192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1798 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1798  hypothetical protein  100 
 
 		 269 aa  530  1e-149  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21070  MerR family transcriptional regulator  99.14 
 
 		 232 aa  454  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.471821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3330  MerR family transcriptional regulator  60.84 
 
 		 272 aa  292  3e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0993383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0149  transcriptional regulator, MerR family  49.19 
 
 		 248 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3080  transcription regulator protein  45.31 
 
 		 256 aa  202  6e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.730873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2333  MerR family transcriptional regulator  43.44 
 
 		 253 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3602  MerR family transcriptional regulator  45.08 
 
 		 293 aa  198  7e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3363  transcriptional regulator, MerR family  44.13 
 
 		 272 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.65953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3016  transcriptional regulator, MerR family  44.13 
 
 		 272 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1788  MerR family transcriptional regulator  46.06 
 
 		 297 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000131469 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0462  transcriptional regulator, MerR family  41.39 
 
 		 264 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.102966 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4881  transcriptional regulator, MerR family  45.93 
 
 		 288 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.458694  normal  0.771198 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3698  MerR family transcriptional regulator  43.6 
 
 		 282 aa  185  5e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609999  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4670  MerR family transcriptional regulator  43.6 
 
 		 282 aa  185  5e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.940044  normal  0.613988 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5630  MerR family transcriptional regulator  43.6 
 
 		 282 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122388  normal  0.561699 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1153  MerR family transcriptional regulator  43.2 
 
 		 279 aa  185  8e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0304735  normal  0.508329 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4022  MerR family transcriptional regulator  43.65 
 
 		 279 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28056  normal  0.857059 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0231  transcriptional regulator, MerR family  43.91 
 
 		 250 aa  177  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1468  MerR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 285 aa  177  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2529  MerR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 285 aa  175  7e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0285  MerR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 285 aa  175  7e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.184763  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0555  MerR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 285 aa  175  7e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119185  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1351  MerR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 285 aa  175  7e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0327248  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1273  MerR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 285 aa  175  7e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1013  MerR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 285 aa  175  7e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0106241  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4518  MerR family transcriptional regulator  43.2 
 
 		 282 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584937  normal  0.575813 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1302  MerR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 268 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4060  MerR family transcriptional regulator  42.8 
 
 		 282 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00710658  normal  0.227534 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1518  MerR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 288 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545801 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4902  MerR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337456  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0776  regulatory protein MerR  37.87 
 
 		 272 aa  142  5e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4750  transcriptional regulator, MerR family  34.02 
 
 		 243 aa  116  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.772196  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4344  regulatory protein MerR  32 
 
 		 264 aa  113  4.0000000000000004e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3819  regulatory protein MerR  36.47 
 
 		 297 aa  112  6e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.977775  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4126  MerR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 261 aa  95.1  9e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711987 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2531  MerR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 246 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.410302  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3650  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 259 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0795396  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3723  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 259 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.913976 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3663  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 259 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.532115 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1157  transcriptional regulator, MerR family  36.16 
 
 		 258 aa  89.7  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4271  transcriptional regulator, MerR family  29.1 
 
 		 262 aa  87.4  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.194258  normal  0.647019 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5121  transcriptional regulator, MerR family  32.66 
 
 		 242 aa  86.7  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3512  transcriptional regulator, MerR family  50.75 
 
 		 251 aa  80.1  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5802  transcriptional regulator, MerR family  33.15 
 
 		 284 aa  74.7  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1430  transcriptional regulator, MerR family  46.91 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.130007  normal  0.485128 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2120  MerR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 147 aa  52.4  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00663209  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2617  transcriptional regulator MerR family  40 
 
 		 130 aa  52  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0874214  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2435  MerR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 135 aa  51.2  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0461  MerR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 174 aa  50.4  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0313707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0189  MerR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 251 aa  50.4  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000528069  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2071  MerR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 177 aa  49.7  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.776641  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  39.78 
 
 		 135 aa  49.7  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  44.62 
 
 		 155 aa  49.3  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2733  MerR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 135 aa  48.1  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4378  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 242 aa  47.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 137 aa  48.1  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000376  predicted transcriptional regulator LiuR of leucine degradation pathway MerR family  38.57 
 
 		 128 aa  47.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 138 aa  47.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2155  transcriptional regulator, MerR family  40.85 
 
 		 167 aa  48.1  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000155365  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2068  transcriptional regulator, MerR family  36.49 
 
 		 128 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001544  predicted transcriptional regulator LiuR of leucine degradation pathway MerR family  30.09 
 
 		 124 aa  47.4  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1662  MerR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 215 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1865  transcriptional regulator, MerR family  36.49 
 
 		 128 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.0420495 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2848  MerR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 142 aa  47  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05481  hypothetical protein  36.62 
 
 		 127 aa  46.6  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2284  transcriptional regulator, MerR family  44.78 
 
 		 215 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35600  predicted transcriptional regulator  39.44 
 
 		 319 aa  46.6  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.172761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2122  MerR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 131 aa  46.2  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392854  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2195  transcriptional regulator, MerR family  44.78 
 
 		 214 aa  46.2  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0543  transcriptional regulator, MerR family  42.65 
 
 		 252 aa  46.6  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1338  MerR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 135 aa  46.2  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.683374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0085  MerR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 117 aa  46.2  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2788  MerR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 127 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.291885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2967  MerR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 127 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1034  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 128 aa  45.8  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0151455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2323  putative transcriptional regulator MerR  40.32 
 
 		 144 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4888  transcriptional regulator, MerR family  32.93 
 
 		 92 aa  45.4  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.715098  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3347  transcription regulator protein  38.57 
 
 		 159 aa  45.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445877  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1749  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 241 aa  45.1  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.682518  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1444  transcriptional regulator, MerR family  27.98 
 
 		 243 aa  45.4  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0102884  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0082  MerR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 117 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2796  MerR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 132 aa  45.4  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4341  putative transcriptional regulator MerR  32.53 
 
 		 151 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0086  MerR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 117 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1415  transcriptional regulator, MerR family  34.78 
 
 		 143 aa  45.1  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000599633  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5351  transcriptional regulator, MerR family  34.25 
 
 		 144 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0379309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1599  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 131 aa  45.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0210  putative transcriptional regulator, MerR family  46.97 
 
 		 215 aa  45.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.024863  hitchhiker  0.00385009 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0800  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 142 aa  44.3  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.876996 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2059  transcriptional regulator, MerR family  31.71 
 
 		 145 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1531  transcriptional regulator, MerR family  30.68 
 
 		 135 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.152534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2760  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  34.33 
 
 		 135 aa  44.3  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0477  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 173 aa  43.9  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2572  MerR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 141 aa  44.3  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3892  MerR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 149 aa  44.3  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00526993  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1562  transcriptional regulator  40.91 
 
 		 160 aa  44.7  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3449  MerR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 98 aa  44.3  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0770  MerR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 151 aa  44.3  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.744449  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1138  putative transcriptional regulator  35.21 
 
 		 128 aa  44.3  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0775517  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0034  MerR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 144 aa  44.3  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>