46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0043 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0043  hypothetical protein  100 
 
 		 314 aa  599  1e-170  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274939  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3548  hypothetical protein  27.95 
 
 		 321 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00235957 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2495  hypothetical protein  22.55 
 
 		 297 aa  71.2  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000133938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2638  hypothetical protein  23.17 
 
 		 324 aa  71.2  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.898598  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1389  hypothetical protein  28.31 
 
 		 336 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.718938 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0745  hypothetical protein  27.44 
 
 		 316 aa  65.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.579699 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1614  hypothetical protein  29.41 
 
 		 320 aa  63.5  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0042  hypothetical protein  22.26 
 
 		 316 aa  57  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000066001 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1744  hypothetical protein  24.19 
 
 		 302 aa  57  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1494  hypothetical protein  25 
 
 		 333 aa  57  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.060435 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0305  hypothetical protein  31.1 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4413  hypothetical protein  21.61 
 
 		 326 aa  56.2  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00830012  normal  0.663771 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2685  hypothetical protein  25.09 
 
 		 342 aa  55.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1488  hypothetical protein  27.39 
 
 		 329 aa  54.7  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0444326  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0723  hypothetical protein  24.5 
 
 		 326 aa  54.7  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0275507  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5600  hypothetical protein  26.5 
 
 		 319 aa  53.1  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0634  hypothetical protein  24.69 
 
 		 298 aa  53.1  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0163  hypothetical protein  26.69 
 
 		 320 aa  52.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00309358 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0604  hypothetical protein  25.61 
 
 		 295 aa  52  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3171  hypothetical protein  26.79 
 
 		 346 aa  50.8  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.208878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1628  hypothetical protein  19.8 
 
 		 321 aa  50.8  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119039  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0755  integral membrane protein-like protein  27.59 
 
 		 325 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0643382 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2793  hypothetical protein  25.41 
 
 		 360 aa  50.4  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5211  hypothetical protein  31.75 
 
 		 333 aa  50.4  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.719757  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1628  hypothetical protein  26.86 
 
 		 340 aa  50.1  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2516  hypothetical protein  24.83 
 
 		 336 aa  49.7  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.738603  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1672  hypothetical protein  23.28 
 
 		 303 aa  49.3  0.00008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000269859  normal  0.37402 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0688  hypothetical protein  25.26 
 
 		 305 aa  48.9  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.700427  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1012  hypothetical protein  28.29 
 
 		 323 aa  47.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.58279 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0521  hypothetical protein  25.26 
 
 		 325 aa  47.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1082  hypothetical protein  26.05 
 
 		 304 aa  48.1  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.789813  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1413  hypothetical protein  22.78 
 
 		 318 aa  48.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00553932  normal  0.0166848 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1403  hypothetical protein  22.78 
 
 		 318 aa  48.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.209526  normal  0.367043 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3900  hypothetical protein  24.82 
 
 		 331 aa  47  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1769  glycosyl transferase family protein  22.22 
 
 		 586 aa  46.2  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1301  hypothetical protein  23.05 
 
 		 350 aa  45.8  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1947  hypothetical protein  24.34 
 
 		 315 aa  45.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.789852  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2377  hypothetical protein  28.7 
 
 		 362 aa  43.5  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.436987  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4166  hypothetical protein  30.81 
 
 		 316 aa  43.1  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.237065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1791  hypothetical protein  35.4 
 
 		 346 aa  43.5  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2300  hypothetical protein  27.87 
 
 		 322 aa  43.5  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0170913  hitchhiker  0.00842153 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3213  hypothetical protein  28.09 
 
 		 331 aa  43.1  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0885433 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2598  hypothetical protein  25.96 
 
 		 340 aa  43.1  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.936976  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1599  hypothetical protein  24.03 
 
 		 319 aa  42.7  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0057  integral membrane protein  27.31 
 
 		 328 aa  42.7  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1174  hypothetical protein  32.03 
 
 		 321 aa  42.4  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>