More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0515 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0515  NADH dehydrogenase subunit H  100 
 
 
341 aa  656    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1633  NADH dehydrogenase subunit H  80.35 
 
 
350 aa  560  1e-158  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0646  NADH dehydrogenase subunit H  83.58 
 
 
343 aa  539  9.999999999999999e-153  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.411826  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0658  NADH dehydrogenase subunit H  79.47 
 
 
349 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0303  NADH dehydrogenase subunit H  40.06 
 
 
361 aa  224  2e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.594505 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2275  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  41.85 
 
 
323 aa  219  7.999999999999999e-56  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0754968  normal  0.291328 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2048  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  42.38 
 
 
324 aa  202  6e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.110372 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0328  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  40.63 
 
 
320 aa  194  3e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1898  NADH dehydrogenase subunit H  36.39 
 
 
352 aa  192  8e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0180885  normal  0.286914 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1793  NADH dehydrogenase (quinone)  42.81 
 
 
320 aa  187  2e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.096157  normal  0.688521 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1301  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  37.92 
 
 
352 aa  185  9e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1082  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  41.59 
 
 
337 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.524281  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2042  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  33.22 
 
 
349 aa  155  7e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268939  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0981  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  33.77 
 
 
348 aa  155  9e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0927  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  35.14 
 
 
353 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_798  NADH:quinone oxidoreductase subunit 1 (chain H)  35.18 
 
 
353 aa  146  5e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1343  NADH dehydrogenase subunit H  31.52 
 
 
372 aa  146  5e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0811  NADH dehydrogenase (quinone)  34.95 
 
 
353 aa  145  1e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1281  NADH dehydrogenase (quinone)  32.74 
 
 
447 aa  145  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.522555 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4411  NADH dehydrogenase (quinone)  31.1 
 
 
438 aa  143  5e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1098  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  32.55 
 
 
366 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0203  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  32.62 
 
 
329 aa  142  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.746542  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0638  NADH dehydrogenase I chain H  33.22 
 
 
372 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1239  NADH dehydrogenase (quinone)  31.08 
 
 
350 aa  140  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7684  NADH dehydrogenase (quinone)  31.43 
 
 
472 aa  140  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4488  NADH dehydrogenase subunit H  31.85 
 
 
410 aa  139  8.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0439887 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0527  NADH dehydrogenase subunit H  31.68 
 
 
449 aa  139  8.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01771  NADH dehydrogenase subunit H  30.59 
 
 
384 aa  139  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0970603  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1537  NADH dehydrogenase (quinone)  31.6 
 
 
341 aa  138  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0402  NADH dehydrogenase  31.38 
 
 
372 aa  139  1e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7012  NADH dehydrogenase (quinone)  31.5 
 
 
345 aa  138  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1666  NADH dehydrogenase subunit H  32.06 
 
 
372 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3616  NADH dehydrogenase (quinone)  30.58 
 
 
361 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.537864  normal  0.460896 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0848  NADH dehydrogenase (quinone)  32.89 
 
 
372 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.742296  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5421  NADH dehydrogenase subunit H  29.87 
 
 
333 aa  136  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5417  NADH dehydrogenase subunit H  29.87 
 
 
333 aa  136  4e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5146  NADH dehydrogenase subunit H  29.87 
 
 
333 aa  136  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4996  NADH dehydrogenase subunit H  29.87 
 
 
333 aa  136  4e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5538  NADH dehydrogenase subunit H  29.87 
 
 
333 aa  136  4e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5387  NADH dehydrogenase subunit H  29.87 
 
 
333 aa  136  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14052e-18 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5533  NADH dehydrogenase subunit H  29.87 
 
 
333 aa  136  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0101965 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5472  NADH dehydrogenase subunit H  29.87 
 
 
333 aa  136  4e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4978  NADH dehydrogenase subunit H  29.87 
 
 
333 aa  136  5e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2714  NADH dehydrogenase subunit H  31.9 
 
 
372 aa  136  5e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.834243  normal  0.483082 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0747  NADH dehydrogenase I chain H  32.56 
 
 
372 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.200142  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5094  NADH dehydrogenase subunit H  29.87 
 
 
333 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0274  NADH dehydrogenase subunit H  30.14 
 
 
451 aa  136  7.000000000000001e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3815  NADH dehydrogenase subunit H  29.18 
 
 
333 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1878  NADH dehydrogenase subunit H  31.74 
 
 
411 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.349775  normal  0.979867 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02331  NADH dehydrogenase subunit H  29.53 
 
 
372 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.896857  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1293  F420H2 dehydrogenase subunit H  31.1 
 
 
344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000183992  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1527  NADH dehydrogenase subunit H  29.71 
 
 
372 aa  134  3e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.732572  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01891  NADH dehydrogenase subunit H  29.74 
 
 
372 aa  134  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26911  NADH dehydrogenase subunit H  30.12 
 
 
384 aa  134  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3409  NADH dehydrogenase subunit H  29.51 
 
 
333 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0288  NADH dehydrogenase  30.3 
 
 
452 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.957088  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1053  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  32.19 
 
 
350 aa  133  5e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2620  NADH:ubiquinone oxidoreductase chain H  30.95 
 
 
365 aa  132  6.999999999999999e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.146447 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3747  NADH dehydrogenase (quinone)  29.86 
 
 
351 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000186465  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2878  NADH dehydrogenase subunit H  33.12 
 
 
341 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.67433  normal  0.171106 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1603  NADH dehydrogenase (quinone)  31.91 
 
 
372 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5060  NADH dehydrogenase (quinone)  30.75 
 
 
457 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.252205  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0956  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  31.94 
 
 
349 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0350312  normal  0.369744 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0846  NADH dehydrogenase (quinone)  31.91 
 
 
368 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.637242  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2529  NADH dehydrogenase subunit H  32.2 
 
 
372 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1869  NADH dehydrogenase (quinone)  31.58 
 
 
372 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3628  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  31.42 
 
 
343 aa  131  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.154077 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0785  NADH dehydrogenase subunit H  30.94 
 
 
348 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.181346  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4397  NADH dehydrogenase subunit H  31.86 
 
 
340 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2558  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  30.59 
 
 
344 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.59058  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0162  NADH dehydrogenase subunit H  30.42 
 
 
372 aa  130  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6087  NADH dehydrogenase subunit H  30.55 
 
 
462 aa  130  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0085721  normal  0.0109132 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1579  NADH dehydrogenase subunit H  30.46 
 
 
372 aa  130  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.181564 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1209  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  29.7 
 
 
349 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000168928  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1121  NADH dehydrogenase subunit H  32.99 
 
 
319 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.308781  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3249  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  30.06 
 
 
359 aa  130  5.0000000000000004e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.820751  normal  0.99493 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2581  NADH dehydrogenase subunit H  32.18 
 
 
341 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.393278  normal  0.135958 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1431  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  30.67 
 
 
347 aa  129  7.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0280  NADH dehydrogenase  29.13 
 
 
432 aa  129  8.000000000000001e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000247954 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2806  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  30.36 
 
 
360 aa  129  8.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0981  NADH dehydrogenase (quinone)  31 
 
 
466 aa  129  8.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01801  NADH dehydrogenase subunit H  29.45 
 
 
372 aa  129  8.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.624846  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1375  NADH dehydrogenase I chain H  28.3 
 
 
342 aa  129  8.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00938294  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01781  NADH dehydrogenase subunit H  29.45 
 
 
372 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.236332  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5570  NADH dehydrogenase subunit H  29.1 
 
 
355 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.171146 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1626  NADH dehydrogenase (quinone)  28.86 
 
 
440 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0675277 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0965  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  32.34 
 
 
372 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00465289  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0897  NADH dehydrogenase subunit H  31.09 
 
 
347 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.135331  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2052  NADH dehydrogenase subunit H  30.91 
 
 
340 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0871855  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0210  NADH dehydrogenase I chain H  30.25 
 
 
330 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2443  NADH dehydrogenase (quinone)  27.17 
 
 
360 aa  128  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1410  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain H  29.67 
 
 
354 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0192046 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1508  NADH dehydrogenase (quinone)  28.8 
 
 
352 aa  127  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00230102 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3222  NADH dehydrogenase subunit H  31.23 
 
 
441 aa  127  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0931446 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3614  NADH dehydrogenase (quinone)  31.73 
 
 
328 aa  127  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0591  NADH dehydrogenase (quinone)  30.17 
 
 
448 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748809  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1035  NADH dehydrogenase subunit H  29.72 
 
 
355 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.262933  normal  0.291469 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1721  NADH dehydrogenase subunit H  30.03 
 
 
347 aa  127  4.0000000000000003e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13173  NADH dehydrogenase subunit H  29.27 
 
 
413 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3436  NADH dehydrogenase I, H subunit  32.38 
 
 
329 aa  126  5e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>