76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5733 on replicon NC_011738
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011738  PCC7424_5733  Phycobilisome protein  100 
 
 		 184 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1903  C-phycoerythrin class I beta chain  77.72 
 
 		 184 aa  300  1e-80  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0426  C-phycoerythrin class I beta chain  76.63 
 
 		 184 aa  294  4e-79  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0541832 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0998  phycobilisome protein  79.35 
 
 		 177 aa  286  1e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4516  Phycobilisome protein  71.51 
 
 		 184 aa  259  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.667174  normal  0.759424 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0435  C-phycoerythrin class II beta chain  70.65 
 
 		 193 aa  249  1e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.630208 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22381  phycobilisome protein (phycoerythrin beta-subunit)  66.85 
 
 		 181 aa  246  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03321  phycobilisome protein  65.78 
 
 		 182 aa  246  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.992978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1893  C-phycoerythrin class II beta chain  67.93 
 
 		 178 aa  244  6e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0997  phycobilisome protein  73.29 
 
 		 179 aa  235  3e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1671  phycoerythrin class III beta chain CpeB  63.59 
 
 		 182 aa  231  4.0000000000000004e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.981553  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03851  phycobilisome protein  63.04 
 
 		 182 aa  229  2e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.387439  normal  0.0394667 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0984  phycobilisome protein  65.59 
 
 		 179 aa  227  7e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.414721 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0161  phycocyanin, beta subunit  51.09 
 
 		 172 aa  183  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0157143 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1052  phycocyanin, beta subunit  51.37 
 
 		 173 aa  180  1e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0614393 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1047  phycocyanin, beta subunit  51.37 
 
 		 173 aa  180  1e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.264942 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3489  phycocyanin subunit beta  53.55 
 
 		 173 aa  179  2e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.132274  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3046  phycocyanin, beta subunit  51.09 
 
 		 172 aa  177  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.241036 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3074  phycocyanin, beta subunit  51.09 
 
 		 172 aa  177  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2930  phycocyanin, beta subunit  53.85 
 
 		 173 aa  173  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5049  phycocyanin, beta subunit  51.63 
 
 		 172 aa  168  5e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1697  phycocyanin, beta subunit  50.54 
 
 		 172 aa  167  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0569102 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2871  phycocyanin, beta subunit  47.83 
 
 		 173 aa  166  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.001828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0421  phycocyanin, beta subunit  45.65 
 
 		 172 aa  162  2.0000000000000002e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.444551  normal  0.0102401 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1908  phycocyanin, beta subunit  45.11 
 
 		 172 aa  161  6e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2925  phycobilisome protein  49.18 
 
 		 172 aa  158  4e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.743765 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0297  phycocyanin  45.11 
 
 		 172 aa  150  1e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0307  phycobilisome protein  37.5 
 
 		 170 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03391  phycobilisome protein  36.57 
 
 		 175 aa  125  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.0000255558  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03291  phycobilisome protein  36.52 
 
 		 170 aa  124  7e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.107575  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03301  phycobilisome protein  37.65 
 
 		 170 aa  120  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0424688  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2635  allophycocyanin, beta subunit  42.25 
 
 		 161 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.872532 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2433  allophycocyanin subunit beta  43.66 
 
 		 161 aa  116  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4995  allophycocyanin, beta subunit  43.07 
 
 		 161 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2787  allophycocyanin, beta subunit  41.55 
 
 		 161 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3314  allophycocyanin, beta subunit  41.55 
 
 		 161 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252863  normal  0.514162 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1838  allophycocyanin, beta subunit  50.45 
 
 		 169 aa  111  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0478  allophycocyanin subunit beta  43.07 
 
 		 162 aa  111  6e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2198  allophycocyanin, beta subunit  43.07 
 
 		 162 aa  110  8.000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.209436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2622  allophycocyanin subunit beta  42.96 
 
 		 162 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000519152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3649  allophycocyanin, beta subunit  40.85 
 
 		 161 aa  108  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.29697 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0326  allophycocyanin, beta subunit  40.14 
 
 		 161 aa  108  5e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3714  allophycocyanin subunit beta  45.69 
 
 		 169 aa  105  5e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3835  allophycocyanin, beta subunit  39.42 
 
 		 169 aa  103  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.946215 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0836  allophycocyanin, beta subunit  38.41 
 
 		 169 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0807  allophycocyanin, beta subunit  38.41 
 
 		 169 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2158  allophycocyanin, beta subunit  43.61 
 
 		 169 aa  100  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.117543 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0146  allophycocyanin subunit beta  46.22 
 
 		 169 aa  97.4  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1264  phycobilisome core component-allophycocyanin beta-18 subunit  38.74 
 
 		 174 aa  92.4  3e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2202  allophycocyanin, beta subunit  43.22 
 
 		 169 aa  90.5  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000292042 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2432  phycocyanin  29.21 
 
 		 161 aa  89.7  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0479  allophycocyanin alpha chain  30.17 
 
 		 161 aa  89  3e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.699944  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1206  phycobilisome core component-allophycocyanin beta-18 subunit  38.89 
 
 		 174 aa  89  3e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.74383 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0327  allophycocyanin alpha chain  30.17 
 
 		 161 aa  88.2  6e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.858451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2197  allophycocyanin alpha chain  29.05 
 
 		 161 aa  87  1e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.210931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2621  phycobilisome protein  29.05 
 
 		 161 aa  85.9  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000016384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4994  Phycobilisome protein  27.32 
 
 		 161 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1034  Phycobilisome protein  27.93 
 
 		 161 aa  82  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.347027  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1256  Phycobilisome protein  27.87 
 
 		 161 aa  82  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000277966 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3650  phycobilisome protein  26.82 
 
 		 161 aa  82.4  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1226  Phycobilisome protein  27.87 
 
 		 161 aa  82  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2634  Phycobilisome protein  27.37 
 
 		 161 aa  80.5  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.515637 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3635  phycobilisome protein  27.32 
 
 		 161 aa  79.7  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0240  hypothetical protein  29.61 
 
 		 163 aa  79.3  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.124285 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3315  Phycobilisome protein  26.82 
 
 		 161 aa  78.2  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.613477  normal  0.164166 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2786  Phycobilisome protein  26.82 
 
 		 161 aa  78.2  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1969  Phycobilisome protein  26.78 
 
 		 161 aa  77  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1133  allophycocyanin alpha-B chain  31.78 
 
 		 164 aa  77  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.562521  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3655  phycocyanin  28.99 
 
 		 161 aa  71.6  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.792917  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1341  allophycocyanin alpha-B chain  27.54 
 
 		 164 aa  70.9  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.445808 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4799  phycobilisome protein  27.81 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0384087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1880  phycobilisome polypeptide  26.21 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4519  Phycobilisome protein  20.88 
 
 		 194 aa  48.5  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0447  phycobilisome polypeptide  28.42 
 
 		 191 aa  48.5  0.00006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.231003 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5726  Phycobilisome protein  21.9 
 
 		 194 aa  48.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3240  phycobilisome protein  25 
 
 		 192 aa  44.7  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>