More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_4128 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_4128  glutathione S-transferase-like  100 
 
 		 206 aa  431  1e-120  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1792  glutathione S-transferase domain-containing protein  69.61 
 
 		 205 aa  295  4e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.617616  normal  0.072822 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0585  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.76 
 
 		 206 aa  260  1e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0422  glutathione S-transferase domain-containing protein  60.19 
 
 		 206 aa  257  7e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.850125  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3933  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.24 
 
 		 214 aa  235  4e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.243795  normal  0.0957714 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0062  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.71 
 
 		 231 aa  221  4.9999999999999996e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3483  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.24 
 
 		 230 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541048  normal  0.515016 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4039  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.24 
 
 		 230 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6781  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.27 
 
 		 237 aa  206  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.181591 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1350  Glutathione S-transferase domain protein  39.02 
 
 		 206 aa  142  4e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3324  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.29 
 
 		 219 aa  140  9e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.495598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3984  glutathione S-transferase-like  37.86 
 
 		 202 aa  132  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.10217  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1555  glutathione S-transferase-like  36.41 
 
 		 203 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3536  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 		 205 aa  122  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1069  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.04 
 
 		 203 aa  121  7e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0907  putative glutathione S-transferase  34.65 
 
 		 216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.58191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0029  putative glutathione S-transferase  38.03 
 
 		 209 aa  119  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0588223  normal  0.184572 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5328  Glutathione S-transferase domain  35.68 
 
 		 215 aa  118  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0310623  normal  0.952299 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3102  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.5 
 
 		 205 aa  117  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.480753  normal  0.323994 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2763  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.23 
 
 		 208 aa  115  5e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1268  glutathione S-transferase  35.68 
 
 		 215 aa  115  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652561  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1577  glutathione S-transferase family protein  36.71 
 
 		 208 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2865  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.71 
 
 		 208 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0197504 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2695  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.23 
 
 		 208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00743363 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6065  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.82 
 
 		 232 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.966478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1378  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.23 
 
 		 208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1417  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.27 
 
 		 208 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1394  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.75 
 
 		 208 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1064  Glutathione S-transferase domain  35.68 
 
 		 210 aa  109  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00553771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2965  Glutathione S-transferase domain protein  35.75 
 
 		 208 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0279406  normal  0.0713112 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1112  glutathione S-transferase  33.02 
 
 		 209 aa  108  4.0000000000000004e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.27507 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4581  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.18 
 
 		 210 aa  106  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3548  glutathione S-transferase  33 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0628604  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3950  glutathione S-transferase-like protein  34.76 
 
 		 203 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.259854  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3699  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.64 
 
 		 204 aa  102  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3335  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.04 
 
 		 205 aa  102  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.55179 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3711  glutathione S-transferase-like  32.55 
 
 		 203 aa  101  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.461256 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4733  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.28 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.813265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0668  glutathione S-transferase-like  34.24 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0464082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00662  Glutathione S-transferase  32.81 
 
 		 186 aa  99.8  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1764  Glutathione S-transferase domain  31.6 
 
 		 203 aa  97.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0697  glutathione S-transferase  33.15 
 
 		 220 aa  95.9  3e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0113  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.19 
 
 		 211 aa  94.7  8e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.118782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2730  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.7 
 
 		 211 aa  94  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000634111 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3434  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.95 
 
 		 210 aa  90.9  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.398692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1437  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.96 
 
 		 202 aa  90.1  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000241692  hitchhiker  0.000981469 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4250  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.66 
 
 		 202 aa  87  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.127206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1435  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.52 
 
 		 209 aa  84  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.53764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0529  putative glutathione S-transferase  30.1 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0310  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.95 
 
 		 202 aa  79  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05596  glutathione S-transferase  29.58 
 
 		 204 aa  78.2  0.00000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1088  glutathione S-transferase family protein  30.77 
 
 		 209 aa  78.2  0.00000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000005  glutathione S-transferase  28.17 
 
 		 204 aa  77.4  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4124  glutathione S-transferase-like  31.19 
 
 		 217 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.590461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1101  glutathione S-transferase-like  30.2 
 
 		 256 aa  76.3  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2981  glutathione S-transferase  29.76 
 
 		 216 aa  75.1  0.0000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.897939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1883  glutathionine S-transferase  31.11 
 
 		 201 aa  74.7  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2552  glutathionine S-transferase  31.11 
 
 		 201 aa  74.7  0.0000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.183983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3927  glutathione S-transferase-like  30.05 
 
 		 228 aa  75.1  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1775  glutathionine S-transferase  31.11 
 
 		 201 aa  74.7  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1799  putative glutathione S-transferase (GST)  29.27 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.602523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1296  glutathione S-transferase-like protein  30.05 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.041604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3532  Glutathione S-transferase domain protein  26.83 
 
 		 217 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.150118 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4810  Glutathione S-transferase domain  30.05 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2670  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.72 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.237361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0042  Glutathione S-transferase domain protein  31.65 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.245539  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0023  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.01 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.529151 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2760  glutathione S-transferase-like  29.9 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04050  elongation factor 1-gamma (ef-1-gamma), putative  29.24 
 
 		 419 aa  69.3  0.00000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2242  glutathione S-transferase-like protein  28.06 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.025244  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0044  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.5 
 
 		 216 aa  68.2  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0805  putative glutathione S-transferase  26.52 
 
 		 216 aa  67.4  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.671378  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0042  Glutathione S-transferase domain protein  29.89 
 
 		 202 aa  67.4  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241664  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1842  glutathione S-transferase  29.91 
 
 		 200 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260742  normal  0.324274 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0409  Glutathione S-transferase domain protein  28.82 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4998  glutathione S-transferase-like protein  24.87 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0183331  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2296  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.21 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.879102 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3183  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.82 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.413955  normal  0.024534 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2696  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.27 
 
 		 222 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036581 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1576  glutathione S-transferase family protein  27.27 
 
 		 222 aa  64.7  0.0000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2721  putative glutathione S-transferase protein  28.57 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2866  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.27 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0201506 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0755  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.34 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.76216  normal  0.189515 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3211  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.35 
 
 		 198 aa  64.3  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1813  glutathionine S-transferase  28.57 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000409061  decreased coverage  0.000277297 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2483  glutathione S-transferase-like protein  26.67 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.478501  normal  0.101029 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3282  maleylacetoacetate isomerase  41.05 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.318368  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3058  maleylacetoacetate isomerase  35 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0213018 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2245  glutathione S-transferase-like  31.98 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.556118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0783  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.84 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38550  maleylacetoacetate isomerase  41.05 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000321346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0048  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.93 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3821  Glutathione S-transferase domain  27.14 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.563101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2221  glutathionine S-transferase  30.77 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0005501 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1046  maleylacetoacetate isomerase  32.4 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.483712 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2764  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.27 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3962  putative glutathione S-transferase  32.02 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24830  putative glutathione S-transferase  28.43 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4603  glutathione S-transferase-like protein  29.51 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2547  glutathione S-transferase-like  30.65 
 
 		 203 aa  62  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.277247  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>