239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1607 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1607  biotin synthase  100 
 
 		 337 aa  695    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.18444  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1722  biotin synthase  64.99 
 
 		 348 aa  450  1e-125  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000337366  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1491  biotin synthase  62.61 
 
 		 357 aa  441  1e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1632  biotin synthase  58.11 
 
 		 356 aa  386  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000234633  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1844  biotin synthase  56.8 
 
 		 360 aa  387  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2647  biotin synthase  47.01 
 
 		 351 aa  311  1e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000036845  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0563  biotin synthase  45.7 
 
 		 345 aa  305  5.0000000000000004e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.295179  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19160  biotin synthase  46.73 
 
 		 350 aa  296  3e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0257647  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2462  biotin synthase  46.27 
 
 		 347 aa  296  4e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2775  biotin synthase  46.27 
 
 		 347 aa  295  5e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1735  biotin synthase  47.18 
 
 		 350 aa  290  3e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00262623  normal  0.855022 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0240  biotin synthase  44.85 
 
 		 349 aa  280  2e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0181  Radical SAM domain protein  44.86 
 
 		 349 aa  271  1e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2151  biotin synthase  41.76 
 
 		 354 aa  271  1e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1597  biotin synthase  41.69 
 
 		 341 aa  268  1e-70  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1551  biotin synthase  42.43 
 
 		 348 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1100  Radical SAM domain protein  41.76 
 
 		 364 aa  266  5e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00787041  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1502  biotin synthase  42.94 
 
 		 348 aa  263  3e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000209115  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0271  Radical SAM domain protein  42.34 
 
 		 347 aa  263  4e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.195415  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1130  biotin synthase  43.44 
 
 		 352 aa  260  2e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000236268  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2083  biotin synthase  40.65 
 
 		 372 aa  255  8e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0841  biotin synthase  43.28 
 
 		 344 aa  254  1.0000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1839  biotin synthase  42.49 
 
 		 353 aa  248  1e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0814889  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1329  radical SAM domain-containing protein  39.47 
 
 		 346 aa  247  2e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000017523 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1388  biotin synthase  44.48 
 
 		 323 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00378301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0166  radical SAM domain-containing protein  44.31 
 
 		 370 aa  245  6e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.372295  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1244  Radical SAM domain protein  42.14 
 
 		 360 aa  236  4e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3189  biotin synthase  39.58 
 
 		 345 aa  236  4e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000310414  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1504  biotin synthase  47.02 
 
 		 331 aa  236  6e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3925  biotin synthase  43 
 
 		 359 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1863  radical SAM domain-containing protein  42.03 
 
 		 380 aa  234  2.0000000000000002e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.176912  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0144  Radical SAM domain protein  40.26 
 
 		 352 aa  231  1e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000047373  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0706  biotin synthase  41.67 
 
 		 359 aa  226  3e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.997344  hitchhiker  0.000263623 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2277  biotin synthase  40.12 
 
 		 337 aa  223  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3255  biotin synthase  41.05 
 
 		 359 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.464529  hitchhiker  0.000014228 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16510  iron-only hydrogenase maturation protein HydE  39.33 
 
 		 351 aa  215  9.999999999999999e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1020  biotin synthase  41.78 
 
 		 311 aa  213  2.9999999999999995e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2639  Radical SAM domain protein  36.01 
 
 		 374 aa  198  1.0000000000000001e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0028  Radical SAM domain protein  28.66 
 
 		 368 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4857  Radical SAM domain protein  30.36 
 
 		 365 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1552  biotin synthase  25 
 
 		 341 aa  96.7  5e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0838  biotin synthase  28.62 
 
 		 350 aa  93.6  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1125  biotin synthase  24.68 
 
 		 341 aa  85.1  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.259042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1131  biotin synthase  24.82 
 
 		 341 aa  84  0.000000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0826  biotin synthase  24.03 
 
 		 341 aa  83.6  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.247996  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0107  biotin synthase  32.25 
 
 		 344 aa  76.6  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.156568  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1026  biotin synthase  25.49 
 
 		 344 aa  75.9  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19320  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.07 
 
 		 481 aa  75.5  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.604255  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0169  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.48 
 
 		 477 aa  72.8  0.000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000784524  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1841  thiamine biosynthesis protein ThiH  23.6 
 
 		 490 aa  71.6  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0513393  normal  0.233409 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0034  biotin synthase  28.97 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16500  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.63 
 
 		 484 aa  68.9  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1738  biotin synthase  25.18 
 
 		 349 aa  68.6  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0492  biotin synthase  27.5 
 
 		 321 aa  67.8  0.0000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.395668 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3535  biotin synthase  27.18 
 
 		 361 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.26843  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2499  biotin synthase  26.3 
 
 		 335 aa  67  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3603  biotin synthase  26.76 
 
 		 361 aa  67  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2451  biotin synthase  26.3 
 
 		 335 aa  67  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0604  biotin synthase  26.3 
 
 		 333 aa  66.2  0.0000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1928  biotin synthase  26.99 
 
 		 376 aa  66.2  0.0000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000208086  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0145  biotin and thiamin synthesis associated  25.98 
 
 		 475 aa  65.9  0.0000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000404218  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0654  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.69 
 
 		 458 aa  65.9  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1333  thiamine biosynthesis protein ThiH  22.61 
 
 		 458 aa  65.9  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000230637  unclonable  1.1198e-18 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0530  thiamine biosynthesis protein ThiH  23.05 
 
 		 466 aa  65.5  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0106  thiamine biosynthesis protein ThiH  23.71 
 
 		 473 aa  64.3  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0108  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.92 
 
 		 473 aa  63.5  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2278  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.64 
 
 		 469 aa  63.5  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.751586  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1390  thiamine biosynthesis protein ThiH  23.99 
 
 		 464 aa  62.8  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00852808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3453  biotin synthase  26.84 
 
 		 361 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.068141  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2637  biotin and thiamin synthesis associated  24.07 
 
 		 474 aa  62  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0455456  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0182  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.33 
 
 		 469 aa  62.4  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2409  biotin synthase  26.96 
 
 		 333 aa  61.6  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1877  biotin synthase  26.74 
 
 		 331 aa  61.2  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000328257  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2296  biotin synthase  25.62 
 
 		 375 aa  61.6  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.966157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0842  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.88 
 
 		 468 aa  62  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0592  radical SAM domain-containing protein  26.34 
 
 		 419 aa  61.2  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2370  biotin synthase  27.45 
 
 		 333 aa  60.8  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0124723  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0141  biotin synthase  25.64 
 
 		 368 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000566121 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0144  biotin synthase  25.72 
 
 		 368 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3104  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.05 
 
 		 470 aa  60.1  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1176  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.21 
 
 		 379 aa  59.7  0.00000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2347  biotin synthase  26.57 
 
 		 321 aa  58.5  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6472  FO synthase  27.54 
 
 		 838 aa  58.9  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1864  thiamine biosynthesis protein ThiH  20 
 
 		 471 aa  58.9  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.804214  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2150  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.28 
 
 		 489 aa  58.9  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1505  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.52 
 
 		 467 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1492  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.56 
 
 		 473 aa  58.5  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4331  biotin synthase  26.67 
 
 		 321 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000173626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2187  biotin synthase  26.67 
 
 		 367 aa  58.5  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.80903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1946  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.87 
 
 		 463 aa  57.8  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.236284  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1734  thiamine biosynthesis protein ThiH  28.12 
 
 		 467 aa  57.8  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.908145  normal  0.683505 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0238  thiamine biosynthesis protein ThiH  22.34 
 
 		 469 aa  57.4  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1175  biotin synthase  27.27 
 
 		 328 aa  57.4  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0717742  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0946  FO synthase  31.37 
 
 		 860 aa  57.4  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1795  biotin synthase  26.46 
 
 		 319 aa  57.4  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1753  biotin synthase  25.46 
 
 		 333 aa  57.4  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.65668  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1504  thiamine biosynthesis protein ThiH  22.38 
 
 		 473 aa  57.4  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0434134  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4971  biotin synthase  23.68 
 
 		 359 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819396 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1331  biotin synthase  26.83 
 
 		 328 aa  57  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0559  biotin synthase  27.09 
 
 		 299 aa  57  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000654137  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>