More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1285 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1285  guanylate kinase  100 
 
 		 210 aa  432  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000194386  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2327  guanylate kinase  58.42 
 
 		 203 aa  254  8e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000761567  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2238  guanylate kinase  58.13 
 
 		 203 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3213  guanylate kinase  59.41 
 
 		 202 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000935163  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1050  guanylate kinase  58.91 
 
 		 202 aa  252  3e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000462152 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2401  guanylate kinase  57.43 
 
 		 202 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0298091  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3162  guanylate kinase  58.91 
 
 		 202 aa  237  9e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0281521  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2286  guanylate kinase  53.47 
 
 		 202 aa  226  2e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30068  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1406  Guanylate kinase  53.93 
 
 		 202 aa  203  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.77411  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5842  guanylate kinase  52.2 
 
 		 259 aa  190  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.509377 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3894  guanylate kinase  44.74 
 
 		 200 aa  188  5e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000112061  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2084  guanylate kinase  49.74 
 
 		 207 aa  187  1e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.338387  decreased coverage  0.00871463 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3877  guanylate kinase  47.06 
 
 		 210 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3778  guanylate kinase  51.05 
 
 		 233 aa  184  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.208797 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2787  guanylate kinase  51 
 
 		 225 aa  182  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0563  guanylate kinase  51.35 
 
 		 212 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0717  guanylate kinase  51.35 
 
 		 212 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000116826 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2692  guanylate kinase  51 
 
 		 225 aa  182  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3497  guanylate kinase  48.53 
 
 		 207 aa  181  5.0000000000000004e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2606  guanylate kinase  51 
 
 		 226 aa  181  6e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100354  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2472  guanylate kinase  47.92 
 
 		 220 aa  181  6e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5549  guanylate kinase  46.7 
 
 		 206 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405224 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1761  guanylate kinase  43.16 
 
 		 207 aa  181  8.000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3630  guanylate kinase  47.06 
 
 		 224 aa  180  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.09026  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2719  guanylate kinase  49.45 
 
 		 206 aa  180  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00356396  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1329  guanylate kinase  43.23 
 
 		 204 aa  180  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000708025  normal  0.428768 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1763  guanylate kinase  46.88 
 
 		 218 aa  181  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.201865  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0294  guanylate kinase  48.68 
 
 		 212 aa  180  1e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1677  guanylate kinase  46.77 
 
 		 217 aa  180  2e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0035  guanylate kinase  50 
 
 		 209 aa  180  2e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1700  guanylate kinase  46.84 
 
 		 200 aa  179  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3155  guanylate kinase  48.44 
 
 		 220 aa  180  2e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0099  guanylate kinase  43.98 
 
 		 204 aa  179  2e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.261524  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0360  guanylate kinase  47.06 
 
 		 210 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0353  guanylate kinase  47.06 
 
 		 210 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2001  guanylate kinase  43.92 
 
 		 216 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1719  guanylate kinase  43.92 
 
 		 216 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0355  guanylate kinase  47.06 
 
 		 210 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.398163  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2715  guanylate kinase  44 
 
 		 206 aa  178  4e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  0.772738 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4581  guanylate kinase  50.27 
 
 		 207 aa  179  4e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.877029  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_004310  BR0464  guanylate kinase  51.56 
 
 		 220 aa  178  4.999999999999999e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.328382  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0469  guanylate kinase  51.56 
 
 		 220 aa  178  4.999999999999999e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.149667  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0363  guanylate kinase  46.57 
 
 		 210 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000053777 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4019  guanylate kinase  45.05 
 
 		 204 aa  178  5.999999999999999e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.565127  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09810  Guanylate kinase  46.74 
 
 		 194 aa  177  7e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0313  guanylate kinase  46.39 
 
 		 209 aa  177  9e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0875391  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1138  Guanylate kinase  48.09 
 
 		 209 aa  176  2e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2974  guanylate kinase  47.4 
 
 		 219 aa  176  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2158  guanylate kinase  44.79 
 
 		 205 aa  176  2e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3845  guanylate kinase  45.96 
 
 		 202 aa  176  3e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0048  guanylate kinase  47.92 
 
 		 202 aa  175  4e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1237  guanylate kinase  45.31 
 
 		 195 aa  175  4e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.74814  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3810  guanylate kinase  45.59 
 
 		 207 aa  175  4e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.18291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0634  guanylate kinase  46.7 
 
 		 210 aa  175  4e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2975  guanylate kinase  47.21 
 
 		 204 aa  175  5e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0988  guanylate kinase  44.23 
 
 		 234 aa  175  5e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0107524 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0976  guanylate kinase  48.92 
 
 		 211 aa  175  5e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.194665  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4145  guanylate kinase  49.47 
 
 		 207 aa  174  6e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1104  guanylate kinase  47.89 
 
 		 211 aa  174  7e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.631702  normal  0.011032 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001862  guanylate kinase  44.5 
 
 		 207 aa  174  7e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0266  guanylate kinase  49.19 
 
 		 207 aa  174  8e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2573  guanylate kinase  53.07 
 
 		 223 aa  174  9e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0392077 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0785  guanylate kinase  49.21 
 
 		 201 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000101008  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0576  guanylate kinase  50.26 
 
 		 220 aa  174  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.400734  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3433  guanylate kinase  45.1 
 
 		 207 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.21703  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02830  guanylate kinase  45.92 
 
 		 205 aa  174  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2138  guanylate kinase  46.67 
 
 		 205 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.585915  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1535  guanylate kinase  46.35 
 
 		 220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0748909  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3613  guanylate kinase  45.1 
 
 		 207 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0330  guanylate kinase  45.1 
 
 		 224 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0351596  normal  0.331396 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3630  guanylate kinase  49.19 
 
 		 209 aa  173  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.601224  normal  0.100424 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2280  guanylate kinase  47.83 
 
 		 229 aa  172  2.9999999999999996e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1992  guanylate kinase  41.62 
 
 		 209 aa  172  2.9999999999999996e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1335  guanylate kinase  44.39 
 
 		 206 aa  172  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3948  guanylate kinase  48.73 
 
 		 207 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.498976  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0811  guanylate kinase  45.6 
 
 		 206 aa  172  3.9999999999999995e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.990051 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2714  guanylate kinase  46.35 
 
 		 213 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00630  guanylate kinase  44 
 
 		 207 aa  172  3.9999999999999995e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3936  guanylate kinase  47.15 
 
 		 212 aa  172  3.9999999999999995e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1987  guanylate kinase  41.62 
 
 		 209 aa  171  5e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3479  guanylate kinase  46.88 
 
 		 220 aa  171  5e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1597  guanylate kinase  47.83 
 
 		 197 aa  171  5.999999999999999e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00198885  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0052  guanylate kinase  47.06 
 
 		 210 aa  171  5.999999999999999e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00408303  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0361  guanylate kinase  44.61 
 
 		 207 aa  171  6.999999999999999e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3957  guanylate kinase  47.89 
 
 		 207 aa  171  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4020  guanylate kinase  47.89 
 
 		 207 aa  171  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3948  guanylate kinase  47.89 
 
 		 207 aa  171  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531185 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4066  guanylate kinase  47.89 
 
 		 207 aa  171  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4127  guanylate kinase  47.89 
 
 		 207 aa  171  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.514606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2028  guanylate kinase  45.27 
 
 		 220 aa  171  7.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.413126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3623  guanylate kinase  47.31 
 
 		 207 aa  171  7.999999999999999e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0473  guanylate kinase  44.9 
 
 		 209 aa  171  9e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1212  guanylate kinase  47.92 
 
 		 203 aa  171  9e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0091  guanylate kinase  47.89 
 
 		 207 aa  171  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0759  guanylate kinase  46.35 
 
 		 219 aa  171  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.784504  normal  0.122144 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2902  guanylate kinase  46.74 
 
 		 215 aa  169  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0336  guanylate kinase  46.99 
 
 		 207 aa  170  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.57704 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5204  guanylate kinase  46.63 
 
 		 206 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.952406  normal  0.288026 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2444  guanylate kinase  48.13 
 
 		 203 aa  169  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.337517 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70440  guanylate kinase  45.08 
 
 		 203 aa  169  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>