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2867  gamma-glutamyl kinase  56.99 
 
 		 377 aa  379  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2987  gamma-glutamyl kinase  57.61 
 
 		 396 aa  378  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.580531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3093  gamma-glutamyl kinase  56.99 
 
 		 377 aa  379  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347517  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0252  gamma-glutamyl kinase  54.62 
 
 		 376 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0518  gamma-glutamyl kinase  53.95 
 
 		 379 aa  375  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.634627  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2056  gamma-glutamyl kinase  53.39 
 
 		 386 aa  373  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182118  normal  0.821668 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0443  gamma-glutamyl kinase  52.17 
 
 		 379 aa  368  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0574  gamma-glutamyl kinase  54.62 
 
 		 376 aa  359  5e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.10334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0158  gamma-glutamyl kinase  53.8 
 
 		 376 aa  355  7.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.169328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4713  gamma-glutamyl kinase  56.23 
 
 		 377 aa  322  8e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.237693 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2790  glutamate 5-kinase  51.37 
 
 		 373 aa  321  9.999999999999999e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3896  gamma-glutamyl kinase  52.21 
 
 		 380 aa  317  3e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3209  glutamate 5-kinase  47.86 
 
 		 375 aa  306  3e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  46.59 
 
 		 376 aa  301  9e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2249  gamma-glutamyl kinase  48.35 
 
 		 374 aa  301  1e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3212  gamma-glutamyl kinase  48.5 
 
 		 373 aa  300  3e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226676  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  47.68 
 
 		 372 aa  299  5e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  46.22 
 
 		 373 aa  299  6e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3779  gamma-glutamyl kinase  48.46 
 
 		 373 aa  296  5e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000615506  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  46.32 
 
 		 390 aa  295  8e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1630  gamma-glutamyl kinase  47.7 
 
 		 371 aa  294  2e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40760  gamma-glutamyl kinase  46.15 
 
 		 368 aa  293  4e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0344  gamma-glutamyl kinase  45.75 
 
 		 376 aa  293  4e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000011704  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1843  gamma-glutamyl kinase  47.28 
 
 		 372 aa  292  6e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.505967  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0477  gamma-glutamyl kinase  48.77 
 
 		 378 aa  291  9e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.192225  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0836  gamma-glutamyl kinase  45.41 
 
 		 378 aa  291  1e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.986604  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4215  gamma-glutamyl kinase  46.98 
 
 		 379 aa  291  1e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.373076  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3863  gamma-glutamyl kinase  48.18 
 
 		 373 aa  290  2e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.69297 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4235  glutamate 5-kinase  46.61 
 
 		 374 aa  289  4e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0018529  hitchhiker  0.00000138199 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  43.99 
 
 		 373 aa  290  4e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1845  gamma-glutamyl kinase  48.51 
 
 		 376 aa  289  6e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.471089  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3669  gamma-glutamyl kinase  46.7 
 
 		 372 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0702726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5205  gamma-glutamyl kinase  45.11 
 
 		 372 aa  286  4e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0267  glutamate 5-kinase  46.15 
 
 		 390 aa  285  8e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192015  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60420  gamma-glutamyl kinase  45.11 
 
 		 372 aa  285  9e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000360617 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1146  gamma-glutamyl kinase  52.76 
 
 		 377 aa  284  1.0000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  44.96 
 
 		 373 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0748  gamma-glutamyl kinase  44.86 
 
 		 378 aa  284  2.0000000000000002e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00331357 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2654  gamma-glutamyl kinase  48.63 
 
 		 374 aa  283  5.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00506525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0089  glutamate 5-kinase  43.44 
 
 		 376 aa  282  8.000000000000001e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.512468  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2008  glutamate 5-kinase  45.45 
 
 		 376 aa  281  9e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.426925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3036  gamma-glutamyl kinase  45.45 
 
 		 375 aa  281  1e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.684546  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3064  gamma-glutamyl kinase  48.63 
 
 		 374 aa  281  1e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.371961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3274  gamma-glutamyl kinase  48.23 
 
 		 372 aa  281  1e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170684 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5483  gamma-glutamyl kinase  45.01 
 
 		 382 aa  281  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.494912  normal  0.488167 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2216  gamma-glutamyl kinase  46.09 
 
 		 372 aa  281  2e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0240462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1271  gamma-glutamyl kinase  44.78 
 
 		 378 aa  280  4e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100381  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3103  gamma-glutamyl kinase  46.32 
 
 		 372 aa  280  4e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2955  gamma-glutamyl kinase  46.05 
 
 		 372 aa  279  5e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00239  gamma-glutamyl kinase  44.2 
 
 		 367 aa  278  1e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3365  glutamate 5-kinase  44.2 
 
 		 367 aa  278  1e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00242  hypothetical protein  44.2 
 
 		 367 aa  278  1e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0287  gamma-glutamyl kinase  44.2 
 
 		 367 aa  278  1e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.406641  normal  0.77952 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0481  gamma-glutamyl kinase  41.94 
 
 		 406 aa  278  1e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.719126 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0296  gamma-glutamyl kinase  44.2 
 
 		 367 aa  278  1e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410823 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0274  gamma-glutamyl kinase  44.2 
 
 		 367 aa  278  1e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.221134  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0269  gamma-glutamyl kinase  44.2 
 
 		 367 aa  278  1e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3339  gamma-glutamyl kinase  44.2 
 
 		 367 aa  278  1e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0239  gamma-glutamyl kinase  44.2 
 
 		 367 aa  278  1e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3679  gamma-glutamyl kinase  45.38 
 
 		 372 aa  278  2e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1143  gamma-glutamyl kinase  46.98 
 
 		 372 aa  277  3e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0768  gamma-glutamyl kinase  43.53 
 
 		 367 aa  276  3e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0787621 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0510  gamma-glutamyl kinase  46.7 
 
 		 372 aa  276  4e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596992  normal  0.92203 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2649  gamma-glutamyl kinase  46.43 
 
 		 372 aa  276  4e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1080  glutamate 5-kinase  46.65 
 
 		 377 aa  276  5e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.068481 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  42.82 
 
 		 372 aa  276  5e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1302  gamma-glutamyl kinase  46.98 
 
 		 372 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3486  gamma-glutamyl kinase  46.98 
 
 		 372 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920567  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3521  gamma-glutamyl kinase  46.98 
 
 		 372 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.204583  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3523  gamma-glutamyl kinase  46.98 
 
 		 394 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0443  gamma-glutamyl kinase  46.98 
 
 		 372 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3261  gamma-glutamyl kinase  46.98 
 
 		 372 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3349  glutamate 5-kinase  49.17 
 
 		 377 aa  275  1.0000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0434084  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>