More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_50547 on replicon NC_009048
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009045  PICST_65748  glycerophosphoinositol permease  79.84 
 
 		 515 aa  830    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50547  glycerophosphoinositol permease  100 
 
 		 530 aa  1076    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05549  MFS phospholipid transporter (Git1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07750)  55.6 
 
 		 488 aa  498  1e-139  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND01860  phospholipid transporter, putative  42.15 
 
 		 519 aa  389  1e-107  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31573  permease involved in the uptake of glycerophosphoinositol (GroPIns)  33.4 
 
 		 508 aa  259  6e-68  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00040  metabolite transporter, putative  31.59 
 
 		 502 aa  216  9.999999999999999e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.160358  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02864  conserved hypothetical protein  27.13 
 
 		 473 aa  172  1e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0694  General substrate transporter  28.33 
 
 		 459 aa  152  1e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1718  phosphate transporter  27.97 
 
 		 443 aa  131  4.0000000000000003e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.140032  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0727  phosphate transporter  25.44 
 
 		 442 aa  129  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0471  putative iorganic phosphate transporter  28.44 
 
 		 441 aa  129  2.0000000000000002e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0831  putative iorganic phosphate transporter  25.44 
 
 		 442 aa  128  3e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3608  general substrate transporter  28.05 
 
 		 469 aa  125  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2879  General substrate transporter  29.09 
 
 		 465 aa  125  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0325  major facilitator superfamily MFS_1  25.93 
 
 		 477 aa  124  4e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.184754  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0920  General substrate transporter  25.91 
 
 		 471 aa  106  1e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05935  MFS phosphate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10690)  25.53 
 
 		 663 aa  101  4e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0846  general substrate transporter  25.5 
 
 		 442 aa  94.7  3e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1924  major facilitator superfamily MFS_1  26.81 
 
 		 465 aa  90.9  6e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0712  general substrate transporter  24.46 
 
 		 463 aa  90.9  6e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0221085  hitchhiker  0.00000000000000199551 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2277  major facilitator family transporter  26.81 
 
 		 465 aa  90.9  6e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01210  Pi-transporter A-1, putative  24.24 
 
 		 729 aa  89.7  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1633  general substrate transporter  24.54 
 
 		 476 aa  89.7  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.904084  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46692  predicted protein  23.23 
 
 		 566 aa  89  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2863  major facilitator superfamily MFS_1  23.2 
 
 		 423 aa  88.2  3e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.82901  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1094  major facilitator transporter  25.29 
 
 		 427 aa  87.4  6e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1618  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 458 aa  87  8e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82453  inorganic phosphate transporter, transmembrane protein  23.34 
 
 		 555 aa  86.7  9e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.10716  normal  0.589163 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1265  General substrate transporter  25.06 
 
 		 451 aa  85.9  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1434  General substrate transporter  23.27 
 
 		 460 aa  84.3  0.000000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1512  general substrate transporter  25.35 
 
 		 467 aa  83.6  0.000000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.925564  normal  0.774713 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  26.01 
 
 		 398 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  25.32 
 
 		 399 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4043  general substrate transporter  25.99 
 
 		 452 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17265  predicted protein  24.09 
 
 		 663 aa  80.5  0.00000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  26.15 
 
 		 399 aa  80.5  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  24.3 
 
 		 399 aa  80.5  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  26.15 
 
 		 399 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  25.58 
 
 		 399 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  25.32 
 
 		 399 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  25.58 
 
 		 399 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  25.58 
 
 		 399 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  25.58 
 
 		 399 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  25.51 
 
 		 399 aa  78.2  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03960  phosphate transporter, putative  25.1 
 
 		 555 aa  78.2  0.0000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.362408  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0426  major facilitator transporter  23.85 
 
 		 452 aa  78.2  0.0000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  25.32 
 
 		 399 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3234  general substrate transporter  24.72 
 
 		 445 aa  77  0.0000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1829  General substrate transporter  23.86 
 
 		 480 aa  76.3  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.392144  normal  0.18053 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0049  major facilitator family transporter  25.4 
 
 		 443 aa  75.9  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00049  predicted transporter  25.4 
 
 		 443 aa  74.7  0.000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3554  major facilitator superfamily MFS_1  25.4 
 
 		 443 aa  74.7  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3610  major facilitator transporter  25.4 
 
 		 443 aa  74.7  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0100231 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0051  major facilitator family transporter  25.4 
 
 		 443 aa  74.7  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00048  hypothetical protein  25.4 
 
 		 443 aa  74.7  0.000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2255  general substrate transporter  22.15 
 
 		 446 aa  74.7  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000684239  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4572  General substrate transporter  25.35 
 
 		 477 aa  73.9  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0049  major facilitator family transporter  25.17 
 
 		 443 aa  73.9  0.000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0047  major facilitator family transporter  25.4 
 
 		 443 aa  73.9  0.000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.454742 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01612  phosphate transporter (AFU_orthologue; AFUA_4G09210)  28.89 
 
 		 664 aa  72.8  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0276272 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2681  general substrate transporter  24.15 
 
 		 438 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.31051 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0866  general substrate transporter  24.2 
 
 		 458 aa  70.9  0.00000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.580989  normal  0.629225 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_39515  predicted protein  23.1 
 
 		 623 aa  70.5  0.00000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1809  major facilitator family protein  23.19 
 
 		 499 aa  68.6  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0025  major facilitator family transporter  22.99 
 
 		 454 aa  68.9  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2238  glucose transport protein  24.12 
 
 		 471 aa  68.9  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.154375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0089  putative metabolite transport protein YaaU  24.5 
 
 		 468 aa  68.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.343682  normal  0.458255 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0088  putative metabolite transport protein YaaU  24.5 
 
 		 468 aa  68.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0086  putative metabolite transport protein YaaU  24.5 
 
 		 468 aa  68.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.509383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1377  major facilitator superfamily MFS_1  29.47 
 
 		 445 aa  68.6  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0897  major facilitator superfamily MFS_1  26.05 
 
 		 447 aa  68.2  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0894914  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0085  putative metabolite transport protein YaaU  24.28 
 
 		 468 aa  68.2  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0085  putative metabolite transport protein YaaU  24.28 
 
 		 468 aa  68.2  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  29.51 
 
 		 435 aa  66.2  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0245  putative permease  25.82 
 
 		 449 aa  65.5  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0461827  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0313  major facilitator superfamily MFS_1  30.65 
 
 		 489 aa  65.1  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  29.51 
 
 		 473 aa  65.1  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1598  general substrate transporter  21.51 
 
 		 456 aa  64.7  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0615669  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0730  General substrate transporter  23.4 
 
 		 464 aa  63.9  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3374  major facilitator superfamily MFS_1  25.14 
 
 		 398 aa  63.9  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000527195  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  23.85 
 
 		 447 aa  63.5  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1484  major facilitator superfamily MFS_1  24.18 
 
 		 474 aa  62.8  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.074526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09740  putative MFS transporter  23.7 
 
 		 442 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00809883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  21.71 
 
 		 457 aa  62  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2481  major facilitator transporter  22.32 
 
 		 496 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29790  sugar phosphate permease  29 
 
 		 485 aa  62  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0959  sugar transporter  28.02 
 
 		 472 aa  62  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  25.95 
 
 		 451 aa  61.2  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2467  major facilitator transporter  20.63 
 
 		 453 aa  60.8  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  22.41 
 
 		 463 aa  60.1  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1269  general substrate transporter  26.02 
 
 		 470 aa  59.7  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.33062  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0479  sugar transporter  21.29 
 
 		 471 aa  60.1  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749242  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1172  MFS transporter  20.53 
 
 		 489 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.537598  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1518  major facilitator superfamily permease  20.53 
 
 		 489 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.28243  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1432  major facilitator family transporter  20.53 
 
 		 489 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1122  major facilitator transporter  21.03 
 
 		 482 aa  58.9  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1551  major facilitator transporter  30.1 
 
 		 485 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  0.0914413 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1314  General substrate transporter  24.51 
 
 		 470 aa  58.9  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000012233 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0914  major facilitator transporter  29.94 
 
 		 434 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00481205  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  29.28 
 
 		 451 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>