More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4991 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4991  glycosyl transferase, group 1 family protein  100 
 
 		 376 aa  763    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0529  glycosyl transferase, group 1  94.15 
 
 		 376 aa  720    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.61936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0474  glycosyl transferase, group 1  80.7 
 
 		 376 aa  611  9.999999999999999e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4992  glycosyl transferase group 1  74.73 
 
 		 376 aa  580  1e-164  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4815  glycosyl transferase, group 1  74.2 
 
 		 376 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0525  glycosyl transferase group 1  74.53 
 
 		 376 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.566558  normal  0.175968 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4943  glycosyl transferase, putative  73.94 
 
 		 376 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66160  putative glycosyl transferase  71.66 
 
 		 378 aa  548  1e-155  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.266324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5739  putative glycosyl transferase  70.86 
 
 		 378 aa  543  1e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0587  glycosyl transferase, group 1  63.17 
 
 		 372 aa  471  1e-132  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.862017 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44790  Glycosyl transferase, group 1  66.94 
 
 		 386 aa  464  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0763  glycosyl transferase, group 1  53.42 
 
 		 364 aa  392  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0143067 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0477  glycosyl transferase, group 1  30.03 
 
 		 384 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.54725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0589  glycosyl transferase, group 1  29.78 
 
 		 381 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  30.59 
 
 		 381 aa  114  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2798  glycosyl transferase, group 1  28.99 
 
 		 390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  32.93 
 
 		 385 aa  109  6e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  35.71 
 
 		 377 aa  105  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  35.38 
 
 		 385 aa  104  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  36.08 
 
 		 377 aa  105  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  37.14 
 
 		 399 aa  105  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2719  glycosyl transferase, group 1  37.09 
 
 		 387 aa  104  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1787  glycosyl transferase group 1  29.86 
 
 		 383 aa  101  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  36.41 
 
 		 389 aa  101  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  37.14 
 
 		 371 aa  100  6e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  25.97 
 
 		 362 aa  97.4  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  32.26 
 
 		 403 aa  95.9  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  30.82 
 
 		 378 aa  95.9  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  34.3 
 
 		 390 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  35.71 
 
 		 393 aa  94.7  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 424 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  33.85 
 
 		 391 aa  94.4  3e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  33.89 
 
 		 384 aa  94.7  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  32.75 
 
 		 386 aa  94  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4712  glycosyl transferase group 1  34.18 
 
 		 391 aa  94  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.590232 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.43 
 
 		 396 aa  93.2  6e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2139  putative lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase protein  37.5 
 
 		 364 aa  93.6  6e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  33.85 
 
 		 391 aa  93.2  7e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13028  Glycosyl transferase group 1  29.33 
 
 		 365 aa  92.8  8e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 398 aa  92  1e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  40.59 
 
 		 389 aa  92.4  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  30.27 
 
 		 398 aa  92.4  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2204  glycosyl transferase group 1  39.57 
 
 		 372 aa  92.4  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200727  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05202  glycosyltransferase  28.32 
 
 		 350 aa  91.7  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  27.96 
 
 		 376 aa  91.7  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4592  glycosyl transferase group 1  27.18 
 
 		 370 aa  91.3  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  31.88 
 
 		 374 aa  91.3  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001321  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsF glycosyltransferase  25.18 
 
 		 350 aa  90.5  5e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  31.12 
 
 		 390 aa  90.5  5e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  33.53 
 
 		 369 aa  90.1  6e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4759  glycosyl transferase group 1  35.24 
 
 		 374 aa  90.1  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000028902  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  31.5 
 
 		 413 aa  90.1  6e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  33.73 
 
 		 390 aa  90.1  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3286  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase protein  36.04 
 
 		 419 aa  89.7  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5157  group 1 glycosyl transferase  33.33 
 
 		 399 aa  89  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  31.61 
 
 		 391 aa  89  1e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1695  glycosyl transferase, group 1  33.94 
 
 		 384 aa  89.4  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.242098  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0358  glycosyl transferase group 1  31.71 
 
 		 364 aa  89.4  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.662771 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  31.05 
 
 		 371 aa  88.6  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  32.62 
 
 		 393 aa  89  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1252  phosphatidylserine decarboxylase  35.52 
 
 		 340 aa  89.4  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277456  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0195  glycosyl transferase, group 1  38.79 
 
 		 386 aa  89  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2253  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.14 
 
 		 371 aa  88.6  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.531555  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3442  glycosyl transferase group 1  36.72 
 
 		 385 aa  88.2  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  35.84 
 
 		 373 aa  88.2  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  31.39 
 
 		 421 aa  88.6  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3273  glycosyl transferase, group 1  31.53 
 
 		 392 aa  88.2  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0839  glycosyltransferase-like protein  33.5 
 
 		 822 aa  87.8  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2762  glycosyl transferase, group 1  29.47 
 
 		 309 aa  87.4  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.873929  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1028  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.13 
 
 		 380 aa  87.4  4e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2209  glycosyl transferase group 1  32.98 
 
 		 379 aa  87  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  26.73 
 
 		 536 aa  87  5e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  33.05 
 
 		 399 aa  86.7  5e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4834  glycosyl transferase group 1  34.64 
 
 		 365 aa  86.7  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0981123  hitchhiker  0.0000464938 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  26.77 
 
 		 434 aa  86.3  7e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30000  Glycosyl transferase, group 1 family protein  30.99 
 
 		 370 aa  86.7  7e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  28.16 
 
 		 390 aa  86.3  9e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  30.6 
 
 		 387 aa  85.5  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2637  glycosyl transferase, group 1  29.86 
 
 		 345 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  36.18 
 
 		 386 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  26.06 
 
 		 395 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.85 
 
 		 373 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1259  glycosyl transferase group 1  35.53 
 
 		 419 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0977722  normal  0.300588 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2867  glycosyl transferase, group 1  33.5 
 
 		 415 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  31.22 
 
 		 446 aa  85.1  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  33.15 
 
 		 410 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1715  glycosyl transferase, group 1  30.38 
 
 		 375 aa  85.1  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.546177  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0755  glycosyl transferase, group 1  32.31 
 
 		 420 aa  84.7  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00665755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0896  hypothetical protein  30.3 
 
 		 393 aa  85.1  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.143199  hitchhiker  0.00101666 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  31.5 
 
 		 373 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3090  glycosyl transferase, group 1  40.3 
 
 		 440 aa  85.1  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0297  putative glycosyl transferase  28.72 
 
 		 362 aa  84.3  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  29.05 
 
 		 419 aa  84.3  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  33.5 
 
 		 415 aa  84  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02469  putative glycosyltransferase  31.96 
 
 		 379 aa  84  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  34.44 
 
 		 401 aa  84  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2180  glycosyl transferase group 1  28.8 
 
 		 376 aa  83.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  35.56 
 
 		 371 aa  83.2  0.000000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1211  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.71 
 
 		 420 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.417832  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3935  glycosyl transferase group 1  29.64 
 
 		 367 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000241521  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>