59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_43557 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_43557  predicted protein  100 
 
 
418 aa  874    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48473  predicted protein  36.51 
 
 
343 aa  103  5e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1970  JmjC domain-containing protein  25.93 
 
 
263 aa  96.7  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2065  JmjC domain-containing protein  25.93 
 
 
263 aa  96.3  9e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0481  JmjC domain-containing protein  25.93 
 
 
263 aa  96.3  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0632946  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0793  JmjC domain-containing protein  26.18 
 
 
263 aa  92.4  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.972855  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1617  JmjC domain-containing protein  26.18 
 
 
263 aa  92.4  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148097  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0664  JmjC domain-containing protein  26.18 
 
 
263 aa  92.4  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.544453  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0552  JmjC domain-containing protein  26.18 
 
 
263 aa  92.4  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46234  predicted protein  27.18 
 
 
535 aa  79.7  0.00000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12370  predicted protein  26.18 
 
 
308 aa  79.7  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0113  transcription factor jumonji domain-containing protein  25.58 
 
 
332 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_3251  predicted protein  28.75 
 
 
294 aa  72  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4326  hypothetical protein  25.18 
 
 
338 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42117  predicted protein  22.15 
 
 
446 aa  66.6  0.0000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0484588  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3091  hypothetical protein  23.51 
 
 
291 aa  65.1  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.855499  normal  0.0356785 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1400  Pass1-related protein  25.78 
 
 
317 aa  64.3  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012865 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_35989  predicted protein  30.28 
 
 
434 aa  64.3  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4653  transcription factor jumonji jmjC domain protein  24.9 
 
 
284 aa  60.8  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.538116  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1814  hypothetical protein  26.54 
 
 
353 aa  60.1  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00210  conserved hypothetical protein  32.5 
 
 
189 aa  60.1  0.00000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.154915  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27446  predicted protein  23.42 
 
 
175 aa  58.5  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0257366 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18023  predicted protein  26.19 
 
 
369 aa  58.5  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.150148 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0394  transcription factor jumonji jmjC domain protein  25.09 
 
 
338 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5761  transcription factor jumonji jmjC domain protein  23.05 
 
 
267 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1301  Transcription factor jumonji  24.38 
 
 
402 aa  58.5  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140521  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02690  hypothetical protein  22.46 
 
 
294 aa  57.8  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03820  jmjC domain protein  23.51 
 
 
292 aa  58.2  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0373  hypothetical protein  21.18 
 
 
293 aa  57  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.816568  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02201  pass1 domain protein  25.82 
 
 
348 aa  53.5  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1563  JmjC domain-containing protein  23.17 
 
 
353 aa  53.5  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100796  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0224  JmjC domain-containing protein  23.17 
 
 
353 aa  53.5  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000739958  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1121  JmjC domain-containing protein  23.17 
 
 
353 aa  53.5  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000573239  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2148  JmjC domain-containing protein  23.46 
 
 
353 aa  53.1  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000110668  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37877  predicted protein  29.1 
 
 
297 aa  53.5  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.11402  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1992  JmjC domain-containing protein  23.87 
 
 
294 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.926976  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2012  JmjC domain-containing protein  23.87 
 
 
294 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_93634  predicted protein  20.44 
 
 
390 aa  52  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.38611 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3788  transcription factor jumonji domain-containing protein  26.45 
 
 
373 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_94145  predicted protein  20.44 
 
 
390 aa  52  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.899181  hitchhiker  0.0031942 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0936  JmjC domain-containing protein  23.46 
 
 
294 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0374685  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33787  predicted protein  23.73 
 
 
586 aa  49.7  0.00009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.715519  normal  0.121325 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1843  transcription factor jumonji, jmjC  30.4 
 
 
376 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.413035  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25410  JmjC-domain protein  29.27 
 
 
375 aa  47.4  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2881  amidohydrolase  23.68 
 
 
819 aa  47  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42595  predicted protein  23.65 
 
 
476 aa  46.2  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1641  transcription factor jumonji  30.36 
 
 
373 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3547  transcription factor jumonji domain-containing protein  30.95 
 
 
376 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.717668  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2409  hypothetical protein  28.89 
 
 
344 aa  44.7  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110953  normal  0.355489 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3735  PASS1 domain-containing protein  33.7 
 
 
335 aa  45.1  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1177  transcription factor jumonji domain-containing protein  27.2 
 
 
339 aa  44.7  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02933  F-box and JmjC domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08170)  24.49 
 
 
384 aa  44.7  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.89532 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0372  hypothetical protein  20.53 
 
 
293 aa  44.7  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07455  JmjC domain-containing histone demethylation protein 1 (EC 1.14.11.27)([Histone-H3]-lysine-36 demethylase 1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AW75]  30.33 
 
 
1407 aa  44.3  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.196095 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4288  transcription factor jumonji/aspartyl beta-hydroxylase  29.13 
 
 
343 aa  44.3  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34749  predicted protein  33.78 
 
 
373 aa  43.9  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.533757  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1122  transcription factor jumonji domain-containing protein  26.4 
 
 
339 aa  43.9  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31860  predicted protein  27.08 
 
 
136 aa  43.9  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.841856 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1845  transcription factor jumonji domain-containing protein  29.67 
 
 
334 aa  43.1  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0719587  normal  0.0313082 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>