More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0202 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0202  flavin reductase domain-containing protein  100 
 
 		 176 aa  352  1e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.635021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4109  flavin reductase domain-containing protein  41.77 
 
 		 162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0225  flavin reductase domain-containing protein  41.98 
 
 		 180 aa  124  7e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0853  flavin reductase domain-containing protein  41.82 
 
 		 185 aa  118  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6111  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.16 
 
 		 374 aa  106  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.575038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2059  flavin reductase-like, FMN-binding  36.08 
 
 		 170 aa  104  6e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000136887  normal  0.155549 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1544  flavin reductase-like, FMN-binding  33.73 
 
 		 174 aa  102  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.917406  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2298  flavin reductase domain-containing protein  39.24 
 
 		 226 aa  101  6e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2385  flavin reductase-like, FMN-binding  33.99 
 
 		 162 aa  99.8  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.289949  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2006  flavin reductase domain-containing protein  37.5 
 
 		 203 aa  96.3  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1403  flavin reductase domain-containing protein  37.5 
 
 		 228 aa  96.3  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5724  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.36 
 
 		 179 aa  96.3  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3059  flavin reductase domain-containing protein  37.5 
 
 		 228 aa  95.9  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7128  flavoprotein oxidoreductase  34.44 
 
 		 167 aa  96.3  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1029  flavin reductase domain-containing protein  37.5 
 
 		 226 aa  95.9  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.736467  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2295  flavin reductase domain-containing protein  37.5 
 
 		 226 aa  95.9  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3186  flavin reductase domain-containing protein  37.5 
 
 		 226 aa  95.9  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.528706  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1316  flavin reductase domain-containing protein  37.5 
 
 		 226 aa  95.9  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1415  flavin reductase-like, FMN-binding  31.85 
 
 		 172 aa  93.6  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0331151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3755  flavin reductase-like, FMN-binding  35.76 
 
 		 154 aa  93.2  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3957  flavoprotein oxidoreductase  34.9 
 
 		 175 aa  90.1  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6600  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  35.61 
 
 		 430 aa  90.1  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2575  flavin reductase domain-containing protein  35.62 
 
 		 169 aa  90.1  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1003  flavin reductase-like, FMN-binding  38.13 
 
 		 173 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3898  flavin reductase-like, FMN-binding  31.61 
 
 		 176 aa  89  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.69994 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1705  flavin reductase domain-containing protein  33.55 
 
 		 170 aa  89  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.190876 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5770  flavin reductase-like, FMN-binding  31.06 
 
 		 183 aa  88.6  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3189  flavin reductase domain-containing protein  32.7 
 
 		 172 aa  88.6  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1153  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  33.08 
 
 		 180 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1380  putative oxygenase  35.07 
 
 		 166 aa  87  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.436  normal  0.571719 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0697  flavin reductase-like, FMN-binding  35.1 
 
 		 174 aa  85.1  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.318628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1006  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase small chain  29.94 
 
 		 170 aa  84.3  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3173  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.44 
 
 		 155 aa  82.8  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.213746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0995  flavin reductase-like  32.33 
 
 		 178 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1331  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  33.76 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0131046  normal  0.0375915 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0349  flavin reductase domain-containing protein  29.87 
 
 		 160 aa  82.4  0.000000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0945  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  33.11 
 
 		 170 aa  81.6  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.930099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10990  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase small chain  29.94 
 
 		 170 aa  81.6  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.699106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2278  flavin reductase domain-containing protein  30 
 
 		 170 aa  81.3  0.000000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.663724 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0686  flavin reductase-like, FMN-binding  35.61 
 
 		 193 aa  81.3  0.000000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.520782  normal  0.880219 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3100  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  29.11 
 
 		 155 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4843  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.88 
 
 		 180 aa  79.3  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6858  flavin reductase-like, FMN-binding  32.74 
 
 		 175 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1830  flavin reductase domain-containing protein  29.11 
 
 		 167 aa  80.1  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0710863  normal  0.62797 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4322  flavin reductase domain-containing protein  28.67 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1106  flavin reductase-like, FMN-binding  38.24 
 
 		 173 aa  79  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.321657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0847  flavin reductase protein  27.63 
 
 		 171 aa  79  0.00000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.543841 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2517  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  33.13 
 
 		 174 aa  78.6  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1893  flavin reductase domain-containing protein  33.1 
 
 		 196 aa  77.8  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2213  flavin reductase domain-containing protein  27.16 
 
 		 165 aa  77.8  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1292  monooxygenase, putative  34.51 
 
 		 173 aa  77.4  0.00000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1520  flavin reductase domain-containing protein  30.38 
 
 		 164 aa  77.4  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.377691 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1255  putative monooxygenase  34.51 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.218566  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1486  flavin reductase domain-containing protein  29.41 
 
 		 166 aa  76.6  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0134699 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5076  flavin reductase domain-containing protein  28.97 
 
 		 175 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.848453  normal  0.150836 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4187  flavin reductase domain-containing protein  28 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.344162  hitchhiker  0.00000247222 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01010  predicted oxidoreductase, flavin:NADH component  29.19 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1125  putative flavin reductase rutF  29.19 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2588  flavin reductase domain-containing protein  29.19 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0976378 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1122  putative flavin reductase rutF  29.19 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3295  putative monooxygenase/flavin reductase-like, FMN-binding  30.25 
 
 		 190 aa  75.5  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.940039  normal  0.148638 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01017  hypothetical protein  29.19 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2118  putative flavin reductase rutF  29.19 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1244  putative flavin reductase rutF  29.19 
 
 		 164 aa  74.7  0.0000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2635  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  28.57 
 
 		 164 aa  73.6  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5501  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.33 
 
 		 311 aa  73.6  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4641  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.29 
 
 		 179 aa  73.6  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5477  hypothetical protein  32.03 
 
 		 182 aa  72.8  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0934  flavin reductase domain-containing protein  30.86 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.351151  normal  0.609948 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2080  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.41 
 
 		 175 aa  73.6  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2053  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.08 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.490233  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0442  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.49 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1955  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.14 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.925053  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6441  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.3 
 
 		 179 aa  72.4  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0182942 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0510  flavin reductase domain-containing protein  32.91 
 
 		 174 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.094349  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5217  flavoprotein oxidoreductase  30.77 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00765  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  31.72 
 
 		 176 aa  72  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3246  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.06 
 
 		 172 aa  72  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.376116 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3021  flavin reductase domain-containing protein  32.06 
 
 		 172 aa  72  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0740785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1734  flavin reductase domain-containing protein  29.32 
 
 		 202 aa  72  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.521212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1289  flavin reductase-like, FMN-binding  30.38 
 
 		 164 aa  72  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.100023  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3225  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.97 
 
 		 169 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0712  flavin reductase-like, FMN-binding  27.81 
 
 		 169 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3210  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.06 
 
 		 184 aa  71.2  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5028  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.11 
 
 		 181 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.296353  normal  0.178556 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2625  flavin reductase domain-containing protein  29.41 
 
 		 175 aa  70.9  0.000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0903  flavin reductase-like, FMN-binding  27.63 
 
 		 171 aa  70.9  0.000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.426778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2035  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.58 
 
 		 166 aa  70.5  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2880  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.19 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4906  flavin reductase-like, FMN-binding  31.65 
 
 		 193 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1858  GntR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 393 aa  70.5  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3257  flavin reductase domain-containing protein  31.65 
 
 		 193 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1057  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  30.56 
 
 		 170 aa  69.7  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2356  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  26.62 
 
 		 165 aa  70.1  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0635  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  28.28 
 
 		 171 aa  69.7  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.543019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1727  putative flavoprotein oxidoreductase  26.11 
 
 		 168 aa  69.3  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1162  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  30.56 
 
 		 170 aa  69.7  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.444908  normal  0.733145 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1173  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  30.56 
 
 		 170 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1781  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.42 
 
 		 170 aa  69.7  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000326211 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1639  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  26.62 
 
 		 165 aa  70.1  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>