More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5288 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_5288  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
352 aa  733    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0483  oxidoreductase domain protein  28.89 
 
 
368 aa  133  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.264242 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4014  oxidoreductase domain protein  27.03 
 
 
680 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.876961 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3438  oxidoreductase domain protein  27.47 
 
 
363 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2855  oxidoreductase domain protein  28.45 
 
 
375 aa  102  7e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0639382  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2947  oxidoreductase domain protein  28.45 
 
 
375 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.59536  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0315  oxidoreductase domain-containing protein  28.98 
 
 
694 aa  99.4  9e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.596905  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  29.95 
 
 
349 aa  99.4  9e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2763  oxidoreductase-like  27.4 
 
 
375 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.495555  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  37.67 
 
 
347 aa  95.1  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1807  gfo/idh/mocA family protein  28.8 
 
 
347 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1960  gfo/idh/mocA family protein  28.8 
 
 
351 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.430175  normal  0.910454 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01292  predicted oxidoreductase, NADH-binding  28.8 
 
 
351 aa  89.7  7e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2331  oxidoreductase domain protein  28.8 
 
 
351 aa  89.7  7e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.318532  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1430  gfo/idh/mocA family protein  28.8 
 
 
351 aa  89.7  7e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01303  hypothetical protein  28.8 
 
 
351 aa  89.7  7e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2310  oxidoreductase domain-containing protein  28.8 
 
 
351 aa  89.7  7e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  33.77 
 
 
362 aa  89.4  9e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  29.96 
 
 
342 aa  89  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  29.59 
 
 
344 aa  88.2  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1525  gfo/idh/mocA family protein  28.8 
 
 
351 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  28.92 
 
 
355 aa  87.8  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.74 
 
 
312 aa  87  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  32.43 
 
 
377 aa  87  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1061  oxidoreductase domain-containing protein  29.21 
 
 
351 aa  87.4  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  29.73 
 
 
361 aa  87  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  28.51 
 
 
353 aa  86.3  7e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1755  oxidoreductase  35 
 
 
313 aa  86.3  7e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00757398  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  35.46 
 
 
335 aa  86.3  7e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 
345 aa  86.3  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1636  oxidoreductase domain-containing protein  32 
 
 
341 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3062  oxidoreductase-like  28.67 
 
 
343 aa  84.7  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0932673  normal  0.258269 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1596  oxidoreductase domain protein  25.07 
 
 
341 aa  85.1  0.000000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2359  dehydrogenase and related protein-like protein  25.67 
 
 
695 aa  84.3  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0324247  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  29.11 
 
 
355 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0834  oxidoreductase domain protein  31.76 
 
 
329 aa  83.6  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1937  oxidoreductase domain-containing protein  32.73 
 
 
387 aa  82.8  0.000000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  27.27 
 
 
311 aa  82.4  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3508  oxidoreductase domain-containing protein  23.82 
 
 
354 aa  82.4  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.739595 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 
667 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  27.7 
 
 
320 aa  81.6  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  25.7 
 
 
347 aa  81.3  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24600  predicted dehydrogenase  27.62 
 
 
366 aa  80.9  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.178343  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  26.33 
 
 
353 aa  81.3  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3975  oxidoreductase domain-containing protein  27.03 
 
 
361 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000585399  hitchhiker  0.00367656 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  30.1 
 
 
347 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  27.93 
 
 
350 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  28.38 
 
 
350 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  28.57 
 
 
359 aa  80.5  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1779  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 
326 aa  80.1  0.00000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1997  oxidoreductase domain protein  28.17 
 
 
344 aa  80.1  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.966673  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  26.25 
 
 
356 aa  79.7  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  25.76 
 
 
350 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  30.82 
 
 
377 aa  78.6  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  25.73 
 
 
331 aa  79  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 
366 aa  79.3  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1704  oxidoreductase domain-containing protein  31.25 
 
 
344 aa  79  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3330  oxidoreductase domain protein  27.64 
 
 
339 aa  79  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0129274  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4111  oxidoreductase-like  28.86 
 
 
360 aa  78.6  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.740502 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2159  oxidoreductase domain-containing protein  30 
 
 
351 aa  78.6  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0765  oxidoreductase domain protein  31.85 
 
 
314 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.209696  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0146  Inositol 2-dehydrogenase  26.7 
 
 
336 aa  77.8  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4818  oxidoreductase domain protein  32.14 
 
 
361 aa  77.8  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.032332  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  34.29 
 
 
310 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  27.89 
 
 
333 aa  77.4  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3328  oxidoreductase domain-containing protein  32.67 
 
 
359 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686493  normal  0.496755 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1275  hypothetical protein  24.83 
 
 
342 aa  77  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  30.43 
 
 
384 aa  77  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2763  oxidoreductase domain protein  27.56 
 
 
395 aa  77  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.403107  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  26.86 
 
 
332 aa  77  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2272  oxidoreductase domain protein  27.52 
 
 
421 aa  76.6  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.355062  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  32.03 
 
 
359 aa  76.3  0.0000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2255  oxidoreductase domain-containing protein  29.69 
 
 
349 aa  75.9  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00678448 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  32.03 
 
 
359 aa  76.3  0.0000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5181  oxidoreductase domain protein  22.57 
 
 
327 aa  75.5  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30210  oxidoreductase protein  28.36 
 
 
352 aa  75.9  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1276  hypothetical protein  25.5 
 
 
342 aa  75.9  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  29.03 
 
 
338 aa  75.5  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2911  oxidoreductase domain-containing protein  26.51 
 
 
366 aa  75.5  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0234  oxidoreductase  33.56 
 
 
335 aa  75.9  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03061  putative oxidoreductase  31.55 
 
 
334 aa  75.9  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5007  oxidoreductase domain protein  29.53 
 
 
359 aa  75.9  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  25.38 
 
 
350 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4044  oxidoreductase domain protein  24.75 
 
 
338 aa  74.7  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.568923  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5623  oxidoreductase domain protein  29.21 
 
 
458 aa  74.7  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  27.97 
 
 
385 aa  75.1  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2975  oxidoreductase domain protein  27.22 
 
 
424 aa  74.7  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1312  oxidoreductase domain-containing protein  28.52 
 
 
331 aa  74.7  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3563  oxidoreductase domain protein  27.33 
 
 
344 aa  74.3  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1611  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  29.29 
 
 
343 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0635321  hitchhiker  0.0000000369623 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05780  predicted dehydrogenase  27.78 
 
 
404 aa  73.9  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0892  oxidoreductase domain protein  31.06 
 
 
373 aa  73.6  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.359898  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4760  oxidoreductase domain protein  27.71 
 
 
341 aa  73.6  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000217366  normal  0.147401 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2267  oxidoreductase domain protein  25.5 
 
 
330 aa  73.6  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187377  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3045  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.77 
 
 
349 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.936146  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1672  putative oxidoreductase  28.97 
 
 
333 aa  73.6  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3280  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.77 
 
 
349 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1665  oxidoreductase  29.03 
 
 
371 aa  73.6  0.000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.351306 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3704  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  29.29 
 
 
343 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000343929  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3271  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  30.77 
 
 
349 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>