More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1842 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3660  sulfatase  59.7 
 
 		 523 aa  665    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000523129  normal  0.837026 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1842  sulfatase  100 
 
 		 526 aa  1088    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0819  sulfatase  58.08 
 
 		 523 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4261  sulfatase  57.2 
 
 		 506 aa  563  1.0000000000000001e-159  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.362858 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2849  sulfatase  55.11 
 
 		 503 aa  551  1e-155  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000585259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3374  sulfatase  53.32 
 
 		 507 aa  520  1e-146  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3640  sulfatase  51.96 
 
 		 520 aa  506  9.999999999999999e-143  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1776  sulfatase  48.93 
 
 		 520 aa  497  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.791288 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3047  sulfatase  49.59 
 
 		 503 aa  480  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0209579 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0440  sulfatase  49.48 
 
 		 505 aa  452  1.0000000000000001e-126  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0138449  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0121  sulfatase  47.85 
 
 		 526 aa  431  1e-119  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4996  sulfatase  33.27 
 
 		 506 aa  244  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.317023 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3913  sulfatase  31.79 
 
 		 522 aa  237  4e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.656698  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0354  sulfatase  31.66 
 
 		 493 aa  236  8e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2890  sulfatase  32.42 
 
 		 523 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2941  sulfatase  31.96 
 
 		 480 aa  222  9.999999999999999e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.515365 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4498  sulfatase  33.33 
 
 		 462 aa  215  9.999999999999999e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.697848  normal  0.704843 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6289  sulfatase  31.52 
 
 		 486 aa  211  3e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.235101 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2738  sulfatase  30.98 
 
 		 466 aa  205  2e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.846304  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0740  sulfatase  27.15 
 
 		 440 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0829  sulfatase  30.82 
 
 		 510 aa  181  4e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0850119  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2602  sulfatase  29.03 
 
 		 452 aa  179  9e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6288  sulfatase  28.47 
 
 		 523 aa  176  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.44956 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1030  sulfatase  28.29 
 
 		 470 aa  168  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3142  sulfatase  31.17 
 
 		 524 aa  166  9e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.854728  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03676  acrylsulfatase-like enzyme  29.24 
 
 		 551 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.176732  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03625  hypothetical protein  29.24 
 
 		 551 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.173568  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4166  arylsulfatase  29.24 
 
 		 551 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00523411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6052  sulfatase  27.89 
 
 		 453 aa  164  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5237  arylsulfatase  29.24 
 
 		 551 aa  164  3e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0995003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3373  sulfatase  28.54 
 
 		 481 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2166  sulfatase  28.78 
 
 		 497 aa  162  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.696706  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4178  sulfatase  29.02 
 
 		 551 aa  162  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0425413  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3659  sulfatase  28.57 
 
 		 484 aa  161  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000330438  normal  0.826759 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4650  sulfatase  25.85 
 
 		 539 aa  161  3e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4240  twin-arginine translocation pathway signal  27.93 
 
 		 457 aa  160  6e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3661  sulfatase  28.39 
 
 		 500 aa  159  9e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0317755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3296  sulfatase  28.46 
 
 		 460 aa  157  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0308085  hitchhiker  0.000582836 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  28.68 
 
 		 501 aa  156  7e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3115  cerebroside-sulfatase  27.07 
 
 		 440 aa  156  9e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0889  sulfatase  28.54 
 
 		 500 aa  156  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00184444  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3436  sulfatase  28.13 
 
 		 462 aa  154  4e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0302  sulfatase  28.38 
 
 		 543 aa  152  1e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3980  Cerebroside-sulfatase  27.49 
 
 		 458 aa  152  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5097  sulfatase  28.32 
 
 		 550 aa  152  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.551425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5768  sulfatase  28.85 
 
 		 555 aa  152  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2382  sulfatase  27.02 
 
 		 488 aa  152  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.285521  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6904  sulfatase  29.13 
 
 		 556 aa  151  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.430095 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2831  sulfatase  31.87 
 
 		 440 aa  150  5e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0404074 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3949  sulfatase  26.21 
 
 		 470 aa  150  6e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.184377  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0555  sulfatase  28.36 
 
 		 486 aa  148  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0785  sulfatase  26.53 
 
 		 472 aa  148  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0936  sulfatase  27.14 
 
 		 479 aa  147  7.0000000000000006e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  27.05 
 
 		 497 aa  147  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1638  sulfatase  27.52 
 
 		 457 aa  145  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.132093 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0895  sulfatase  26.36 
 
 		 471 aa  146  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281969  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2379  sulfatase  25.57 
 
 		 470 aa  145  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4692  sulfatase  28.6 
 
 		 491 aa  145  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.66699 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1239  sulfatase  27.8 
 
 		 554 aa  145  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342863  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0345  sulfatase  28.01 
 
 		 474 aa  145  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00158762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5555  sulfatase  28.11 
 
 		 561 aa  144  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.708907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0881  sulfatase  26.3 
 
 		 510 aa  144  4e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.789189  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6681  sulfatase  28.43 
 
 		 561 aa  144  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0039  sulfatase  31.54 
 
 		 497 aa  144  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.225946 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0038  sulfatase  31.54 
 
 		 497 aa  144  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292867  hitchhiker  0.00560398 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4501  sulfatase  29.15 
 
 		 481 aa  143  6e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.930305  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0040  sulfatase  32.35 
 
 		 497 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.872346  normal  0.13967 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0040  sulfatase  30.73 
 
 		 497 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843312  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6900  sulfatase  28.36 
 
 		 545 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0879565  normal  0.386644 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3501  sulfatase  28.13 
 
 		 506 aa  142  9.999999999999999e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.486843  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2371  sulfatase  30.64 
 
 		 510 aa  142  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.852311  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1327  sulfatase  26.74 
 
 		 480 aa  141  3e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.499609  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1735  sulfatase  28.23 
 
 		 508 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2976  sulfatase  28.06 
 
 		 496 aa  140  7e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2939  sulfatase  28.97 
 
 		 556 aa  140  7.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0360  Steryl-sulfatase  26.19 
 
 		 553 aa  139  8.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6751  sulfatase  27.78 
 
 		 569 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1497  sulfatase  27.63 
 
 		 536 aa  139  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.139846  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3801  sulfatase  26.31 
 
 		 453 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00499822  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1647  sulfatase  28.57 
 
 		 590 aa  135  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.425588  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1520  sulfatase  28.77 
 
 		 631 aa  136  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1353  n-acetylgalactosamine-6-sulfate sulfatase  25.05 
 
 		 471 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0725989  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0820  sulfatase  26.24 
 
 		 627 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0793  sulfatase  27.94 
 
 		 569 aa  133  6e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0527752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0474  sulfatase  26 
 
 		 491 aa  133  7.999999999999999e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2364  sulfatase family protein  25.52 
 
 		 492 aa  132  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.027189  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3852  sulfatase  27.57 
 
 		 468 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2657  sulfatase  25.74 
 
 		 519 aa  131  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5142  sulfatase  26.17 
 
 		 544 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01110  arylsulfatase A family protein  25.34 
 
 		 480 aa  131  3e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2408  sulfatase  26.64 
 
 		 548 aa  131  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.387467  hitchhiker  0.00012242 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3577  sulfatase  25.89 
 
 		 438 aa  130  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176651  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8255  sulfatase  27.43 
 
 		 482 aa  130  7.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229678  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1946  sulfatase  29.12 
 
 		 546 aa  130  8.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0015  sulfatase  30.05 
 
 		 497 aa  130  8.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.689426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3654  sulfatase  25.27 
 
 		 489 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0466355 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2674  sulfatase  27.19 
 
 		 559 aa  129  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.687796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5118  sulfatase  27.35 
 
 		 554 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000311  arylsulfatase  29.4 
 
 		 508 aa  128  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.63107  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0562  sulfatase  28.43 
 
 		 505 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>