62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1809 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1809  peptidase E  100 
 
 		 231 aa  482  1e-135  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02207  peptidase E  53.91 
 
 		 234 aa  262  3e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0649813  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2513  peptidase E  54.15 
 
 		 236 aa  251  8.000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000211077  hitchhiker  0.00000000118296 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2131  peptidase E  56.28 
 
 		 235 aa  247  9e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159794  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1567  peptidase E  54.59 
 
 		 235 aa  247  1e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.136519  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2352  peptidase E  53.28 
 
 		 236 aa  247  1e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000105319  decreased coverage  0.000000000548128 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2424  peptidase E  53.28 
 
 		 236 aa  247  1e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000847626  hitchhiker  0.000944855 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2596  peptidase E  53.28 
 
 		 237 aa  244  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000701873  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2730  peptidase E  52.4 
 
 		 236 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1442  peptidase E  55.46 
 
 		 235 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000003694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1786  peptidase E  53.28 
 
 		 237 aa  242  3e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000161108  hitchhiker  0.0000000000738049 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2558  peptidase E  53.28 
 
 		 237 aa  241  5e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000179137  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2335  peptidase E  51.53 
 
 		 236 aa  241  9e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.367352  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2673  peptidase E  53.71 
 
 		 239 aa  239  2e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000331059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2771  peptidase E  49.16 
 
 		 247 aa  229  3e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000609808  decreased coverage  0.00176769 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3298  peptidase E  50.24 
 
 		 244 aa  200  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.238395 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4009  peptidase E  47.93 
 
 		 229 aa  199  3e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0530108 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4565  peptidase E  47.93 
 
 		 229 aa  199  3e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4257  peptidase E  47.93 
 
 		 229 aa  199  3e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.618701  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3976  Dipeptidase E  47.93 
 
 		 229 aa  199  3e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03853  hypothetical protein  47.93 
 
 		 229 aa  199  3e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5491  peptidase E  47.93 
 
 		 229 aa  199  3e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.831674 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4515  peptidase E  47.93 
 
 		 229 aa  199  3e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03893  peptidase E  47.93 
 
 		 229 aa  199  3e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4474  peptidase E  47.93 
 
 		 229 aa  199  3e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.940329  normal  0.576842 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5540  peptidase E  48.13 
 
 		 251 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0257  peptidase E  46.01 
 
 		 231 aa  198  5e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4528  peptidase E  45.62 
 
 		 229 aa  193  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4442  peptidase E  45.62 
 
 		 229 aa  192  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4403  peptidase E  45.62 
 
 		 229 aa  192  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4525  peptidase E  45.62 
 
 		 229 aa  192  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.289419  normal  0.285655 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1245  peptidase E  44.24 
 
 		 234 aa  187  2e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0798  peptidase E  40.61 
 
 		 232 aa  186  4e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2319  peptidase E  45.16 
 
 		 251 aa  186  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.864987  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1379  peptidase E  42.42 
 
 		 234 aa  185  6e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1768  peptidase E  46.01 
 
 		 235 aa  182  4.0000000000000006e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2072  peptidase E  45.24 
 
 		 232 aa  182  5.0000000000000004e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0081  peptidase E  44.86 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4364  peptidase E  49.75 
 
 		 237 aa  168  7e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3280  peptidase E  39.37 
 
 		 234 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0167296 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09678  peptidase E  40.09 
 
 		 235 aa  153  2e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1683  Dipeptidase E  43.15 
 
 		 252 aa  150  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.140713  normal  0.275291 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0257  peptidase E  41.29 
 
 		 241 aa  151  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.109084 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0978  peptidase E  42.42 
 
 		 245 aa  149  4e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4173  peptidase E  50.27 
 
 		 249 aa  127  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.156253  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3342  peptidase S51 dipeptidase E  29.75 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000689098  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1040  S51 family peptidase  39.56 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.388382  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07320  peptidase E  34.69 
 
 		 204 aa  57  0.0000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1094  peptidase S51 dipeptidase E  32.09 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0707899  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0218  peptidase S51 dipeptidase E  26.44 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.912522 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1448  peptidase S51 dipeptidase E  30.4 
 
 		 230 aa  51.6  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.566443  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2119  peptidase S51 dipeptidase E  29.73 
 
 		 222 aa  50.8  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.101457  normal  0.0434672 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0633  peptidase S51 dipeptidase E  25.29 
 
 		 235 aa  50.4  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.127308  hitchhiker  0.00145751 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3283  peptidase S51 dipeptidase E  30.37 
 
 		 243 aa  47.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.413219  normal  0.0948111 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2497  peptidase S51, dipeptidase E  31.67 
 
 		 231 aa  47.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.128484  normal  0.73077 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1599  peptidase S51 dipeptidase E  30.63 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.351439  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3137  peptidase S51, dipeptidase E  33.9 
 
 		 254 aa  47  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.638284  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3140  peptidase S51 dipeptidase E  26.52 
 
 		 228 aa  45.8  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.36205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1776  peptidase S51 dipeptidase E  32.52 
 
 		 280 aa  45.8  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.125751  normal  0.183168 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0136  peptidase S51, dipeptidase E  32 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3247  peptidase S51 dipeptidase E  27.78 
 
 		 222 aa  42  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0453471  normal  0.0137165 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1125  peptidase E  24.81 
 
 		 207 aa  41.6  0.01  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>