More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0035 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008816  A9601_00341  soluble hydrogenase small subunit  93.02 
 
 		 387 aa  746    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00341  soluble hydrogenase small subunit  80.21 
 
 		 387 aa  663    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0035  soluble hydrogenase small subunit  100 
 
 		 387 aa  796    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  94.03 
 
 		 387 aa  751    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  66.75 
 
 		 385 aa  552  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1361  soluble hydrogenase small subunit  66.94 
 
 		 384 aa  549  1e-155  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00331  soluble hydrogenase small subunit  66.94 
 
 		 384 aa  549  1e-155  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00431  soluble hydrogenase small subunit  67.31 
 
 		 382 aa  528  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0040  soluble hydrogenase small subunit  66.58 
 
 		 397 aa  523  1e-147  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0044  soluble hydrogenase small subunit  65.93 
 
 		 382 aa  518  1e-146  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0191  Serine--glyoxylate transaminase  63.19 
 
 		 382 aa  485  1e-136  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.746637 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  61.26 
 
 		 382 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  61.26 
 
 		 382 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3803  aminotransferase class V  61.45 
 
 		 384 aa  478  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3167  Serine--glyoxylate transaminase  57.44 
 
 		 385 aa  465  9.999999999999999e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  57.99 
 
 		 386 aa  463  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0103  class V aminotransferase  58.24 
 
 		 382 aa  450  1e-125  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2693  aminotransferase class V  46.99 
 
 		 381 aa  340  2.9999999999999998e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00390195  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  46.26 
 
 		 383 aa  338  7e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0040  aminotransferase class V  45.83 
 
 		 385 aa  331  2e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0119169  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0575  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  45.8 
 
 		 362 aa  321  9.999999999999999e-87  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0600  soluble hydrogenase, tritium exchange subunit  44.64 
 
 		 362 aa  317  3e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00706485  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_540  aminotransferase, class V  44.64 
 
 		 362 aa  316  4e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0499245  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0008  serine--glyoxylate transaminase  43.7 
 
 		 383 aa  316  4e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0160251  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  41.27 
 
 		 363 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  42.42 
 
 		 384 aa  311  1e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2126  aminotransferase class V  43.21 
 
 		 386 aa  309  5.9999999999999995e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000896436  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  42.15 
 
 		 384 aa  308  6.999999999999999e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  40.8 
 
 		 384 aa  308  8e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  42.47 
 
 		 385 aa  306  5.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  43.33 
 
 		 382 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  43.61 
 
 		 382 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0111  aminotransferase, class V  43.53 
 
 		 380 aa  302  6.000000000000001e-81  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  43.33 
 
 		 382 aa  300  3e-80  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  43.06 
 
 		 382 aa  299  7e-80  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0019  Serine--glyoxylate transaminase  39.83 
 
 		 388 aa  298  8e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000322298  hitchhiker  0.00000185369 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4341  aminotransferase class V  43.32 
 
 		 382 aa  291  1e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.182025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0836  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  40.38 
 
 		 400 aa  290  2e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.259424  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2460  Serine--glyoxylate transaminase  40.44 
 
 		 379 aa  290  2e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1504  aminotransferase class V  43.09 
 
 		 379 aa  290  3e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0104  aminotransferase class V  39.55 
 
 		 380 aa  281  2e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  39.45 
 
 		 383 aa  280  3e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0217  Serine--glyoxylate transaminase  39.34 
 
 		 379 aa  280  4e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1323  alanine--glyoxylate transaminase  41.32 
 
 		 387 aa  279  5e-74  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0257  response regulator receiver protein  39.73 
 
 		 382 aa  279  6e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0155  Serine--glyoxylate transaminase  39.35 
 
 		 380 aa  278  8e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2300  Serine--glyoxylate transaminase  39.34 
 
 		 379 aa  278  9e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000212673  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2307  alanine--glyoxylate transaminase  40.44 
 
 		 360 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  39.89 
 
 		 384 aa  273  4.0000000000000004e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0106  aminotransferase, class V  39.78 
 
 		 379 aa  273  5.000000000000001e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0514  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  40.43 
 
 		 380 aa  266  5e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2804  Serine--glyoxylate transaminase  39.14 
 
 		 399 aa  265  8.999999999999999e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19938  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1813  aminotransferase class V  35.75 
 
 		 385 aa  264  2e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.300679  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1778  aminotransferase, class V  35.75 
 
 		 385 aa  264  2e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.182739  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2405  aminotransferase class V  36.19 
 
 		 395 aa  261  1e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.134118 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5729  Serine-glyoxylate aminotransferase  36.57 
 
 		 401 aa  260  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4717  Serine--glyoxylate transaminase  38.9 
 
 		 391 aa  260  3e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393654 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2080  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  39.78 
 
 		 383 aa  257  2e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00351015  normal  0.87954 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2413  aminotransferase, class V  38.5 
 
 		 415 aa  257  2e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0849168 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4200  aminotransferase class V  39.67 
 
 		 391 aa  258  2e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.357141 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3524  Serine--glyoxylate transaminase  38.76 
 
 		 398 aa  256  4e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.119567  normal  0.298821 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4570  Serine--glyoxylate transaminase  39.83 
 
 		 391 aa  256  4e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0189325 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3400  Serine--glyoxylate transaminase  39.34 
 
 		 402 aa  256  6e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3325  serine--glyoxylate aminotransferase  36.84 
 
 		 422 aa  253  5.000000000000001e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1731  Serine--pyruvate transaminase  37.77 
 
 		 381 aa  251  1e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.186952 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0923  aminotransferase, class V  37.54 
 
 		 401 aa  251  2e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000440044  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5728  serine-glyoxylate aminotransferase  38.66 
 
 		 395 aa  250  3e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4253  Serine--glyoxylate transaminase  37.34 
 
 		 406 aa  249  7e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2475  Serine--glyoxylate transaminase  38.01 
 
 		 377 aa  248  1e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3452  aminotransferase, class V  35.36 
 
 		 391 aa  247  2e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0053  aminotransferase, class V  40.66 
 
 		 376 aa  248  2e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3052  Serine--glyoxylate transaminase  37.23 
 
 		 413 aa  246  3e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160259 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2447  Serine--glyoxylate transaminase  34.9 
 
 		 389 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.372161 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1162  aminotransferase, class V  36.09 
 
 		 398 aa  245  8e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000700049  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6959  Serine--glyoxylate transaminase  37 
 
 		 406 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0602  Serine--glyoxylate transaminase  36.55 
 
 		 394 aa  245  9.999999999999999e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5630  Serine-glyoxylate aminotransferase (SGAT)  39.38 
 
 		 401 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3418  Serine--glyoxylate transaminase  39.09 
 
 		 400 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3001  Serine--glyoxylate transaminase  37.67 
 
 		 406 aa  244  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000231297  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2906  aminotransferase class V  36.81 
 
 		 414 aa  242  6e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5140  aminotransferase, class V  36.84 
 
 		 406 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3022  aminotransferase, class V  36.27 
 
 		 406 aa  241  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.376021 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0781  aminotransferase, class V  36.83 
 
 		 381 aa  241  2e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.329422  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0418  Alanine--glyoxylate transaminase  40.11 
 
 		 375 aa  239  8e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3921  Serine--glyoxylate transaminase  34.81 
 
 		 396 aa  238  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2753  aminotransferase, class V  36.97 
 
 		 406 aa  237  3e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0548  Serine--glyoxylate transaminase  37.09 
 
 		 403 aa  236  4e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3308  serine-glyoxylate aminotransferase  33.51 
 
 		 398 aa  236  4e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.662608  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3261  serine-glyoxylate aminotransferase  34.12 
 
 		 415 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.491157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1714  aminotransferase class V  35.36 
 
 		 396 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.280776 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0804  aminotransferase class V  34.6 
 
 		 394 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0056  aminotransferase, class V  39.61 
 
 		 376 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1762  aminotransferase class V  34.4 
 
 		 412 aa  234  3e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.229115  normal  0.0159311 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1388  serine-glyoxylate aminotransferase  33.6 
 
 		 391 aa  233  4.0000000000000004e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0981  aminotransferase, class V  33.78 
 
 		 391 aa  233  4.0000000000000004e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3670  aminotransferase class V  35.22 
 
 		 402 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.569732 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1747  aminotransferase class V  34.02 
 
 		 402 aa  231  1e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.223279 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2131  aminotransferase class V  34.19 
 
 		 402 aa  232  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6552  Serine--glyoxylate transaminase  34.81 
 
 		 417 aa  231  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.323999 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2489  putative serine--glyoxylate aminotransferase  36.19 
 
 		 400 aa  231  2e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>