More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00132 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_00132  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 
269 aa  530  1e-149  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.256062  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1505  phosphomethylpyrimidine kinase  73.61 
 
 
269 aa  378  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0164576  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1688  phosphomethylpyrimidine kinase  66.16 
 
 
269 aa  360  2e-98  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.268945  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1619  phosphomethylpyrimidine kinase  65.4 
 
 
269 aa  357  8e-98  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.123369  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  50.59 
 
 
266 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  50.99 
 
 
271 aa  210  2e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  52.8 
 
 
268 aa  210  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  51.39 
 
 
260 aa  210  2e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  52.44 
 
 
268 aa  209  4e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  51.85 
 
 
270 aa  207  1e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  52 
 
 
268 aa  206  3e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  51.38 
 
 
269 aa  206  5e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  42.8 
 
 
264 aa  204  2e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  42.8 
 
 
264 aa  202  5e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  51.05 
 
 
285 aa  202  6e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  49.8 
 
 
266 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  53.48 
 
 
268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  42.92 
 
 
270 aa  199  3e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  45.64 
 
 
267 aa  193  2e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  50.42 
 
 
270 aa  193  3e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  48.19 
 
 
288 aa  192  6e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  48.19 
 
 
288 aa  192  6e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0605  phosphomethylpyrimidine kinase  49.19 
 
 
267 aa  191  9e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1942  phosphomethylpyrimidine kinase  53.72 
 
 
269 aa  189  5e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.719295  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2073  phosphomethylpyrimidine kinase  53.72 
 
 
269 aa  188  7e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  46.64 
 
 
262 aa  188  8e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0969  phosphomethylpyrimidine kinase  40.38 
 
 
263 aa  188  8e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.922433  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  42.5 
 
 
267 aa  188  9e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4315  phosphomethylpyrimidine kinase  48.91 
 
 
297 aa  187  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319953  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  48.76 
 
 
288 aa  187  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4493  phosphomethylpyrimidine kinase  51.43 
 
 
266 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5350  phosphomethylpyrimidine kinase  52.4 
 
 
269 aa  186  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.120967 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1236  phosphomethylpyrimidine kinase  53.31 
 
 
269 aa  185  7e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174718  normal  0.252768 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2060  phosphomethylpyrimidine kinase  52 
 
 
269 aa  184  9e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.373143 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6036  phosphomethylpyrimidine kinase type-2  52 
 
 
269 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.190496  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2041  phosphomethylpyrimidine kinase  52 
 
 
269 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5051  phosphomethylpyrimidine kinase  50.2 
 
 
274 aa  183  3e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4828  phosphomethylpyrimidine kinase  46.72 
 
 
273 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0641  phosphomethylpyrimidine kinase  41.6 
 
 
270 aa  182  6e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1100  phosphomethylpyrimidine kinase  41.6 
 
 
270 aa  181  8.000000000000001e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  47.18 
 
 
271 aa  181  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2392  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  51.54 
 
 
531 aa  181  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0171536  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  49.79 
 
 
268 aa  181  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1361  phosphomethylpyrimidine kinase  49.63 
 
 
268 aa  180  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0706  phosphomethylpyrimidine kinase  46.37 
 
 
268 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09330  phosphomethylpyrimidine kinase  46.09 
 
 
264 aa  179  4.999999999999999e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1140  phosphomethylpyrimidine kinase  43.93 
 
 
257 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.837771 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  42.13 
 
 
270 aa  179  4.999999999999999e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  43.15 
 
 
260 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  45.57 
 
 
265 aa  178  7e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  40.5 
 
 
269 aa  177  1e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0486  phosphomethylpyrimidine kinase  44.53 
 
 
284 aa  177  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10848  probable phosphomethylpyrimidine kinase (ThiD)  43.31 
 
 
269 aa  177  2e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0191434  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2146  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  50.22 
 
 
518 aa  177  2e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000135123 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3462  phosphomethylpyrimidine kinase  47.77 
 
 
484 aa  177  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3577  phosphomethylpyrimidine kinase  44.21 
 
 
266 aa  177  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.385467 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1225  phosphomethylpyrimidine kinase  40.34 
 
 
270 aa  176  3e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0928  phosphomethylpyrimidine kinase  45.65 
 
 
271 aa  176  4e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0346056  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  48.95 
 
 
285 aa  176  4e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1670  phosphomethylpyrimidine kinase  46.5 
 
 
260 aa  176  5e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.42362 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0372  phosphomethylpyrimidine kinase  47.26 
 
 
285 aa  175  5e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3463  phosphomethylpyrimidine kinase  45.97 
 
 
297 aa  176  5e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1617  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 
272 aa  175  7e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  43.3 
 
 
264 aa  175  8e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.192548  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2300  phosphomethylpyrimidine kinase  48.08 
 
 
267 aa  175  8e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.13158 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0100  bifunctional hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase/hydroxy-methylpyrimidine kinase  50.79 
 
 
301 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.504997  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3328  phosphomethylpyrimidine kinase  49.6 
 
 
303 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  46.95 
 
 
497 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3232  phosphomethylpyrimidine kinase  50.79 
 
 
453 aa  174  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1636  phosphomethylpyrimidine kinase  44.66 
 
 
499 aa  174  9.999999999999999e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0431333  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  41.84 
 
 
272 aa  174  9.999999999999999e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1124  phosphomethylpyrimidine kinase  37.96 
 
 
270 aa  173  1.9999999999999998e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  47.08 
 
 
266 aa  173  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0914  phosphomethylpyrimidine kinase  47.7 
 
 
282 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0556569  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3528  phosphomethylpyrimidine kinase  47.77 
 
 
484 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3091  phosphomethylpyrimidine kinase  45.45 
 
 
266 aa  173  1.9999999999999998e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0488797  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1935  phosphomethylpyrimidine kinase  45.71 
 
 
283 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0361  phosphomethylpyrimidine kinase  40.08 
 
 
262 aa  173  1.9999999999999998e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000143367  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1787  phosphomethylpyrimidine kinase  46.84 
 
 
308 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23579  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3651  phosphomethylpyrimidine kinase  50.4 
 
 
303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10762  thiamin biosynthesis protein (Thi-4), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10740)  43.08 
 
 
510 aa  173  2.9999999999999996e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.116224  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03000  hydroxymethylpyrimidine kinase/phosphomethylpyrimidine kinase  47.06 
 
 
265 aa  173  2.9999999999999996e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  47.69 
 
 
267 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.988766  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  42.98 
 
 
267 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  43.98 
 
 
270 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  46.74 
 
 
263 aa  172  5e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  47.95 
 
 
490 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  43.98 
 
 
270 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  44.58 
 
 
264 aa  171  7.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1958  phosphomethylpyrimidine kinase  53.31 
 
 
271 aa  171  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0610158  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  43.21 
 
 
267 aa  171  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2470  phosphomethylpyrimidine kinase  46.72 
 
 
280 aa  171  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1203  phosphomethylpyrimidine kinase  47.95 
 
 
266 aa  171  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.564031  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1419  phosphomethylpyrimidine kinase  44.53 
 
 
450 aa  171  1e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.528826 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  43.15 
 
 
270 aa  170  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  45.41 
 
 
497 aa  170  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1305  phosphomethylpyrimidine kinase  48.5 
 
 
323 aa  171  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.279698  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1321  phosphomethylpyrimidine kinase  48.18 
 
 
266 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0839  phosphomethylpyrimidine kinase  44.49 
 
 
449 aa  170  2e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.218839 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1658  phosphomethylpyrimidine kinase  50.19 
 
 
268 aa  169  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0210202 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>