38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0789 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0789  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  330  4e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0481  hypothetical protein  44.25 
 
 		 113 aa  100  8e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000325611  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3872  protein of unknown function UPF0150  45.54 
 
 		 121 aa  97.4  7e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.663514 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0564  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  38.84 
 
 		 147 aa  95.1  3e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00598996 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5735  protein of unknown function UPF0150  43.33 
 
 		 130 aa  92.8  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0990  hypothetical protein  40.71 
 
 		 116 aa  87.8  6e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000238527  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0572  hypothetical protein  38.46 
 
 		 187 aa  80.9  0.000000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000321015  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0842  hypothetical protein  38.94 
 
 		 135 aa  73.9  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2743  hypothetical protein  36.61 
 
 		 118 aa  73.2  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0158  protein of unknown function UPF0150  37.07 
 
 		 121 aa  72  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1425  protein of unknown function UPF0150  36.28 
 
 		 135 aa  71.2  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000416258 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3460  protein of unknown function UPF0150  37.07 
 
 		 121 aa  70.5  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2428  hypothetical protein  38.95 
 
 		 122 aa  70.1  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2449  hypothetical protein  36.79 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4206  HicB family protein  33.02 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4167  HicB family protein  32.08 
 
 		 108 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2750  HicB family protein  34.62 
 
 		 109 aa  51.2  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0443  HicB family protein  27.59 
 
 		 118 aa  48.9  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.134011  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0163  HicB family protein  33 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.110553 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0003  HicB  46.15 
 
 		 122 aa  45.4  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000193039  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1973  hypothetical protein  37.04 
 
 		 71 aa  45.4  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.193383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2645  hypothetical protein  42.42 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3322  hypothetical protein  39.34 
 
 		 70 aa  44.7  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0742622  normal  0.222376 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3668  HicB family protein  38.1 
 
 		 113 aa  44.7  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0468154  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1837  hypothetical protein  26.77 
 
 		 134 aa  44.7  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2139  HicB family protein  29.29 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.252397  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2639  protein of unknown function UPF0150  43.75 
 
 		 70 aa  43.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0797  protein of unknown function UPF0150  37.93 
 
 		 74 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0784  protein of unknown function UPF0150  28.38 
 
 		 115 aa  42  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.721186  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0452  hypothetical protein  36.84 
 
 		 70 aa  42  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.332121  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3186  protein of unknown function UPF0150  45.83 
 
 		 75 aa  41.2  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.234644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0431  HicB family protein  24.53 
 
 		 116 aa  41.2  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0059  HicB family protein  36.84 
 
 		 108 aa  40.8  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0455  protein of unknown function UPF0150  35.19 
 
 		 71 aa  40.4  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000544534  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0262  HicB family protein  30.39 
 
 		 118 aa  40.4  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0256  HicB family protein  30.39 
 
 		 118 aa  40.4  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1959  hypothetical protein  31.51 
 
 		 130 aa  40.4  0.01  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0463  hypothetical protein  32.84 
 
 		 119 aa  40.4  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>