More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1954 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1954  trigger factor  100 
 
 		 428 aa  865    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.657393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2189  trigger factor  71.29 
 
 		 427 aa  624  1e-177  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.981322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2137  trigger factor  65.48 
 
 		 427 aa  578  1e-164  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2564  trigger factor domain  63.83 
 
 		 426 aa  557  1e-157  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0272  trigger factor  61.41 
 
 		 436 aa  540  9.999999999999999e-153  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.576701 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2292  trigger factor  65.41 
 
 		 427 aa  540  9.999999999999999e-153  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0238  trigger factor  55.48 
 
 		 440 aa  491  9.999999999999999e-139  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2406  trigger factor  31.06 
 
 		 450 aa  186  9e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.32784  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0101  trigger factor  27.32 
 
 		 435 aa  140  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295209  normal  0.0149701 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004045  cell division trigger factor  27.21 
 
 		 435 aa  127  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000395206  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3137  trigger factor  27.05 
 
 		 436 aa  126  9e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000644844  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1513  trigger factor  25.66 
 
 		 433 aa  120  3.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000677902  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  24.05 
 
 		 448 aa  120  6e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1094  trigger factor  24.94 
 
 		 434 aa  119  7.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000123079  hitchhiker  0.00000434188 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3055  trigger factor  26.61 
 
 		 434 aa  116  6.9999999999999995e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000166473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3235  trigger factor  26.61 
 
 		 434 aa  116  6.9999999999999995e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00052643  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3093  trigger factor  26.61 
 
 		 434 aa  116  6.9999999999999995e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353037  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0809  trigger factor  26.7 
 
 		 428 aa  116  6.9999999999999995e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  26.06 
 
 		 434 aa  116  7.999999999999999e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1722  trigger factor  27.49 
 
 		 441 aa  115  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  0.0869561 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3069  trigger factor  25.84 
 
 		 434 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0128477  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1489  trigger factor  26.19 
 
 		 434 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000061134  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2662  trigger factor  26.19 
 
 		 434 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000102256  normal  0.690021 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0307  trigger factor  25.58 
 
 		 445 aa  114  3e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121023  normal  0.638239 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1793  trigger factor  26.19 
 
 		 434 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0903  trigger factor  25.3 
 
 		 432 aa  114  5e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000144682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0550  trigger factor  25.98 
 
 		 432 aa  113  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000374305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0496  trigger factor  25.98 
 
 		 432 aa  113  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000142859  hitchhiker  0.000578508 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1431  trigger factor  23.99 
 
 		 432 aa  112  9e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0842369  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0489  trigger factor  25.72 
 
 		 432 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000095414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0487  trigger factor  25.72 
 
 		 432 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182354  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0506  trigger factor  25.72 
 
 		 432 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000626608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01416  trigger factor  25.9 
 
 		 435 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2496  trigger factor  25.93 
 
 		 434 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000377099  normal  0.020755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2564  trigger factor  25.93 
 
 		 434 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000061517  normal  0.0625081 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  26.32 
 
 		 434 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0323  trigger factor  28.49 
 
 		 440 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00387  trigger factor  25.2 
 
 		 432 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000419065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3173  trigger factor  25.2 
 
 		 432 aa  110  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000698649  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0479  trigger factor  25.2 
 
 		 432 aa  110  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000713029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0472  trigger factor  25.2 
 
 		 432 aa  111  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00391  hypothetical protein  25.2 
 
 		 432 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000262738  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3196  trigger factor  25.2 
 
 		 432 aa  110  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000193083  hitchhiker  0.000427763 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0522  trigger factor  25.2 
 
 		 432 aa  110  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000233962  normal  0.478364 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0513  trigger factor  25.2 
 
 		 432 aa  110  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.68965e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1223  trigger factor  25.33 
 
 		 434 aa  111  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000148222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  23.61 
 
 		 439 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4984  trigger factor  23.53 
 
 		 448 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2751  trigger factor  25.4 
 
 		 434 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000172139  normal  0.125648 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1592  trigger factor  25.4 
 
 		 434 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000981502  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1603  trigger factor  25.4 
 
 		 434 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000736756  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1626  trigger factor  25.4 
 
 		 434 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000959254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0817  trigger factor  25.42 
 
 		 432 aa  109  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.153407  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3422  trigger factor  24.26 
 
 		 430 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.375201  normal  0.212187 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0359  trigger factor  25.39 
 
 		 432 aa  108  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325154  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2682  trigger factor  25.06 
 
 		 434 aa  107  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000115435  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  25.52 
 
 		 435 aa  107  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  26.04 
 
 		 435 aa  107  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  27.7 
 
 		 428 aa  107  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3354  trigger factor  23.5 
 
 		 429 aa  106  9e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1047  trigger factor  25.3 
 
 		 434 aa  105  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000149025  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  25.37 
 
 		 429 aa  105  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0722  trigger factor domain-containing protein  25.47 
 
 		 426 aa  105  2e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000704861  hitchhiker  0.0000000324572 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2597  trigger factor  25.17 
 
 		 434 aa  104  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000131318  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3643  trigger factor  25 
 
 		 442 aa  105  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676288  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2587  trigger factor  25.07 
 
 		 479 aa  104  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1184  trigger factor  25.13 
 
 		 437 aa  104  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0453455  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4041  trigger factor  24.54 
 
 		 473 aa  103  5e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.248232  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1940  trigger factor  25.06 
 
 		 447 aa  103  6e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2878  trigger factor  24.16 
 
 		 434 aa  103  6e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125506  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1549  trigger factor  25.4 
 
 		 463 aa  103  6e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2692  trigger factor  24.27 
 
 		 443 aa  103  7e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538517  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1181  trigger factor  27.66 
 
 		 491 aa  103  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.176713  normal  0.0554389 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1746  trigger factor  25.75 
 
 		 436 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.132696 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  27.27 
 
 		 433 aa  102  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  27.27 
 
 		 433 aa  102  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3436  trigger factor  22.81 
 
 		 429 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  24.1 
 
 		 433 aa  102  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0689  trigger factor  25.89 
 
 		 459 aa  102  2e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00000380818  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3500  trigger factor  22.81 
 
 		 429 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0938  trigger factor  24.41 
 
 		 436 aa  99.4  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.401032  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  26.45 
 
 		 425 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0572  trigger factor  25.3 
 
 		 435 aa  98.2  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19365 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2233  trigger factor  24.83 
 
 		 447 aa  99  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0292986  normal  0.151028 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  25.9 
 
 		 425 aa  98.2  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2049  trigger factor  24.53 
 
 		 436 aa  99  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.431317  normal  0.217945 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1929  trigger factor  23.83 
 
 		 440 aa  98.2  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  26.17 
 
 		 425 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  26.17 
 
 		 425 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  26.91 
 
 		 427 aa  97.8  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  26.17 
 
 		 425 aa  97.8  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  26.17 
 
 		 425 aa  97.8  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  26.17 
 
 		 425 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2160  trigger factor  25 
 
 		 464 aa  97.8  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000432452 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  26.17 
 
 		 425 aa  97.8  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1741  trigger factor  25.42 
 
 		 437 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00658695 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3727  trigger factor  25.17 
 
 		 436 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.267155  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3698  trigger factor  24.54 
 
 		 436 aa  97.4  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1607  trigger factor  23.41 
 
 		 444 aa  97.1  6e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266404  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1392  trigger factor  23.57 
 
 		 460 aa  97.1  6e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.323159  normal  0.446961 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>