110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_28317 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_28317  AP endonuclease  100 
 
 		 482 aa  996    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.563607 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04736  DNA lyase Apn2 (AFU_orthologue; AFUA_3G06180)  35.16 
 
 		 612 aa  175  1.9999999999999998e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.847372  normal  0.290859 
 
 
-
 
NC_006694  CNI04070  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, putative  29.5 
 
 		 654 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.434844  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2558  exodeoxyribonuclease III  22.73 
 
 		 262 aa  75.5  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1497  exodeoxyribonuclease III Xth  24.51 
 
 		 253 aa  73.6  0.000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31440  predicted protein  23.5 
 
 		 474 aa  72.4  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2456  exodeoxyribonuclease III  23.48 
 
 		 259 aa  70.9  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_5808  predicted protein  23.58 
 
 		 273 aa  69.3  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000562371  normal  0.329515 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0130  exodeoxyribonuclease III  23.53 
 
 		 257 aa  68.6  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0392835 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3322  exodeoxyribonuclease III Xth  24.57 
 
 		 253 aa  67.8  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000530541  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0042  exodeoxyribonuclease III Xth  22.97 
 
 		 261 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.169682 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0036  exodeoxyribonuclease III Xth  22.97 
 
 		 261 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0890  exodeoxyribonuclease III Xth  21.73 
 
 		 254 aa  66.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0881  exodeoxyribonuclease III Xth  21.88 
 
 		 268 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1247  exodeoxyribonuclease III Xth  25.48 
 
 		 255 aa  65.1  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0140  putative exodeoxyribonuclease III protein  22.84 
 
 		 261 aa  63.5  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0949  exodeoxyribonuclease III  24.29 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2145  exodeoxyribonuclease III  23.38 
 
 		 251 aa  62.8  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0982  exodeoxyribonuclease III  24.5 
 
 		 250 aa  63.2  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0057  exodeoxyribonuclease III Xth  23.03 
 
 		 259 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0120  exodeoxyribonuclease III Xth  22.8 
 
 		 285 aa  61.6  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2484  exodeoxyribonuclease III (xth)  23.76 
 
 		 257 aa  61.6  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1689  exonuclease III  23.61 
 
 		 268 aa  61.6  0.00000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000145715  hitchhiker  0.000000000000014729 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1799  exodeoxyribonuclease III  29.05 
 
 		 252 aa  61.6  0.00000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.123762  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3507  exodeoxyribonuclease III Xth  24 
 
 		 252 aa  61.6  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0122233  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11640  exodeoxyribonuclease III  25.21 
 
 		 262 aa  61.6  0.00000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0194  AP endonuclease  23.6 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1460  exodeoxyribonuclease III  22.86 
 
 		 252 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000456655 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3584  exodeoxyribonuclease III  23.43 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3868  exodeoxyribonuclease III  23.43 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1258  exodeoxyribonuclease III Xth  21.85 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3750  exodeoxyribonuclease III  23.43 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000021797 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0551  exodeoxyribonuclease III  24 
 
 		 336 aa  60.5  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0151  exodeoxyribonuclease III  23.74 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0331  exodeoxyribonuclease III Xth  22.13 
 
 		 259 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4393  exodeoxyribonucleaseiii xth  22.13 
 
 		 259 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.599259  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3484  exodeoxyribonuclease III  23.14 
 
 		 252 aa  59.7  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.385947  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47361  predicted protein  24.23 
 
 		 489 aa  59.3  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0123  AP endonuclease  22.35 
 
 		 259 aa  59.3  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4586  exodeoxyribonuclease III Xth  24 
 
 		 250 aa  58.9  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000013952  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0441  exodeoxyribonuclease III (xth)  23.43 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1210  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  27.98 
 
 		 237 aa  58.2  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0491626  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0353  exodeoxyribonuclease III Xth  21.49 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.740813  normal  0.996047 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0167  exodeoxyribonuclease III  24.17 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.580227  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3242  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  23.68 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0851525 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0371  exodeoxyribonuclease III  24.17 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2780  exodeoxyribonuclease III  24.17 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2299  exodeoxyribonuclease III  24.17 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.87728  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0175  exodeoxyribonuclease III  24.17 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0186  exodeoxyribonuclease III  24.17 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2379  exodeoxyribonuclease III  24.17 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124522  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3496  exodeoxyribonuclease III  23.14 
 
 		 252 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181471  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0174  exodeoxyribonuclease III  21.61 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.100757  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0785  exodeoxyribonuclease III Xth  24 
 
 		 251 aa  57  0.0000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2271  exodeoxyribonuclease III Xth  23.48 
 
 		 252 aa  56.2  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3839  exodeoxyribonuclease III  26.67 
 
 		 252 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0157  exodeoxyribonuclease III Xth  23.82 
 
 		 258 aa  55.5  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00989742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2491  exodeoxyribonuclease III (xth)  22.68 
 
 		 257 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.510804  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3105  exodeoxyribonuclease III Xth  22.68 
 
 		 257 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0458  exodeoxyribonuclease III Xth  23.14 
 
 		 251 aa  55.1  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273086  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3121  exodeoxyribonuclease III Xth  22.68 
 
 		 257 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.918757 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3160  exodeoxyribonuclease III Xth  23.06 
 
 		 257 aa  54.7  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0485064  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3043  exodeoxyribonuclease III Xth  23.06 
 
 		 257 aa  54.7  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02934  exodeoxyribonuclease III  21.17 
 
 		 266 aa  54.7  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.636028  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6456  exodeoxyribonuclease III xth  22.55 
 
 		 257 aa  54.3  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0149  exodeoxyribonuclease III (xth)  22.83 
 
 		 258 aa  54.3  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0958  exodeoxyribonuclease III Xth  23.82 
 
 		 253 aa  53.9  0.000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1311  exodeoxyribonuclease III Xth  22.95 
 
 		 253 aa  53.5  0.000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3102  exodeoxyribonuclease III Xth  23.25 
 
 		 256 aa  53.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1377  exodeoxyribonuclease III  23.51 
 
 		 250 aa  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00689884  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1192  exodeoxyribonuclease III  23.23 
 
 		 250 aa  52.4  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0173462  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1722  exodeoxyribonuclease III  28.37 
 
 		 252 aa  52.4  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1064  exodeoxyribonuclease III  22.04 
 
 		 255 aa  52.4  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0288989 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0045  exodeoxyribonuclease III  27.44 
 
 		 252 aa  52  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0696  exodeoxyribonuclease III Xth  25.28 
 
 		 257 aa  52  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0151551  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0224  exodeoxyribonuclease III  23.46 
 
 		 259 aa  51.2  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.465844  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6423  exodeoxyribonuclease III Xth  27.4 
 
 		 301 aa  51.2  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0541  exodeoxyribonuclease III  25.93 
 
 		 254 aa  51.2  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.50716  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4271  exodeoxyribonuclease III Xth  22.22 
 
 		 256 aa  51.2  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3497  exodeoxyribonuclease III  20.68 
 
 		 254 aa  49.3  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.570342 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0233  exodeoxyribonuclease III Xth  22.99 
 
 		 267 aa  50.1  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1434  exodeoxyribonuclease III Xth  23.89 
 
 		 248 aa  49.3  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4050  exodeoxyribonuclease III Xth  22.19 
 
 		 262 aa  49.7  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000121179 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0227  exodeoxyribonuclease III Xth  22.99 
 
 		 267 aa  49.7  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3929  exodeoxyribonuclease III  21.73 
 
 		 263 aa  48.9  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0685  exodeoxyribonuclease III Xth  20.72 
 
 		 260 aa  48.5  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0110  exodeoxyribonuclease III Xth  22.6 
 
 		 259 aa  49.3  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0939885 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0107  exodeoxyribonuclease III Xth  28.44 
 
 		 247 aa  48.1  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0339  exodeoxyribonuclease III Xth  22.57 
 
 		 257 aa  48.1  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.361272  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0321  exodeoxyribonuclease III  21.88 
 
 		 257 aa  47.8  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.323864  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0167  exodeoxyribonuclease III Xth  24.25 
 
 		 319 aa  47.8  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.201775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0254  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  22.1 
 
 		 259 aa  46.6  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0216  exodeoxyribonuclease III (xth)  26.15 
 
 		 349 aa  45.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0254  exodeoxyribonuclease III  26.51 
 
 		 259 aa  45.4  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0377  exodeoxyribonuclease III Xth  21.25 
 
 		 255 aa  45.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0089  exodeoxyribonuclease III  27.49 
 
 		 252 aa  45.8  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0647861  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0277  exodeoxyribonuclease III Xth  22.44 
 
 		 267 aa  45.8  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0273673  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0305  exodeoxyribonuclease III  26.51 
 
 		 259 aa  44.7  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.859926  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0702  hypothetical protein  20.79 
 
 		 260 aa  45.1  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0684  hypothetical protein  20.79 
 
 		 260 aa  45.1  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>