More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_27361 on replicon NC_011676
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011676  PHATRDRAFT_27361  predicted protein  100 
 
 		 655 aa  1344    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.114186  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0388  sugar transporter  32.71 
 
 		 472 aa  232  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.535327 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00880  ITR1, putative  31.71 
 
 		 567 aa  227  5.0000000000000005e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0105126  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04316  MFS myo-inositol transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06080)  31.06 
 
 		 517 aa  219  2e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.38765  normal  0.214777 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  30.34 
 
 		 492 aa  216  8e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2754  sugar transporter  31.57 
 
 		 497 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3294  sugar transporter  30.84 
 
 		 471 aa  214  2.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.534261 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3247  L-arabinose/proton symport protein  31.48 
 
 		 472 aa  214  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138124 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3166  L-arabinose/proton symport protein  31.48 
 
 		 472 aa  214  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3184  L-arabinose/proton symport protein  31.48 
 
 		 472 aa  214  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3348  L-arabinose/proton symport protein  31.48 
 
 		 472 aa  214  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3232  L-arabinose/proton symport protein  31.48 
 
 		 472 aa  214  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852071  hitchhiker  0.0000142975 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  39.26 
 
 		 477 aa  213  7e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02650  hypothetical protein  30.9 
 
 		 472 aa  213  7.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02689  arabinose transporter  30.9 
 
 		 472 aa  213  7.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3162  arabinose-proton symporter  31.49 
 
 		 472 aa  212  1e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.839771  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0874  sugar transporter  31.49 
 
 		 472 aa  213  1e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2988  arabinose-proton symporter  31.49 
 
 		 472 aa  212  1e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.993393  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0849  sugar transporter  31.49 
 
 		 472 aa  212  1e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3021  arabinose-proton symporter  31.49 
 
 		 472 aa  213  1e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2989  arabinose-proton symporter  31.49 
 
 		 472 aa  212  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0609314 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4110  arabinose-proton symporter  31.3 
 
 		 472 aa  210  7e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000412167 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  40.31 
 
 		 480 aa  209  1e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0710  sugar transporter  36.61 
 
 		 476 aa  206  8e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.148606 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0295  metabolite transport protein  29.79 
 
 		 482 aa  205  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80454  myo-inositol transporter  27.61 
 
 		 522 aa  203  7e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.806803  normal  0.231524 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03420  myo-inositol transporter 1, putative  27.56 
 
 		 587 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0827  sugar transporter  27.85 
 
 		 450 aa  200  7e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03060  myo-inositol transporter, putative  27.76 
 
 		 567 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0468  sugar transporter  42.06 
 
 		 447 aa  197  5.000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3612  sugar transporter  37.5 
 
 		 475 aa  194  4e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3220  sugar transporter  40.51 
 
 		 468 aa  192  1e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.681904 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7188  sugar transporter  27.2 
 
 		 438 aa  192  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0959  sugar transporter  36.12 
 
 		 472 aa  192  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1160  sugar transporter  34.91 
 
 		 468 aa  192  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0565582  hitchhiker  0.000112742 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00990  myo-inositol transporter 2, putative  27.75 
 
 		 590 aa  189  2e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1578  sugar transporter  29.07 
 
 		 466 aa  189  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5665  sugar transporter  28.1 
 
 		 471 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.600192 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3729  sugar transporter  28.1 
 
 		 471 aa  188  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4639  sugar transporter  28.1 
 
 		 471 aa  188  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4061  sugar transporter  36.45 
 
 		 490 aa  188  3e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3108  sugar transporter  35 
 
 		 480 aa  186  8e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.934005  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00450  myo-inositol transporter 1, putative  27.12 
 
 		 586 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0118  sugar transporter  34.94 
 
 		 480 aa  186  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03799  MFS transporter  28.28 
 
 		 524 aa  186  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3347  sugar transporter  35.94 
 
 		 465 aa  184  6e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0767559  decreased coverage  0.00268397 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0944  sugar transporter  33.33 
 
 		 480 aa  183  8.000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36280  MFS transporter, sugar porter family  36.53 
 
 		 468 aa  182  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3434  galactose-proton symporter  35.62 
 
 		 464 aa  180  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.444066  normal  0.014218 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3338  galactose-proton symporter  35.62 
 
 		 464 aa  180  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0071419  normal  0.395807 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3330  galactose-proton symporter  35.62 
 
 		 464 aa  180  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00323998  normal  0.618679 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3265  galactose-proton symporter  35.62 
 
 		 464 aa  180  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0111445  normal  0.101317 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3254  galactose-proton symporter  35.62 
 
 		 464 aa  180  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000516746  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0752  sugar transporter  36.51 
 
 		 464 aa  180  9e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.718529  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4246  galactose-proton symporter  36.66 
 
 		 464 aa  179  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.487781  normal  0.587718 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3085  galactose-proton symporter  36.66 
 
 		 464 aa  179  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0156709  hitchhiker  0.000187462 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3286  galactose-proton symporter  36.66 
 
 		 464 aa  179  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.583808  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02736  hypothetical protein  36.66 
 
 		 464 aa  179  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.39424  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3375  galactose-proton symporter  36.66 
 
 		 464 aa  179  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0771  sugar transporter  36.66 
 
 		 464 aa  179  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00259481  hitchhiker  0.000457793 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02773  D-galactose transporter  36.66 
 
 		 464 aa  179  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3101  galactose-proton symporter  36.66 
 
 		 464 aa  179  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0900  sugar transporter  29.16 
 
 		 518 aa  178  3e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0183  sugar transporter  33.33 
 
 		 474 aa  177  4e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1970  sugar transporter  28.1 
 
 		 529 aa  177  5e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.460324  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00070  myo-inositol transporter, putative  27.09 
 
 		 590 aa  177  6e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2820  sugar transporter  28.86 
 
 		 544 aa  177  8e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0133634 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2334  major facilitator superfamily protein  34.38 
 
 		 446 aa  176  9.999999999999999e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0757  sugar transporter  27.95 
 
 		 448 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1682  D-xylose proton-symporter  33.33 
 
 		 458 aa  175  1.9999999999999998e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000961132  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3868  sugar transporter  34.38 
 
 		 450 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0456  D-xylose-proton symporter  38.46 
 
 		 463 aa  174  3.9999999999999995e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2094  sugar transporter  30.48 
 
 		 487 aa  173  7.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0241306  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8679  sugar transporter  31.01 
 
 		 533 aa  172  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.546222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4212  sugar transporter  31.36 
 
 		 477 aa  172  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0478  D-xylose proton-symporter  32.02 
 
 		 480 aa  172  2e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03090  sugar transporter, putative  23.63 
 
 		 579 aa  171  5e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1953  sugar transporter  34.11 
 
 		 452 aa  171  5e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.288052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2312  sugar transporter family protein  34.11 
 
 		 452 aa  171  5e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.588743  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1731  D-xylose-proton symporter  38.15 
 
 		 463 aa  170  6e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0128  D-xylose proton-symporter  34.7 
 
 		 484 aa  169  1e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0489745  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00600  MFS transporter, sugar porter family  26.58 
 
 		 499 aa  169  2e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0105  sugar transporter  35.12 
 
 		 482 aa  168  2.9999999999999998e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02465  hypothetical protein  33.33 
 
 		 792 aa  168  2.9999999999999998e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08912  myo-inositol transporter (AFU_orthologue; AFUA_2G07910)  32.13 
 
 		 528 aa  167  4e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41890  MFS family sugar transporter  34.8 
 
 		 449 aa  167  5e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0479  sugar transporter  28.63 
 
 		 471 aa  166  1.0000000000000001e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749242  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4699  sugar transporter  30.51 
 
 		 477 aa  166  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1394  sugar transporter  35.37 
 
 		 452 aa  165  2.0000000000000002e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3340  sugar transporter  27.29 
 
 		 504 aa  165  3e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.652825  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1773  sugar transporter  33.96 
 
 		 491 aa  164  6e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08400  MFS sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06730)  25.16 
 
 		 561 aa  163  8.000000000000001e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3592  sugar transporter  32.6 
 
 		 442 aa  163  8.000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369851  hitchhiker  0.00000823269 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2486  sugar transporter  32.92 
 
 		 509 aa  162  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.625827 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4020  sugar transporter  25.77 
 
 		 480 aa  161  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.997993 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2109  sugar transporter  28.84 
 
 		 475 aa  160  6e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.197372  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND00020  myo-inositol transporter, putative  28.78 
 
 		 545 aa  160  6e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4483  sugar transporter  28.97 
 
 		 474 aa  160  7e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125142  normal  0.0950882 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1014  sugar transporter  33.74 
 
 		 480 aa  159  1e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.920138  normal  0.0129071 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3727  sugar transporter  25.34 
 
 		 466 aa  159  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>