More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3720 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3720  50S ribosomal protein L15  100 
 
 
154 aa  312  9e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0235  50S ribosomal protein L15  77.12 
 
 
159 aa  246  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0232  50S ribosomal protein L15  77.12 
 
 
159 aa  245  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.211551 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2995  50S ribosomal protein L15  70.14 
 
 
161 aa  210  7e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.526656  normal  0.0562332 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2576  50S ribosomal protein L15  69.18 
 
 
147 aa  207  3e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2215  50S ribosomal protein L15  71.92 
 
 
147 aa  206  7e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.396292  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0708  50S ribosomal protein L15  69.86 
 
 
148 aa  186  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000739813  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1112  50S ribosomal protein L15  59.03 
 
 
150 aa  182  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19861  50S ribosomal protein L15  59.03 
 
 
150 aa  182  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.129304  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1309  50S ribosomal protein L15  66.44 
 
 
147 aa  181  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.517698  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1633  50S ribosomal protein L15  59.15 
 
 
152 aa  181  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17321  50S ribosomal protein L15  59.15 
 
 
152 aa  178  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17481  50S ribosomal protein L15  57.04 
 
 
152 aa  175  2e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16611  50S ribosomal protein L15  61.11 
 
 
155 aa  174  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.948391  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1972  50S ribosomal protein L15  61.38 
 
 
151 aa  172  1.9999999999999998e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0359  50S ribosomal protein L15  61.9 
 
 
151 aa  172  1.9999999999999998e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.209097  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23201  50S ribosomal protein L15  60.27 
 
 
185 aa  171  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17231  50S ribosomal protein L15  57.64 
 
 
152 aa  167  6e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1888  50S ribosomal protein L15  51.37 
 
 
146 aa  147  4e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2258  50S ribosomal protein L15  47.95 
 
 
146 aa  144  5e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0168117  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2299  50S ribosomal protein L15  47.95 
 
 
146 aa  144  5e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0077  50S ribosomal protein L15  49.32 
 
 
146 aa  140  5e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5176  50S ribosomal protein L15  47.95 
 
 
146 aa  137  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327341  unclonable  1.24723e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0124  50S ribosomal protein L15  47.95 
 
 
146 aa  137  4.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000767925  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0130  50S ribosomal protein L15  47.95 
 
 
146 aa  137  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.86911  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0141  50S ribosomal protein L15  47.26 
 
 
146 aa  135  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0129  50S ribosomal protein L15  47.26 
 
 
146 aa  135  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0129  50S ribosomal protein L15  47.26 
 
 
146 aa  135  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000173867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0125  50S ribosomal protein L15  47.26 
 
 
146 aa  135  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000308575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0123  50S ribosomal protein L15  47.26 
 
 
146 aa  135  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00954178  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0129  50S ribosomal protein L15  47.26 
 
 
146 aa  135  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0450407  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0160  50S ribosomal protein L15  47.26 
 
 
146 aa  135  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150646  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0150  50S ribosomal protein L15  46.58 
 
 
146 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0885  50S ribosomal protein L15  46.26 
 
 
147 aa  134  4e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.487854  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1365  ribosomal protein L15  50 
 
 
149 aa  134  4e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0025126  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2441  50S ribosomal protein L15P  52.05 
 
 
146 aa  134  5e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0123  50S ribosomal protein L15  45.89 
 
 
146 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00031572  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0126  50S ribosomal protein L15  46.58 
 
 
146 aa  133  8e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0470  50S ribosomal protein L15  47.92 
 
 
153 aa  132  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000419135  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09810  LSU ribosomal protein L15P  48.28 
 
 
149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0846946  hitchhiker  0.0000267286 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10774  predicted protein  47.5 
 
 
167 aa  131  3.9999999999999996e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00378285  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2922  50S ribosomal protein L15  51.7 
 
 
146 aa  131  3.9999999999999996e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000292378  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0493  50S ribosomal protein L15  47.22 
 
 
153 aa  130  6.999999999999999e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.600314  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0645  50S ribosomal protein L15  45.83 
 
 
148 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000111424  hitchhiker  0.000000339891 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_435  ribosomal protein L15  47.22 
 
 
153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0090931  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4933  ribosomal protein L15  45.83 
 
 
150 aa  129  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0104537  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2692  ribosomal protein L15  47.26 
 
 
147 aa  129  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0952  50S ribosomal protein L15  44.76 
 
 
146 aa  128  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376093  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0213  LSU ribosomal protein L15P  44.52 
 
 
146 aa  128  3e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261833  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0234  50S ribosomal protein L15  50 
 
 
146 aa  128  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000856605  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3309  50S ribosomal protein L15  44.76 
 
 
146 aa  128  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000932499 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0309  50S ribosomal protein L15  47.26 
 
 
146 aa  128  3e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  2.36933e-28 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2838  50S ribosomal protein L15  50.69 
 
 
148 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.190663  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0441  50S ribosomal protein L15  47.3 
 
 
147 aa  127  8.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1727  50S ribosomal protein L15  47.3 
 
 
147 aa  126  8.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0972  50S ribosomal protein L15  47.3 
 
 
147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1311  50S ribosomal protein L15  46.94 
 
 
147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000196543  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1464  50S ribosomal protein L15  45.89 
 
 
144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000860578  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1375  50S ribosomal protein L15  46.94 
 
 
147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0238101  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01350  ribosomal protein L15  51.02 
 
 
147 aa  125  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.053024  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0699  50S ribosomal protein L15  45.14 
 
 
147 aa  124  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.82238  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0720  ribosomal protein L15  46.26 
 
 
147 aa  124  5e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0777  50S ribosomal protein L15  48.63 
 
 
147 aa  124  7e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000140275  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0727  50S ribosomal protein L15  43.92 
 
 
147 aa  123  7e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0174765  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28269  Plastid ribosomal protein L15 large ribosomal subunit  46.54 
 
 
222 aa  122  1e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.445872  normal  0.307544 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3005  50S ribosomal protein L15  45.52 
 
 
170 aa  123  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.336107  hitchhiker  0.00861224 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0999  ribosomal protein L15  45.58 
 
 
148 aa  122  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0284  ribosomal protein L15  44.44 
 
 
152 aa  122  2e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000266342  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2314  ribosomal protein L15  47.95 
 
 
146 aa  122  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0114491  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0305  50S ribosomal protein L15  47.26 
 
 
146 aa  122  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00213706  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2136  50S ribosomal protein L15P  45.75 
 
 
152 aa  121  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0474039  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0581  50S ribosomal protein L15  47.26 
 
 
151 aa  121  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4302  ribosomal protein L15  47.3 
 
 
153 aa  120  5e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1505  ribosomal protein L15  46.31 
 
 
149 aa  120  6e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.628014  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0244  ribosomal protein L15  45.21 
 
 
146 aa  120  6e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0776465  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1085  50S ribosomal protein L15  43.36 
 
 
146 aa  120  6e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.165048  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0208  ribosomal protein L15  48.3 
 
 
148 aa  120  7e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0214  50S ribosomal protein L15  44.52 
 
 
144 aa  120  8e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000818631  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1812  50S ribosomal protein L15  45.21 
 
 
146 aa  118  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1555  ribosomal protein L15  48.65 
 
 
159 aa  117  4.9999999999999996e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00234278  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2695  50S ribosomal protein L15  45.58 
 
 
146 aa  117  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2380  50S ribosomal protein L15  45.58 
 
 
146 aa  117  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2182  50S ribosomal protein L15  44.67 
 
 
169 aa  117  6e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.34852 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2460  50S ribosomal protein L15  44.67 
 
 
169 aa  117  6e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.907941  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2755  50S ribosomal protein L15  45.21 
 
 
148 aa  117  7.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.203669  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0334  50S ribosomal protein L15  46 
 
 
162 aa  116  9e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379704  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1245  50S ribosomal protein L15  43.84 
 
 
144 aa  116  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0277502  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0620  ribosomal protein L15  46.58 
 
 
144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.527453  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1927  50S ribosomal protein L15  44.67 
 
 
162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3648  50S ribosomal protein L15  45.58 
 
 
146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000516585  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1659  50S ribosomal protein L15  45.33 
 
 
155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0131033  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1165  ribosomal protein L15  44.22 
 
 
148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0536923  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0272  50S ribosomal protein L15  45.83 
 
 
152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.292241  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2145  50S ribosomal protein L15  43.33 
 
 
169 aa  114  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2238  50S ribosomal protein L15  42.36 
 
 
149 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.150633  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0779  50S ribosomal protein L15  41.45 
 
 
161 aa  114  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616455  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2669  50S ribosomal protein L15P  40.79 
 
 
162 aa  114  6e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0304  50S ribosomal protein L15  41.29 
 
 
157 aa  114  6.9999999999999995e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.548938 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5143  ribosomal protein L15  43.84 
 
 
154 aa  113  7.999999999999999e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.66888 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0308  50S ribosomal protein L15  45.95 
 
 
184 aa  113  8.999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0135677  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>