40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1712 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_0527  CRISPR-associated helicase, Cyano-type  49.79 
 
 		 701 aa  659    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.277952  hitchhiker  0.00233438 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2456  CRISPR-associated helicase, Cyano-type  51.91 
 
 		 707 aa  689    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.149849 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1712  CRISPR-associated helicase, Cyano-type  100 
 
 		 726 aa  1508    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000991521 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0510  CRISPR-associated helicase, Cyano-type  49.93 
 
 		 701 aa  660    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4165  DEAD/DEAH box helicase-like  31.86 
 
 		 725 aa  263  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000750963  decreased coverage  0.0000030126 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1557  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.61 
 
 		 696 aa  105  4e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.476169  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1861  DEAD/DEAH box helicase-like  24.78 
 
 		 692 aa  99.8  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3576  CRISPR-associated helicase, Cyano-type  25.06 
 
 		 717 aa  98.6  4e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2231  helicase superfamily protein  27.32 
 
 		 778 aa  65.9  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0384  DEAD/DEAH box helicase-like  24.25 
 
 		 1531 aa  60.1  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.224382 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1247  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.61 
 
 		 743 aa  57  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000127914 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0432  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.9 
 
 		 759 aa  56.6  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0967  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  24.5 
 
 		 764 aa  55.5  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.131419  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0189  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.35 
 
 		 734 aa  54.3  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.583958  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1268  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  26.34 
 
 		 488 aa  53.9  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0968245 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1220  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.62 
 
 		 696 aa  53.9  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0444234  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2442  hypothetical protein  23.64 
 
 		 828 aa  53.5  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_840  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  24.43 
 
 		 764 aa  53.1  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1523  DEAD/DEAH box helicase domain protein  21.91 
 
 		 711 aa  52  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.723855  hitchhiker  0.0000000000000155978 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1777  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.33 
 
 		 970 aa  51.6  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14630  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.19 
 
 		 751 aa  50.8  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000706515  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0309  hypothetical protein  27.49 
 
 		 741 aa  50.4  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0192284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0858  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25 
 
 		 764 aa  50.1  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00289553  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0124  ATP-dependent DNA helicase RecG  23.73 
 
 		 692 aa  50.4  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.336008  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1130  CRISPR-associated helicase Cas3  29.46 
 
 		 484 aa  48.9  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.566475  normal  0.71889 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2808  CRISPR-associated helicase Cas3, Anaes-subtype  26.51 
 
 		 933 aa  48.5  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0224  ATP-dependent helicase  24.09 
 
 		 723 aa  48.5  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0685965  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1186  CRISPR-associated helicase Cas3  24.71 
 
 		 799 aa  48.1  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457345 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4429  DEAD/DEAH box helicase  24.48 
 
 		 740 aa  48.5  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.306961  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1323  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  21.4 
 
 		 701 aa  47  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.122817  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3123  hypothetical protein  21.69 
 
 		 843 aa  47  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.44073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0156  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  22.71 
 
 		 1476 aa  46.6  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1732  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.21 
 
 		 768 aa  46.6  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.199645  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2279  CRISPR-associated helicase Cas3  22.91 
 
 		 548 aa  46.2  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169007  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1443  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.56 
 
 		 803 aa  45.8  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111055  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0671  CRISPR-associated helicase Cas3  25.76 
 
 		 729 aa  45.1  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0936  CRISPR-associated helicase Cas3  25.33 
 
 		 881 aa  44.7  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2590  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.73 
 
 		 1672 aa  44.7  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000259422 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1525  CRISPR-associated helicase Cas3  32.26 
 
 		 582 aa  44.3  0.007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0125  CRISPR-associated helicase Cas3  22.03 
 
 		 775 aa  44.3  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>