235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_49040 on replicon NC_011688
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011688  PHATRDRAFT_49040  predicted protein  100 
 
 
248 aa  504  9.999999999999999e-143  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00913566  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2450  hypothetical protein  32.46 
 
 
199 aa  90.9  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1637  hypothetical protein  32.46 
 
 
199 aa  90.9  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2354  hypothetical protein  32.46 
 
 
199 aa  90.9  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.921184  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4187  NUDIX hydrolase  35.38 
 
 
228 aa  85.1  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351171  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1491  hypothetical protein  33.16 
 
 
192 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003157  hypothetical nudix hydrolase YeaB  34.46 
 
 
199 aa  83.6  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2018  hypothetical protein  36.26 
 
 
203 aa  83.6  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2167  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 
191 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1965  hypothetical protein  32.63 
 
 
192 aa  82.4  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.881089  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1969  hypothetical protein  32.63 
 
 
192 aa  82.4  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0521  NUDIX hydrolase  35.43 
 
 
245 aa  82  0.000000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.661222  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1306  hypothetical protein  32.63 
 
 
192 aa  81.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.185937  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49679  predicted protein  33.15 
 
 
430 aa  81.6  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.943315  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0920  MutT/nudix family protein  34.1 
 
 
204 aa  81.3  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000137822  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2026  hypothetical protein  32.63 
 
 
192 aa  81.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2225  NUDIX hydrolase  35.15 
 
 
189 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000124127  hitchhiker  0.00567873 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2382  hypothetical protein  33.16 
 
 
192 aa  80.9  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0594  NUDIX hydrolase  33.49 
 
 
228 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0812937  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1032  NUDIX hydrolase  33.49 
 
 
228 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1073  NUDIX hydrolase  33.49 
 
 
228 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.398605  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2481  NUDIX hydrolase  31.84 
 
 
195 aa  80.1  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00475153  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2230  NUDIX hydrolase  33.8 
 
 
228 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251821  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2360  NUDIX hydrolase  35.37 
 
 
189 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000190371  hitchhiker  0.00362317 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3024  NUDIX hydrolase  34.66 
 
 
198 aa  79.3  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.43822  normal  0.894324 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0949  NUDIX hydrolase  33.65 
 
 
228 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1211  NUDIX hydrolase  33.72 
 
 
231 aa  79  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0953  NUDIX hydrolase  32.84 
 
 
228 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0994513  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39620  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
200 aa  78.2  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1986  hypothetical protein  36.31 
 
 
217 aa  77.4  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3615  MutT/nudix family protein  32.75 
 
 
191 aa  77  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0808  NUDIX hydrolase  31.89 
 
 
234 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1069  NUDIX hydrolase  31.84 
 
 
213 aa  77  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2661  NUDIX hydrolase  36.78 
 
 
207 aa  76.6  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.975355  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0879  NUDIX hydrolase  31.89 
 
 
234 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.29016  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01910  hypothetical protein  31.93 
 
 
199 aa  75.9  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0696  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  31.52 
 
 
197 aa  76.3  0.0000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0239  hypothetical protein  31.03 
 
 
197 aa  75.9  0.0000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0068  NUDIX hydrolase  37.28 
 
 
194 aa  75.5  0.0000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.979316 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2083  NUDIX hydrolase  27.67 
 
 
221 aa  75.1  0.0000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1010  NUDIX hydrolase  31.61 
 
 
199 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79985  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1739  NUDIX hydrolase  33.53 
 
 
227 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881669  normal  0.05892 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1462  NUDIX hydrolase  33.53 
 
 
226 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205145  normal  0.0719668 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3375  mutT/nudix family protein  36.2 
 
 
171 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2536  NUDIX hydrolase  32.16 
 
 
226 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299915  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2642  NUDIX hydrolase  31.9 
 
 
207 aa  74.3  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2126  NUDIX hydrolase  32.73 
 
 
195 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000453697  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2304  NUDIX hydrolase  32 
 
 
195 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000460151  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1378  NUDIX hydrolase  30.33 
 
 
225 aa  73.2  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.441727  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2809  hypothetical protein  32.46 
 
 
192 aa  73.6  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0459341 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3409  NUDIX hydrolase  32.76 
 
 
201 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.227802  normal  0.542448 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1364  hypothetical protein  32.96 
 
 
203 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0752  NUDIX hydrolase  32.51 
 
 
244 aa  73.2  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1199  NUDIX hydrolase  32.93 
 
 
178 aa  72.8  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2202  NUDIX hydrolase  32.12 
 
 
195 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000103843  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2220  MutT/nudix family protein  32.73 
 
 
195 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15860  hypothetical protein  32.4 
 
 
203 aa  72  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0480396 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1665  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  34.43 
 
 
347 aa  72  0.000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.571697  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2628  NUDIX hydrolase  33.51 
 
 
200 aa  72  0.000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.130048  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1611  NUDIX hydrolase  29.94 
 
 
207 aa  71.6  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.404735  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0367  NUDIX hydrolase  34.55 
 
 
243 aa  71.2  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0775578  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1459  NUDIX hydrolase  32.4 
 
 
227 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74222  normal  0.52562 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0599  NUDIX hydrolase  33.14 
 
 
223 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0172735  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1108  hypothetical protein  32.56 
 
 
227 aa  71.2  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2853  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  33.49 
 
 
427 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2622  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 
198 aa  71.6  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.831356  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4268  NUDIX hydrolase  31.28 
 
 
210 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127218  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0727  NUDIX hydrolase  27.86 
 
 
210 aa  70.5  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4166  NUDIX hydrolase  31.28 
 
 
199 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.383593 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1058  NUDIX hydrolase  31.28 
 
 
199 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2273  NUDIX hydrolase  30.64 
 
 
210 aa  70.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.456189 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1453  NUDIX hydrolase  31.28 
 
 
199 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.237622 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0397  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  33.02 
 
 
199 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.206725  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1929  hypothetical protein  33.93 
 
 
197 aa  70.5  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0918  NUDIX hydrolase  32 
 
 
221 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2540  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  33.64 
 
 
333 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.209584  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  33.02 
 
 
217 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  33.49 
 
 
427 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.916312  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0234  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  33.02 
 
 
217 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2963  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.16 
 
 
483 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.980156  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1554  MutT/nudix family protein  31.46 
 
 
168 aa  69.3  0.00000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.607858  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1956  NUDIX hydrolase  34.94 
 
 
200 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00026609  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1502  MutT/nudix family protein  31.46 
 
 
168 aa  69.3  0.00000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.73233  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2224  hypothetical protein  33.33 
 
 
197 aa  69.3  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888042  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2036  NUDIX hydrolase  31.74 
 
 
197 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000390793  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0464  NUDIX hydrolase  32.76 
 
 
327 aa  68.9  0.00000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0937  hypothetical protein  32.26 
 
 
202 aa  68.9  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0131467 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4290  NUDIX hydrolase  36 
 
 
300 aa  68.9  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  30.65 
 
 
267 aa  68.9  0.00000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1273  NUDIX hydrolase  30.46 
 
 
198 aa  68.6  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00778  MutT/nudix family protein  33.15 
 
 
285 aa  68.6  0.00000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.025286  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1464  mutT/nudix family protein  30.46 
 
 
198 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2790  NUDIX hydrolase  29.21 
 
 
216 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.235631 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1010  hypothetical protein  33.51 
 
 
238 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.410062  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2111  NUDIX hydrolase  31.79 
 
 
194 aa  68.6  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.108274  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36090  ADP-ribose pyrophosphatase  34.64 
 
 
229 aa  68.2  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.453332  normal  0.430111 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3351  NUDIX hydrolase  31.79 
 
 
244 aa  67.8  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.162982 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01947  NTP pyrophosphohydrolase, NUDIX family protein  31.61 
 
 
190 aa  68.6  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00222276  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1568  NUDIX hydrolase  28.71 
 
 
246 aa  68.2  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0325  NUDIX hydrolase  32.42 
 
 
278 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.760343  normal  0.0266533 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>