More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_2139 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1785  translation elongation factor aEF-2  54.92 
 
 		 736 aa  879    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0976726  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1090  elongation factor EF-2  93.92 
 
 		 740 aa  1444    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0970791  hitchhiker  0.00132795 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2139  elongation factor EF-2  100 
 
 		 740 aa  1504    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0072  translation elongation factor aEF-2  46.03 
 
 		 734 aa  676    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000119399  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2205  elongation factor EF-2  44.38 
 
 		 730 aa  635    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.909125  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0783  elongation factor EF-2  45.1 
 
 		 727 aa  658    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0938  elongation factor EF-2  75.92 
 
 		 740 aa  1182    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3686  elongation factor EF-2  44.32 
 
 		 730 aa  638    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.913887  normal  0.280674 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0263  elongation factor EF-2  44.26 
 
 		 731 aa  659    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0679  elongation factor EF-2  44.97 
 
 		 727 aa  660    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0279  elongation factor EF-2  45.75 
 
 		 730 aa  652    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0211327  normal  0.0660713 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2828  elongation factor EF-2  44.46 
 
 		 731 aa  657    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.255319 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0213  elongation factor EF-2  94.86 
 
 		 740 aa  1432    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.551385 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1171  elongation factor EF-2  44.01 
 
 		 730 aa  639    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.368378  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0084  elongation factor EF-2  54.23 
 
 		 736 aa  870    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000102607 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0614  elongation factor EF-2  45.1 
 
 		 727 aa  663    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0209  elongation factor EF-2  44.69 
 
 		 727 aa  658    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1304  elongation factor EF-2  44.55 
 
 		 727 aa  652    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0748  elongation factor EF-2  46.09 
 
 		 730 aa  689    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.259195 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0820  elongation factor EF-2  45.14 
 
 		 730 aa  638    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0613  elongation factor EF-2  65.43 
 
 		 734 aa  1009    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.472828  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1957  elongation factor EF-2  94.46 
 
 		 740 aa  1429    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  7.15133e-18 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2874  elongation factor EF-2  41.84 
 
 		 729 aa  593  1e-168  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0152  elongation factor EF-2  40.6 
 
 		 729 aa  592  1e-167  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1613  elongation factor EF-2  42.45 
 
 		 732 aa  587  1e-166  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.502666 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2168  translation elongation factor aEF-2  40.6 
 
 		 728 aa  588  1e-166  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0366  translation elongation factor aEF-2  40.87 
 
 		 728 aa  585  1.0000000000000001e-165  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0504  elongation factor EF-2  41.15 
 
 		 729 aa  579  1e-164  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.505462  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND06220  translation elongation factor 2  34.63 
 
 		 826 aa  422  1e-116  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35766  predicted protein  34.76 
 
 		 828 aa  417  9.999999999999999e-116  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.412602  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06330  elongation factor 2 (Eurofung)  32.19 
 
 		 844 aa  365  1e-99  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.174897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_52010  predicted protein  38.36 
 
 		 848 aa  333  5e-90  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0299674  hitchhiker  0.00863878 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66828  Elongation factor  35.49 
 
 		 842 aa  295  1e-78  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0684  translation elongation factor G  27.87 
 
 		 700 aa  258  3e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.864327 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2158  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  28.69 
 
 		 715 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.959287  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2662  translation elongation factor G  27.44 
 
 		 700 aa  256  1.0000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0624  translation elongation factor G  27.71 
 
 		 705 aa  252  2e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0584  translation elongation factor G  28.06 
 
 		 699 aa  250  6e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.19852  normal  0.151402 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3923  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  27.84 
 
 		 703 aa  250  6e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  27.68 
 
 		 697 aa  250  8e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5121  translation elongation factor G  28.06 
 
 		 704 aa  250  8e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.63953 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0418  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  27.53 
 
 		 706 aa  249  9e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000594856  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1861  elongation factor G  28.05 
 
 		 709 aa  249  1e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000111702  hitchhiker  0.00673824 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1164  translation elongation factor G  28.88 
 
 		 698 aa  249  1e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000382661  hitchhiker  0.00000123904 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0716  translation elongation factor G  27.44 
 
 		 701 aa  248  2e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000130254  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0366  elongation factor G  28.13 
 
 		 694 aa  248  3e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0391  elongation factor G  28 
 
 		 694 aa  247  4.9999999999999997e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0950  elongation factor G  26.86 
 
 		 691 aa  247  6.999999999999999e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000219808  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0084  translation elongation factor G  28.26 
 
 		 692 aa  247  6.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0050  elongation factor G  28.89 
 
 		 691 aa  246  8e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2081  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  27.89 
 
 		 700 aa  246  8e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3146  translation elongation factor G  27.31 
 
 		 704 aa  246  9e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.199563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1182  translation elongation factor G  27.91 
 
 		 699 aa  246  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.566824  normal  0.0924393 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0853  elongation factor G  27.24 
 
 		 707 aa  246  9.999999999999999e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.367581  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4324  translation elongation factor G  28.1 
 
 		 703 aa  246  1.9999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0475  elongation factor G  28.32 
 
 		 691 aa  244  3e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4510  translation elongation factor G  28.61 
 
 		 699 aa  244  3.9999999999999997e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0312  elongation factor G  28.57 
 
 		 695 aa  244  3.9999999999999997e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000568119  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4279  translation elongation factor G  27.54 
 
 		 697 aa  244  5e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000062878  unclonable  0.0000000000098696 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0294  elongation factor G  28.59 
 
 		 693 aa  243  6e-63  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1537  elongation factor G  28.23 
 
 		 691 aa  243  7e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1141  elongation factor G  27.28 
 
 		 691 aa  243  7e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000161111  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1871  elongation factor G  29.07 
 
 		 696 aa  243  7e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00956938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1562  elongation factor G  28.23 
 
 		 691 aa  243  7e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00909597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2693  elongation factor G  26.63 
 
 		 704 aa  243  7e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.170425 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20910  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  26.91 
 
 		 702 aa  242  2e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.357835  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17210  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  27.37 
 
 		 704 aa  241  2.9999999999999997e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.803551  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1281  elongation factor G  28.61 
 
 		 700 aa  241  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.490817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0885  elongation factor G  28.34 
 
 		 694 aa  241  2.9999999999999997e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398473 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2375  elongation factor G  27.35 
 
 		 698 aa  240  6.999999999999999e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.092172  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5076  elongation factor G  27.88 
 
 		 700 aa  240  6.999999999999999e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.374408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1905  elongation factor G  28.22 
 
 		 691 aa  240  6.999999999999999e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.224995  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2185  elongation factor G  26.85 
 
 		 708 aa  240  8e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00027976  normal  0.0114318 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1065  elongation factor G  28.97 
 
 		 692 aa  239  9e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239049  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2980  elongation factor G  26.36 
 
 		 713 aa  240  9e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6565  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2622  translation elongation factor G  28.51 
 
 		 697 aa  239  1e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000402697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1361  elongation factor G  28.21 
 
 		 690 aa  239  1e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.472174 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4029  elongation factor G  28.34 
 
 		 701 aa  239  1e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00578031  decreased coverage  0.000000445234 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1676  elongation factor G  28.13 
 
 		 691 aa  239  1e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.377788  hitchhiker  0.000311159 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  28.95 
 
 		 692 aa  239  1e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01408  hypothetical U5 snRNP component (Eurofung)  31.29 
 
 		 985 aa  238  2e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0125227 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5073  elongation factor G  28.4 
 
 		 690 aa  238  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.193124  normal  0.380191 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0687  translation elongation factor G  28.94 
 
 		 692 aa  239  2e-61  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  unclonable  0.000000203712  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1542  elongation factor G  28.26 
 
 		 690 aa  239  2e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  28.04 
 
 		 689 aa  238  2e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0960  translation elongation factor G  28.19 
 
 		 705 aa  238  2e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000224995  decreased coverage  0.000000000000793105 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0395  translation elongation factor G  27.27 
 
 		 695 aa  239  2e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.408849  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  27.87 
 
 		 692 aa  238  3e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0356  elongation factor G  27.67 
 
 		 691 aa  238  3e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10040  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  28.32 
 
 		 700 aa  238  3e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000170843  decreased coverage  0.0000000000839395 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0986  elongation factor G  27.78 
 
 		 701 aa  238  4e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.798274  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1004  elongation factor G  27.78 
 
 		 701 aa  238  4e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.994777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1014  elongation factor G  27.78 
 
 		 701 aa  238  4e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.203543 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3172  elongation factor G  28.82 
 
 		 701 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.384126  hitchhiker  0.00453685 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4318  elongation factor G  28.5 
 
 		 698 aa  237  6e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640423 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2910  translation elongation factor G  28.24 
 
 		 695 aa  237  6e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00946616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2215  elongation factor G  28.36 
 
 		 691 aa  237  6e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.226947  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4111  elongation factor G  27.47 
 
 		 703 aa  237  7e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.318672 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3223  elongation factor G  27.53 
 
 		 730 aa  237  8e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1288  elongation factor G  27.28 
 
 		 692 aa  236  8e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000556702  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>