263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_44149 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011671  PHATR_44149  predicted protein  100 
 
 
459 aa  922    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.104122  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50516  predicted protein  58.24 
 
 
806 aa  512  1e-144  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44889  predicted protein  36.49 
 
 
892 aa  271  1e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.423509  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0964  Na+/H+ exchanger family protein  27.44 
 
 
375 aa  97.8  3e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000622449  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1557  sodium/hydrogen exchanger  25.94 
 
 
404 aa  97.8  4e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00176225  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3217  sodium/hydrogen exchanger  26.89 
 
 
397 aa  95.9  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  25.73 
 
 
399 aa  95.9  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423497  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1633  hypothetical protein  26.18 
 
 
423 aa  94.7  3e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0764  sodium/hydrogen exchanger  27.34 
 
 
395 aa  93.6  6e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00200926  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0120  sodium/hydrogen exchanger  26.99 
 
 
385 aa  90.5  6e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  28 
 
 
386 aa  90.1  7e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1965  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.03 
 
 
418 aa  88.6  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00243073  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  23.97 
 
 
396 aa  87.8  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3964  sodium/hydrogen exchanger  25 
 
 
402 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0770173  normal  0.0859803 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3439  sodium/hydrogen exchanger  25.48 
 
 
445 aa  83.6  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  24.13 
 
 
385 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0841  sodium/hydrogen exchanger  26.05 
 
 
399 aa  81.3  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.278715 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0706  sodium/hydrogen exchanger  25.79 
 
 
404 aa  81.3  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.584868  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  25.8 
 
 
389 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3029  Sodium/hydrogen exchanger  25.38 
 
 
453 aa  80.5  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.75325  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  26.01 
 
 
375 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  24.44 
 
 
387 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  24.44 
 
 
387 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  24.2 
 
 
387 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  25.76 
 
 
375 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  24.2 
 
 
387 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2265  sodium/hydrogen exchanger  25.6 
 
 
400 aa  79  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000115576 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  25.76 
 
 
375 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  24.2 
 
 
387 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  25.76 
 
 
375 aa  79  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  25.76 
 
 
375 aa  79  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  25.76 
 
 
375 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  25.76 
 
 
375 aa  79  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  24.38 
 
 
387 aa  79  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0255  sodium/hydrogen exchanger  26.49 
 
 
398 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79751  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  24.2 
 
 
387 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2186  Na+/H+ antiporter  23.95 
 
 
379 aa  79  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0326583  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  24.2 
 
 
387 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  23.37 
 
 
387 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  24.2 
 
 
387 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  25.51 
 
 
375 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0227  Na/H antiporter (napA)  25.53 
 
 
399 aa  77  0.0000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.751994  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0581  sodium/hydrogen exchanger  24.77 
 
 
416 aa  77  0.0000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1335  sodium/hydrogen exchanger  24.1 
 
 
482 aa  76.3  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4724  sodium/hydrogen exchanger  26.88 
 
 
473 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1868  sodium/hydrogen exchanger  23.25 
 
 
469 aa  73.6  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1937  sodium/hydrogen exchanger  21.38 
 
 
412 aa  72.8  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1631  sodium/hydrogen exchanger  25.17 
 
 
474 aa  72.8  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.599529 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1412  sodium/hydrogen exchanger  23.25 
 
 
395 aa  70.9  0.00000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.179509 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1355  Kef-type K+ transport system, membrane component  22.43 
 
 
352 aa  70.5  0.00000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.495043  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2633  Na(+)/H(+) antiporter  23.96 
 
 
414 aa  69.3  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1178  putative potassium efflux transporter  24.17 
 
 
650 aa  69.7  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0910  germination protein gerN  25.76 
 
 
375 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0715  Na+/H+ antiporter (NapA)  25.76 
 
 
375 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4159  sodium/hydrogen exchanger  22.54 
 
 
446 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.286241 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0984  germination protein gerN  25.76 
 
 
375 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1627  sodium/hydrogen exchanger family protein  22.7 
 
 
567 aa  67.4  0.0000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.510205  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1464  Sodium/hydrogen exchanger  27.93 
 
 
485 aa  67.4  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000329156  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1107  sodium/hydrogen exchanger  24.15 
 
 
775 aa  67  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112633  normal  0.12903 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0821  Na+/H+ antiporter  21.65 
 
 
741 aa  67  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0612935  normal  0.436267 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2967  sodium/hydrogen exchanger  26.52 
 
 
762 aa  67  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.619834 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1175  Na+/H+ antiporter  25.83 
 
 
457 aa  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20501  CPA2 family Na+/H+ antiporter  25.83 
 
 
457 aa  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0786073  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2594  sodium/hydrogen exchanger  24.24 
 
 
491 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.131358  normal  0.15214 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1509  sodium/hydrogen exchanger  22.91 
 
 
567 aa  65.1  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2667  sodium/hydrogen exchanger  22.12 
 
 
435 aa  65.1  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0839  hypothetical protein  26.43 
 
 
479 aa  64.7  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3668  Sodium/hydrogen exchanger  24.52 
 
 
415 aa  64.7  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0608  sodium/hydrogen exchanger  24.63 
 
 
467 aa  64.3  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0668  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  25.06 
 
 
584 aa  63.9  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.457032  normal  0.0419012 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0593  sodium/hydrogen exchanger  24.63 
 
 
467 aa  64.3  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0868  hypothetical protein  26.43 
 
 
479 aa  63.5  0.000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17221  CPA2 family Na+/H+ antiporter  25 
 
 
457 aa  63.5  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.597221 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0655  sodium/hydrogen exchanger  24.34 
 
 
424 aa  63.5  0.000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5016  sodium/hydrogen exchanger  23.18 
 
 
745 aa  62.8  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1320  sodium/hydrogen exchanger  23.6 
 
 
382 aa  62.8  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1468  potassium efflux system protein  26.07 
 
 
648 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2884  potassium efflux system protein  26.07 
 
 
648 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  normal  0.0157932 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A26  Kef-type K+ transport systems, membrane component  30.29 
 
 
320 aa  62.4  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1463  potassium efflux system protein  26.07 
 
 
648 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_628  Kef-type K+ transport systems membrane component  24.17 
 
 
424 aa  62  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1372  sodium/hydrogen exchanger  23.57 
 
 
567 aa  61.6  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2797  potassium efflux system protein  26.25 
 
 
648 aa  61.6  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3520  Na+/H+-exchanging protein (Na+/H+ antiporter)  23.45 
 
 
764 aa  61.2  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2359  Na+/H+ antiporter  26.87 
 
 
460 aa  60.5  0.00000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.484387  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0722  sodium/hydrogen exchanger family protein  22.76 
 
 
427 aa  60.5  0.00000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.313467  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4597  sodium/hydrogen exchanger  27.01 
 
 
777 aa  60.5  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1991  sodium/hydrogen exchanger  23.43 
 
 
666 aa  60.1  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000714201 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1420  sodium/hydrogen exchanger  25 
 
 
771 aa  60.5  0.00000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1631  sodium/hydrogen exchanger  26.22 
 
 
665 aa  60.5  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5068  sodium/hydrogen exchanger family protein  23.61 
 
 
587 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1282  sodium/hydrogen exchanger  25.25 
 
 
406 aa  59.3  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0716  sodium/hydrogen exchanger  21.75 
 
 
585 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.355706  normal  0.655046 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1225  potassium efflux system protein  22.15 
 
 
642 aa  58.9  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.403013  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1130  sodium/hydrogen exchanger  21.29 
 
 
586 aa  58.5  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.496723 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5404  sodium/hydrogen exchanger  22.75 
 
 
586 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.115045 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4016  sodium/hydrogen exchanger  24.03 
 
 
775 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00920037  hitchhiker  0.000000797462 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0200  sodium/hydrogen exchanger  22.25 
 
 
389 aa  58.5  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0769976  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3853  sodium/hydrogen exchanger  23.93 
 
 
583 aa  58.2  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0995  sodium/hydrogen exchanger  24.12 
 
 
452 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>