203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0272 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0272  cobalamin-5'-phosphate synthase  100 
 
 		 246 aa  486  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02921  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  91.46 
 
 		 246 aa  402  1e-111  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0345622  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03031  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  70.82 
 
 		 233 aa  322  4e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.241738  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02931  cobalamin-5-phosphate synthase  92.35 
 
 		 170 aa  288  8e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02971  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  45.8 
 
 		 268 aa  188  8e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24891  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  36.97 
 
 		 260 aa  156  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0268  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  33.89 
 
 		 251 aa  143  2e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0239  cobalamin-5'-phosphate synthase  33.62 
 
 		 256 aa  142  4e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1636  cobalamin-5'-phosphate synthase  42.71 
 
 		 193 aa  137  2e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03491  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  42.22 
 
 		 193 aa  131  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0802141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2824  cobalamin synthase  29.75 
 
 		 252 aa  102  7e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.373504  normal  0.209175 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2458  cobalamin synthase  34.62 
 
 		 254 aa  101  9e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0507  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.47 
 
 		 255 aa  96.7  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3403  cobalamin synthase  28.28 
 
 		 256 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0454  cobalamin synthase  29.36 
 
 		 251 aa  86.3  4e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0306  cobalamin synthase  30.17 
 
 		 250 aa  80.1  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2703  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.75 
 
 		 249 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3225  cobalamin synthase  32.3 
 
 		 264 aa  75.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1081  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.03 
 
 		 249 aa  75.5  0.0000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1000  cobalamin-5'-phosphate synthase  29.92 
 
 		 248 aa  73.9  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5686  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  25.1 
 
 		 270 aa  73.2  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00218836  normal  0.146297 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2186  cobalamin synthase  27.27 
 
 		 247 aa  72.8  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2139  cobalamin synthase  26.36 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1110  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.6 
 
 		 251 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2193  cobalamin synthase  26.36 
 
 		 247 aa  71.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2239  cobalamin synthase  26.36 
 
 		 247 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.222569 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4485  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  28.49 
 
 		 267 aa  70.5  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0546206 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1291  cobalamin-5-phosphate synthase  30.17 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.374945  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2352  cobalamin synthase  26.36 
 
 		 247 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0217027  normal  0.0119104 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2176  cobalamin 5'-phosphate synthase  25.43 
 
 		 251 aa  70.1  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.880106 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3090  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.53 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  hitchhiker  0.00160126 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1410  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  28.69 
 
 		 261 aa  68.9  0.00000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.293484  normal  0.234368 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1036  cobalamin synthase  29.05 
 
 		 262 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1196  cobalamin synthase  30.57 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0281  cobalamin 5'-phosphate synthase  29.55 
 
 		 253 aa  67.8  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0326517  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01901  cobalamin synthase  25 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0133526  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1664  cobalamin 5'-phosphate synthase  25 
 
 		 247 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0171207  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01890  hypothetical protein  25 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0142909  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3152  cobalamin synthase  28.63 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203251  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2274  cobalamin synthase  24.88 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00105955  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2837  cobalamin synthase  25 
 
 		 247 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0121943  normal  0.903925 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2115  cobalamin synthase  24.88 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0966  cobalamin synthase  24.88 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000884194  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1132  cobalamin synthase  24.88 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00743672  hitchhiker  0.000086759 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2743  cobalamin 5'-phosphate synthase  35.96 
 
 		 252 aa  66.6  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0979893 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1230  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.41 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1169  cobalamin synthase  29.94 
 
 		 260 aa  65.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0843  cobalamin synthase  29.05 
 
 		 262 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3179  cobalamin synthase  29.05 
 
 		 262 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3277  cobalamin synthase  29.05 
 
 		 262 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.08655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1467  cobalamin 5'-phosphate synthase  28.66 
 
 		 246 aa  62.4  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0715  cobalamin 5'-phosphate synthase  25.91 
 
 		 255 aa  62.4  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1636  cobalamin synthase  24.41 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.012457 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2659  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.61 
 
 		 264 aa  62  0.000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1490  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  34.74 
 
 		 248 aa  62  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00341878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02127  cobalamin synthase  30.1 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0111  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  33.15 
 
 		 240 aa  60.8  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0543607  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1118  cobalamin synthase  33.33 
 
 		 262 aa  60.8  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1783  cobalamin 5'-phosphate synthase  21.54 
 
 		 275 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3658  cobalamin synthase  29.06 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.095174  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4083  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.53 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0627  cobalamin-5'-phosphate synthase  28.17 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000135843  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2609  cobalamin 5'-phosphate synthase  23.11 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.801369 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003692  cobalamin synthase  32.18 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0149  cobalamin synthase  24.38 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2650  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.59 
 
 		 323 aa  59.3  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1172  cobalamin 5'-phosphate synthase  24.19 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1295  cobalamin 5'-phosphate synthase  34.02 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3283  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  33.71 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.284158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2325  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.1 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.274821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2016  cobalamin synthase  25.43 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.424584  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1000  cobalamin synthase  29.58 
 
 		 262 aa  58.5  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1012  cobalamin synthase  29.58 
 
 		 262 aa  58.5  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.897251 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0978  cobalamin synthase  29.58 
 
 		 262 aa  58.5  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0645  cobalamin synthase  29.79 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0206285  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3363  cobalamin synthase  29.58 
 
 		 262 aa  58.9  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_596  cobalamin 5-prime-phosphate synthase  28.57 
 
 		 254 aa  58.2  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326048  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1057  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  24.75 
 
 		 252 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000840999  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3135  cobalamin-5'-phosphate synthase  26.29 
 
 		 239 aa  58.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3733  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.37 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.65083 
 
 
-
 
NC_002936  DET0658  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.38 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0979508  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0692  cobalamin 5'-phosphate synthase  27.38 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0703  cobalamin (5'-phosphate) synthase, putative  29.67 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000467859 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0860  cobalamin synthase  22.82 
 
 		 261 aa  57  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1566  cobalamin 5'-phosphate synthase  43.33 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212563  normal  0.0205938 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2960  cobalamin synthase  28.43 
 
 		 262 aa  57.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1027  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  28.21 
 
 		 277 aa  57  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1055  cobalamin 5'-phosphate synthase  36.76 
 
 		 249 aa  57  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3379  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.16 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1102  cobalamin-5'-phosphate synthase  21.35 
 
 		 261 aa  56.2  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1252  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.16 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.15085  normal  0.879505 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2427  cobalamin-5'-phosphate synthase  44.23 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.01359  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3306  cobalamin-5'-phosphate synthase  28.72 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000293858  normal  0.059508 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3287  cobalamin 5'-phosphate synthase  26.42 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00100979  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1090  cobalamin 5'-phosphate synthase  44.23 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.181671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4260  cobalamin 5'-phosphate synthase  31.78 
 
 		 265 aa  55.1  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.907003  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2662  cobalamin synthase  20.08 
 
 		 256 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0999  cobalamin 5'-phosphate synthase  30.22 
 
 		 242 aa  55.1  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0763  cobalamin 5'-phosphate synthase  32.04 
 
 		 260 aa  55.1  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1604  cobalamin synthase  25.37 
 
 		 262 aa  55.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122296  normal  0.217032 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>