34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0180 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0180  prepilin-type cleavage/methylation  100 
 
 		 280 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3337  MSHA biogenesis protein MshO precursor  37.02 
 
 		 278 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.131781  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0571  MSHA biogenesis protein MshO  36.24 
 
 		 281 aa  171  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3475  methylation site containing protein  34.83 
 
 		 287 aa  167  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00218559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3651  methylation site containing protein  36.79 
 
 		 287 aa  167  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0515  MSHA biogenesis protein MshO  36.84 
 
 		 290 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.141751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3825  MSHA biogenesis protein MshO  36.3 
 
 		 282 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0143391  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0476  methylation site containing protein  34.14 
 
 		 287 aa  163  3e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0553768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0519  MSHA biogenesis protein MshO  35.71 
 
 		 282 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4102  MSHA biogenesis protein MshO  35 
 
 		 282 aa  160  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0494  MSHA biogenesis protein MshO  35.23 
 
 		 282 aa  158  8e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0709841  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4405  methylation site containing protein  34.3 
 
 		 277 aa  157  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0400  methylation site containing protein  35.48 
 
 		 265 aa  152  4e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.642203  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4566  putative MSHA biogenesis protein MshO  37.98 
 
 		 292 aa  151  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.842341  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3757  methylation site containing protein  32.99 
 
 		 295 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0511874  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0555  methylation site containing protein  31.83 
 
 		 269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0166475  normal  0.583012 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0464  MSHA biogenesis protein MshO precursor  33.67 
 
 		 282 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.467537  normal  0.968118 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3741  methylation site containing protein  33.11 
 
 		 275 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.772407  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00261  Tfp pilus assembly protein PilW  29.3 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002380  MSHA biogenesis protein MshO  28.21 
 
 		 253 aa  101  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.197407  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1144  MSHA biogenesis protein MshO  29.47 
 
 		 282 aa  97.8  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0763  hypothetical protein  28.57 
 
 		 261 aa  94  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0696342  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3339  methylation  25.86 
 
 		 283 aa  86.3  6e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.510017  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03688  hypothetical protein  25.45 
 
 		 237 aa  84.7  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3265  type II secretory pathway pseudopilin PulG  26.09 
 
 		 287 aa  83.6  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.226057  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2830  hypothetical protein  38.1 
 
 		 192 aa  81.6  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.496531  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0480  exported protein MshO  25.54 
 
 		 251 aa  75.9  0.0000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.772217  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3104  hypothetical protein  35.71 
 
 		 297 aa  68.6  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0394  type II secretory pathway pseudopilin PulG  27.7 
 
 		 268 aa  63.5  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0886  general secretion pathway protein H  28.87 
 
 		 283 aa  58.5  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.115142 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0757  hypothetical protein  23.19 
 
 		 261 aa  52.4  0.000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.538658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2703  hypothetical protein  28.57 
 
 		 167 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.345909 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0340  N-terminal methylation motif domain protein  31.03 
 
 		 567 aa  43.1  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3477  methylation site containing protein  25.16 
 
 		 162 aa  43.1  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000223181  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>